基于高通量测序的几种不同作物根际土壤细菌群落结构和多样性分析

发布时间：2021-06-13 14:15

　　宁夏扬黄灌区作物种类单一,在生产中需要配置不同种类的作物以增加其生物多样性。为了探明不同作物对农田土壤细菌群落结构和多样性的影响,本研究以谷子（Setaria italica）、黑豆（Glycine max）、藜麦（Chenopodium quinoa）及休闲地土壤为对象,测定了土壤pH、全氮、有机质、速效钾、速效磷和碱解氮的含量,在此基础上,利用Illumina MiSeq高通量测序技术对比研究了其中的细菌群落结构。结果表明:种植藜麦后土壤有机质、碱解氮、速效钾和速效磷的含量均升高,分别比休闲地高出2.88%、19.12%、112.04%和39.90%,但pH值降低的最少,为0.01。5组土壤样品中共得到908 120条有效序列,从不同土壤样品中,获得了4 623～5 394种细菌分类操作单元OTU,共涵盖了31门、92纲、130目、217科和363属的细菌。菌群分类发现,变形菌门（Protrobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）和放线菌门（Actinobacteria）是主要的细菌类群,相对丰度占群落的55%～75%;不同作物根际土壤优势菌属也存在差异。与休闲地相... 

【文章来源】：农业生物技术学报. 2020,28(08)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

共有OTU的维恩图

不同作物根际土壤细菌β多样性的主坐标分析(PCA)三维(A)和二维(B)图

在属分类水平，各处理土壤细菌相对丰度排序前14的细菌属分布见图4。各处理的优势细菌属(相对丰度>1%)不同，具体表现为：休闲(C)处理的优势细菌属有链球菌属(Streptococcus,8.27%)、幽门螺杆菌(Helicobacter,4.17%)、假单胞菌属(Pseudomonas,3.51%)、Prevotella＿7 (3.03%)、玫瑰弯菌属(Roseiflexus,1.98%)和放线菌属(Actinomyces,1.52%)；黑豆处理土壤的优势细菌属与休闲处理相似，而藜麦和谷子处理与休闲处理的差异较大。藜麦和谷子处理的优势细菌属有鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、玫瑰弯菌属(Roseiflexus)、Sker-manella和丰祐菌属(Opitutus)。此外研究发现，藜麦和谷子处理中未检测出Streptococcus、Helicobacter、Prevotella＿7和Actinomyces，这些菌属仅在休闲和黑豆处理中出现。图2 共有OTU的维恩图

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3227687