鸡miR-17-92基因簇上游调控区功能分析
发布时间:2017-08-11 19:28
本文关键词:鸡miR-17-92基因簇上游调控区功能分析
【摘要】:miR-17-92基因簇(miR-17-92 cluster)在细胞增殖、分化、凋亡、动物发育以及肿瘤发生等过程中发挥重要作用。目前,人和小鼠等哺乳动物miR-17-92基因簇的转录调控已有深入研究,但该基因簇在鸡等鸟类中的转录调控研究还未见报道,主要原因在于鸟类miR-17-92基因簇上游的基因组序列都存在一个gap,且该基因簇启动子的位置和序列也还不清楚。为此,本研究采用染色体步移的方法获得鸡miR-17-92基因簇上游gap区序列,并采用生物信息学分析和报告基因及截短突变技术开展该gap区的功能分析。染色体步移分析发现,鸡miR-17-92基因簇上游gap区全长1704 bp,GC含量达80.11%。生物信息学分析显示,鸡miR-17-92基因簇上游gap区内1段200 bp的序列与人、牛、小鼠等9种动物miR-17-92基因簇上游序列保守性较高,且该区域为人和小鼠等哺乳动物miR-17-92基因簇宿主基因的核心启动子区。将克隆的gap区序列插入pGL3 basic荧光素酶报告基因载体,构建成启动子荧光素酶报告基因载体pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)。荧光素酶报告基因活性分析表明,p GL3-c MIR17HG(-4228/-2506)报告基因的活性是pGL3 basic空载体活性的417倍,证明所克隆的gap区片段是鸡miR-17-92基因簇宿主基因的启动子。为进一步分析该启动子的结构和功能,构建gap区片段的5'端缺失突变(缺失448 bp)和3'端缺失突变(缺失894 bp)的荧光素酶报告基因载体。与pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)相比,5'端和3'端缺失突变分别使启动子报告基因活性降低19.82%和60.14%。这些数据提示,鸡miR-17-92基因簇宿主基因启动子的重要调控区位于-3400/-2506。本研究结果为进一步开展鸡miR-17-92基因簇的转录调控奠定了基础。
【作者单位】: 农业部鸡遗传育种重点实验室;黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室;东北农业大学动物科学技术学院;
【关键词】: 鸡 miR--基因簇 启动子 转录调控
【基金】:国家自然科学基金项目(编号:31372299) 农业部产业体系项目(编号:CARS-42)资助~~
【分类号】:Q78;S831
【正文快照】: 2.黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;3.东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030mi R-17-92基因簇(mi R-17-92 cluster)在细胞增殖、分化、凋亡、动物发育以及肿瘤发生等过程中发挥重要作用。目前,人和小鼠等哺乳动物mi R-17-92基因簇的转录
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 陈清华;韩云蕾;马尧;燕永亮;平淑珍;陆伟;;生物固氮基因簇结构与进化研究进展[J];中国农业科技导报;2013年04期
2 江舸,李伟,金由辛,王德宝;水稻snoRNA47基因簇的初步鉴定[J];生物化学与生物物理学报;2002年05期
3 沈德新;核糖体核糖核酸基因簇在细菌系统分类中的研究进展[J];医学综述;2004年02期
4 张群;罗艳;张士璀;;MiR-183基因簇对动物感觉器官功能和发育及肿瘤发生的调控[J];中国生物化学与分子生物学报;2012年07期
5 张雁峰;张锐;宿兵;;MicroRNA基因簇的多样性与进化[J];中国科学(C辑:生命科学);2009年01期
6 李小慧;王凯;吴建盛;汤丽华;;miR-430基因簇的生物信息学分析[J];南京邮电大学学报(自然科学版);2014年02期
7 李华;王利娟;何t,
本文编号:657911
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/657911.html
最近更新
教材专著