两种不同生境植物棉花与雪莲CDPK1基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-08-15 03:13

  本文关键词：两种不同生境植物棉花与雪莲CDPK1基因的克隆及生物信息学分析

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【摘要】：为了研究两种不同生境植物钙依赖性蛋白激酶基因1(CDPK1)的差异,分别从冷敏感作物陆地棉和高耐寒植物天山雪莲中克隆得到GhCDPK1和SikCDPK1基因。通过生物信息学分析发现,GhCDPK1和SikCDPK1的开放阅读框长度分别为1 764 bp和1 716 bp,各编码587和571个氨基酸。蛋白质表现为弱酸性,且不稳定,亲水;二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功;无跨膜结构域和信号肽,有多个磷酸化位点,但数量存在差异;均具有典型的CDPK保守结构域。GhCDPK1和SikCDPK1氨基酸序列同源性为79.9%,二者明显的区别在于GhCDPK1含有4个EF-hand基序,但SikCDPK1只存在2个EF-hand基序。进化分析结果表明,GhCDPK1与可可CDPK1亲缘关系最近,SikCDPK1与菊花CDPK2亲缘关系最近。
【作者单位】： 石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室;
【关键词】： 钙依赖性蛋白激酶(CDPK) 生物信息学 序列分析 结构预测
【基金】：新疆生产建设兵团项目(2014CC005) 国家自然科学基金项目(31360053) 石河子大学育种专项(gxjs2014-yz04)
【分类号】：Q943.2
【正文快照】： 极端温度、干旱和土地盐渍化等逆境严重影响学院棉花研究所提供,天山雪莲(Sasussured involu-农作物的生长、发育和产量。研究作物抗性分子机crata Kar.et Kir)无菌苗由石河子大学农业生物技理,提高作物对逆境的适应性是提高农作物产量与术重点实验室保存。品质的基础。外界刺

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