施用微生物有机肥对连作作物产量品质的影响
【学位授予单位】:山西农业大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S141
【图文】:
2.2.2原始测序数据的质量控制逡逑剔除疑问序列、低质量序列和嵌合休序列后,对每个样本的高质量序列数进行统计,逡逑结果如图2-2所示。由图中可以看出,经过质量控制后,所有样本中的高质量序列长度逡逑都集中在230bp左右,完全符合实验预期,可进行可操作分类单元的划分。逡逑-21邋-逡逑
逦I邋*>0逡逑ot邋:i?S5<3\ie!ncrc!邋{>逡逑图2-2局质量序列长度分布逡逑Fig.邋2-2邋The邋length邋distribution邋of邋high邋quality邋sequence逡逑2.2.3可j~作分类单元聚类与物种分类分析逡逑利用Q1IME软件和UCLUST序列比对软件,对混池中相似度高于97%的序列进逡逑行OTU的归并划分,将丰度值低于全体样本测序总量0.001%邋(十万分之一)的OTU逡逑去除(Bokulich邋et邋al.,2013),并将去除了稀有0TU的此丰度矩阵用于后续的一系列分析。逡逑9个样品中,细菌16SrRNA序列总数为436邋187邋(45邋603-64320)。根据获得的OTU丰逡逑度矩阵,使用R软件计算各样本组共有OTU的数量,将样本按年限分组并通过Venn逡逑图(图2-3)呈现不同年限中共有和独有的OTU。逡逑2014逦'逦2015逡逑1057逡逑1803逦1701逡逑44S逦298逡逑1349逡逑2016逡逑图2-3样本共有OTU的Venn图逡逑Fig.邋2-3邋Venn邋map邋of邋samples邋comm
9个样品中,细菌16SrRNA序列总数为436邋187邋(45邋603-64320)。根据获得的OTU丰逡逑度矩阵,使用R软件计算各样本组共有OTU的数量,将样本按年限分组并通过Venn逡逑图(图2-3)呈现不同年限中共有和独有的OTU。逡逑2014逦'逦2015逡逑1057逡逑1803逦1701逡逑44S逦298逡逑1349逡逑2016逡逑图2-3样本共有OTU的Venn图逡逑Fig.邋2-3邋Venn邋map邋of邋samples邋common邋sequences逡逑-22邋-逡逑
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本文编号:2763422
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