基于土壤宏基因组的新颖木聚糖酶基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2021-06-16 14:35

　　土壤微生物总DNA经试剂盒提取,使用CODEHOP引物进行木聚糖酶基因编码区核心序列进行扩增,根据所扩增序列设计hiTAIL-PCR特异性引物,最终克隆了1个编码区长度为1 284 bp的新颖木聚糖酶基因。生物信息学分析表明,该基因编码蛋白质氨基酸序列长度为427 aa,分子量为47 398.91 Da,理论等电点（pI）为8.99,是一个不含跨膜区域的亲水性蛋白。 

【文章来源】：生物化工. 2020,6(01)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

蛋白质跨膜区域分析

土壤中因富含腐殖酸、多酚等杂质，其高质量微生物总DNA的提取颇有困难困难较大。本研究使用试剂盒法提取总DNA。所提样品经琼脂糖凝胶电泳检测，结果如图1所示。发现其条带单一，泳道内无弥散、降解现象，初步认为可满足PCR扩增对模板质量的要求。为了进一步验证模板质量，以微生物16S rRNA通用引物27F/1525R扩增，PCR产物经电泳检测，结果如图2所示。可以看到扩增产物条带清晰、符合预期大小，因此所提取DNA可满足后续实验要求。2.2 木聚糖酶基因核心序列的PCR扩增

16S rRNAPCR检测

【参考文献】：
期刊论文
[1]木聚糖酶对全麦面团特性的影响研究[J]. 王佳玉,陈凤莲,汤晓智.  中国粮油学报. 2019(09)
[2]木聚糖酶预处理在檀皮纤维漂白中的应用[J]. 王阳,盛杰,刘旭,杨仁党.  造纸科学与技术. 2019(01)
[3]木聚糖酶对肉鸡不同类型饲粮净能值的影响[J]. 班志彬,闫晓刚,张莹,于维,郎朝丽,梁浩,李立佳,苏斯瑶,杨华明.  动物营养学报. 2019(03)
[4]基于土壤宏基因组文库筛选非培养木聚糖酶基因[J]. 熊科,高乐,杨玉焕,崔晓亭,李秀婷.  食品与发酵工业. 2015(10)
[5]木聚糖酶及其在食品工业中的应用[J]. 闵兆升,郭会明,顾承真,洪厚胜.  食品与发酵工业. 2013(10)



本文编号：3233250