全基因组预测希金斯炭疽菌中碳水化合物酶类蛋白

发布时间：2018-03-25 02:26

本文选题：希金斯炭疽菌　切入点：碳水化合物酶类蛋白　出处：《江苏农业科学》2017年02期

【摘要】：希金斯炭疽菌侵染菜心等十字花科植物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大的经济损失。基于前期研究结果,以658个分泌蛋白为基础序列,利用CAZymes Analysis Toolkit预测程序,分析上述蛋白中的碳水化合物酶类(CAZymes)蛋白,明确该菌中含有238个CAZymes,分为主要类别和复合类别2类,前者包括75个糖苷水解酶(GHs)、48个碳水化合物绑定结构(CBMs)、33个辅助酶类家族(AAs)、30个碳水化合物酯酶(CEs)、23个多糖裂解酶(PLs)、4个糖基转移酶(GTs),后者则包括17个GHs/CBMs、4个AAs/CBMs、4个CEs/CBMs等。研究结果可为深入开展该病菌侵染植物作用机制的研究提供一定的理论基础。
[Abstract]:The anthracnose caused by Higgins anthracnose infecting Brassica rapae and other cruciferous plants has caused enormous economic losses to agricultural production in various countries. Based on the previous research results, the CAZymes Analysis Toolkit program was used to predict 658 secretory proteins. The carbohydrate enzymes (CAZymeses) proteins in the above proteins were analyzed, and the results showed that the bacteria contained 238 CAZymes, which were divided into two categories: main and compound groups. The former consists of 75 glycoside hydrolases, 48 carbohydrate binding structures, 33 coenzyme families, 30 carbohydrate esterases, 23 polysaccharides lyase, and 4 glycosyltransferases, while the latter includes 17 GHs / CBMs, 4 AAS / CBMs, 4 CEs/CBMs and so on. The results may provide a theoretical basis for further study on the mechanism of the pathogen infecting plants.
【作者单位】：西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金(编号:31560211) 云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金(编号:ZK150004) 云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(编号:50097505) 云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队(编号:2014015)
【分类号】：S432.44

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