spoT介导的严谨反应对防御假单胞菌SN15-2生物膜形成、抗逆性和群体感应的影响
发布时间：2021-04-09 05:54
防御假单胞菌（Pseudomonas protegens）是一种具备生防功能的环境微生物,其宿主种类多样,普遍存在于土壤、植物、水体等自然环境中。防御假单胞菌SN15-2通过分泌多种类抗生素来抑制病原菌的生长,根际高效定殖能力和分泌噬铁素的功能也是该菌发挥生防能力的重要原因。但是SN15-2在实际应用中的瓶颈问题是抗逆境能力差,高温条件下容易失活,且制剂货架期短。目前对SN15-2面对逆境环境的调控机理研究较少,因此探索防御假单胞菌面对逆境时的调节机制具有重要的学术价值和现实意义。本研究对SN15-2进行全基因组测序和分析,发现该菌含有6433个蛋白编码基因（占全基因组的88.31%）,208种非编码RNA,tRNA有71个,16条微卫星DNA和14条CRISPR序列。防御假单胞菌SN15-2基因组的6433个蛋白编码基因中,分别有5210、3259、5277个基因在COG、KEGG、GO数据库中得到注释。通过建立蛋白进化发育树发现SN15-2中的SpoT蛋白中存在多个保守的氨基酸序列,这几个保守残基在很大程度上影响蛋白酶的活性。SpoT蛋白与荧光假单胞菌和铜绿假单胞菌中的同源蛋白之间...
【文章来源】：华东理工大学上海市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
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本文编号：3127048
【文章来源】：华东理工大学上海市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．３?（ｐ）ｐｐＧｐｐ的分子结构１４７１??Ｆｉ１．３?Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆＧ
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