基于高通量测序的少孢节丛孢转录组分析

发布时间：2020-12-16 16:57

　　少孢节丛孢是一种典型的食线虫真菌,在无线虫的环境条件下营腐生生活,但在受到线虫诱导后,少孢节丛孢能够形成三维粘性菌网捕食线虫。形成捕食器官也是少孢节丛孢从腐生生活方式转化为寄生生活方式的重要标志。本研究利用线虫提取液诱导少孢节丛孢,并选择其形成捕食器官的三个关键时间节点进行转录组分析,这三个时间点包括0h、诱导前期10h以及诱导后期48h。通过对测序结果的系统生物学分析,研究少孢节丛孢在捕食器官形成过程中基因表达的变化,探索少孢节丛孢生活史转化的表达调控机理。研究结果显示,在0h到10h的诱导前期,共有941个基因表现出显著的表达差异,其中表现为上调的基因数量是496个,表现为下调的基因数量为445个;在10h到48h的诱导后期,发生显著性差异表达的基因数量为824个,其中有459个为上调基因,365个为下调基因;在0h到48h整个诱导过程中则有326个基因表现出了显著性差异表达的现象,其中192个表现出上调的现象,134个则表现为下调。在这三种情况下都表现为上调的基因有17个,分别是:ao0300022、ao0300211、ao0301042、ao0301264、ao0302655、... 

【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

转录组测序流程

不同时间段下少孢节丛孢的形态学变化

三个时间段上调差异基因

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：2920477