马铃薯青枯菌Po82菌株质粒基因组分泌蛋白信号肽的分析

发布时间：2017-11-23 18:04

  本文关键词：马铃薯青枯菌Po82菌株质粒基因组分泌蛋白信号肽的分析

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【摘要】：应用计算机技术和生物信息学的方法,采用Signal P4.0、Lipo P1.0、Target P1.0.1、TMHMM2.0蛋白质分析软件对植物病原细菌Ralstonia solanacearum Po82质粒基因组的1680个ORFs编码的分泌蛋白信号肽氨基酸序列进行预测分析。结果表明,质粒基因组的1680个ORFs中有102个ORFs所编码的蛋白质具有N-端信号肽序列,包括85个Ⅰ型信号肽,1个Ⅱ型信号肽,15个Prepilin-like信号肽和1个细菌素和信息素信号肽,所有的分泌蛋白中具有RR-motif信号肽结构的有14个,且均为Ⅰ型信号肽。在102个具有可切割信号肽的分泌蛋白中,有50.98%的蛋白质为胞外分泌型(S型),33.33%为线粒体分泌型(M型),6.87%为叶绿体分泌型(C型),8.82%为其他类型的分泌蛋白。信号肽切割位点的氨基酸组成中非极性氨基酸为53.27%,极性氨基酸为18.79%,带负电荷的酸性氨基酸为19.12%,带正电荷的碱性氨基酸为8.82%。比较R.solanacearum GMI1000和R.solanacearum Po82质粒基因组信号肽类型的区别,发现这2种菌在信号肽类型上存在很大差异。文章通过对R.solanacearum Po82质粒基因组信号肽分泌蛋白的研究,揭示了该病原菌与寄主互作的致病机制在长期进化中的独特地位。
【作者单位】： 农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室;云南生物资源保护与利用国家重点实验室;
【基金】：公益性行业(农业)科研专项经费项目“作物细菌性病害防控技术研究与示范”(201303015)
【分类号】：S432.4
【正文快照】： 茄科雷尔氏菌[Ralstonia solanacearum(Smith)Yabuuhi et al.]是一种植物病原性细菌,该菌属于β-变形菌亚门的一类生长于土壤的革兰氏阴性细菌[1],主要分布在热带、亚热带和温带地区且寄主广泛。茄科雷尔氏菌能侵染包括茄科、豆科在内50多个科200多种作物[2],主要破坏宿主植物，

本文编号：1219326