朱砂叶螨miRNA鉴定及其在敏感和抗药性品系的表达差异
发布时间：2021-08-11 22:11
朱砂叶螨（Tetranychus cinnabarinus）是重要的世界性害螨,因其个体小、繁殖速度快、移动范围小、接触药剂机会多和近亲繁殖率高等特点而极易产生抗药性。miRNAs （microRNAs）是一种人小为21nt左右,由真核生物基因组编码的内源性,具有调控功能的非编码RNA,它通过5’端种子序列2-8位核苷酸与靶基因mRNA3’端UTR区互补配对识别,降解靶基因mRNA或抑制mRNA的翻泽,从而调控基因的表达。为了解miRNAs的调控作用是否与朱砂叶螨抗药性的产生有关,我们利用Illumina HiSeq2000测序平台第一次对朱砂叶螨small RNA进行测序,鉴定朱砂叶螨miRNA并研究其在甲氰菊酯抗性品系和敏感品系中的表达。主要研究结果如下1.通过small RNA测序,在朱砂叶螨甲氰菊酯抗性品系FeR中获得24796487条reads,在敏感品系SS中获得22001867条reads.通过筛选,发现sRNA（18-30nt）的在FeR中为21232699条,其中的7014169条（33.56%）能匹配上二斑叶螨（Tetranychus urticae）基因组；在SS...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略语
第一章 文献综述
1. 朱砂叶螨及其抗性
1.1 朱砂叶螨
1.2 叶螨抗性概况
1.3 叶螨抗性机理
1.4 甲氰菊酯研究现状
2. microRNAs(miRNAs)
2.1 miRNA简介
2.2 miRNA功能
引言
第二章 朱砂叶螨small RNA测序
1. 材料与方法
1.1 供试朱砂叶螨
1.2 供试药剂和仪器
1.3 实验材料
1.4 朱砂叶螨抗性水平的确定
1.5 提取RNA所需耗材处理方法
1.6 叶碟法收集朱砂叶螨
1.7 朱砂叶螨总RNA的提取和质量检测
1.8 朱砂叶螨转录组测序方法
2 结果与分析
2.1 朱砂叶螨总RNA质量检测结果
2.2 朱砂叶螨small RNA测序概况
2.3 small RNA测序质量分析
3. 讨论
第三章 朱砂叶螨small RNA生物信息学分析
1 材料与方法
1.1 实验工具
1.2 生物信息学分析方法
2. 结果与分析
2.1 已知miRNA的鉴定结果
2.2 新的miRNA的预测结果
2.3 miRNA靶基因预测及抗性基因分析
2.4 差异表达的miRNA及鞭基因分析
2.5 miRNA碱基编辑
3. 讨论
第四章 朱砂叶螨miRNA表达研究
1 材料与方法
1.1 供试朱砂叶螨
1.2 供试试剂与仪器
1.3 实验材料
1.4 朱砂叶螨总RNA的提取及质量检测
1.5 定量PCR
2. 结果与分析
2.1 朱砂叶螨总RNA质量检测
2.2 标准曲线
2.3 溶解曲线及相对表达
3. 讨论
参考文献
附录
致谢
在读期间发表的论文
在读期间参加的科研课题
【参考文献】：
期刊论文
[1]阿维菌素的研究与应用前景探析[J]. 徐丽君,王英满,徐建陶. 现代农业科技. 2008(21)
[2]我国朱砂叶螨研究进展[J]. 刘波,桂连友. 长江大学学报(自科版)农学卷. 2007(03)
[3]桑园害虫朱砂叶螨的研究进展[J]. 吴福安,王兴科,余茂德,程嘉翎. 蚕业科学. 2006(03)
[4]Resistance Selection of Tetranychus cinnabarinus to Fenpropathrin and Genetic Analysis[J]. HE Lin, ZHAO Zhi-mo, CAO Xiao-fang, DENG Xin-ping and WANG Jin-jun Key Laboratory of Entomology and Pest Control Engineering of Chongqing, Southwest Agricultural University, Chongqing 400716, P.R.China. Agricultural Sciences in China. 2005(11)
[5]温度对抗性朱砂叶螨发育和繁殖的影响[J]. 何林,赵志模,曹小芳,邓新平,王进军. 昆虫学报. 2005(02)
[6]杀虫剂新品种开发进展及特点[J]. 李海屏. 江苏化工. 2004(01)
[7]朱砂叶螨的抗药性选育及其解毒酶活性研究[J]. 何林,谭仕禄,曹小芳,赵志模,邓新平,王进军. 农药学学报. 2003(04)
[8]毒死蜱和甲氰菊酯对家蚕毒性与安全评价研究[J]. 吴声敢,王强,赵学平,吴长兴,陈丽萍. 农药科学与管理. 2003(09)
[9]Resistance Selection of Tetranychus cinnabarinus to Three Acaricides and Its Management Strategy[J]. HE Lin, ZHAO Zhi-mo, DENG Xin-ping, WANG Jin-jun, LIU Huai and LIU Ying-hongKey Laboratory of Entomology and Pest Control Engineering of Chongqing, Southwest Agricultural University , Chongqing 400716 , P. R. China. Agricultural Sciences in China. 2003(02)
[10]朱砂叶螨对两种杀螨剂的抗性遗传力及风险评估[J]. 何林,赵志模,邓新平,王进军,刘怀. 植物保护学报. 2002(04)
博士论文
[1]日本落叶松实生苗small RNA测序、microRNA鉴定及其目标基因差异表达分析[D]. 吴涛.中国林业科学研究院 2012
硕士论文
[1]朱砂叶螨钠通道基因克隆及其kdr突变研究[D]. 冯亚宁.西南大学 2011
本文编号：3336982
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略语
第一章 文献综述
1. 朱砂叶螨及其抗性
1.1 朱砂叶螨
1.2 叶螨抗性概况
1.3 叶螨抗性机理
1.4 甲氰菊酯研究现状
2. microRNAs(miRNAs)
2.1 miRNA简介
2.2 miRNA功能
引言
第二章 朱砂叶螨small RNA测序
1. 材料与方法
1.1 供试朱砂叶螨
1.2 供试药剂和仪器
1.3 实验材料
1.4 朱砂叶螨抗性水平的确定
1.5 提取RNA所需耗材处理方法
1.6 叶碟法收集朱砂叶螨
1.7 朱砂叶螨总RNA的提取和质量检测
1.8 朱砂叶螨转录组测序方法
2 结果与分析
2.1 朱砂叶螨总RNA质量检测结果
2.2 朱砂叶螨small RNA测序概况
2.3 small RNA测序质量分析
3. 讨论
第三章 朱砂叶螨small RNA生物信息学分析
1 材料与方法
1.1 实验工具
1.2 生物信息学分析方法
2. 结果与分析
2.1 已知miRNA的鉴定结果
2.2 新的miRNA的预测结果
2.3 miRNA靶基因预测及抗性基因分析
2.4 差异表达的miRNA及鞭基因分析
2.5 miRNA碱基编辑
3. 讨论
第四章 朱砂叶螨miRNA表达研究
1 材料与方法
1.1 供试朱砂叶螨
1.2 供试试剂与仪器
1.3 实验材料
1.4 朱砂叶螨总RNA的提取及质量检测
1.5 定量PCR
2. 结果与分析
2.1 朱砂叶螨总RNA质量检测
2.2 标准曲线
2.3 溶解曲线及相对表达
3. 讨论
参考文献
附录
致谢
在读期间发表的论文
在读期间参加的科研课题
【参考文献】：
期刊论文
[1]阿维菌素的研究与应用前景探析[J]. 徐丽君,王英满,徐建陶. 现代农业科技. 2008(21)
[2]我国朱砂叶螨研究进展[J]. 刘波,桂连友. 长江大学学报(自科版)农学卷. 2007(03)
[3]桑园害虫朱砂叶螨的研究进展[J]. 吴福安,王兴科,余茂德,程嘉翎. 蚕业科学. 2006(03)
[4]Resistance Selection of Tetranychus cinnabarinus to Fenpropathrin and Genetic Analysis[J]. HE Lin, ZHAO Zhi-mo, CAO Xiao-fang, DENG Xin-ping and WANG Jin-jun Key Laboratory of Entomology and Pest Control Engineering of Chongqing, Southwest Agricultural University, Chongqing 400716, P.R.China. Agricultural Sciences in China. 2005(11)
[5]温度对抗性朱砂叶螨发育和繁殖的影响[J]. 何林,赵志模,曹小芳,邓新平,王进军. 昆虫学报. 2005(02)
[6]杀虫剂新品种开发进展及特点[J]. 李海屏. 江苏化工. 2004(01)
[7]朱砂叶螨的抗药性选育及其解毒酶活性研究[J]. 何林,谭仕禄,曹小芳,赵志模,邓新平,王进军. 农药学学报. 2003(04)
[8]毒死蜱和甲氰菊酯对家蚕毒性与安全评价研究[J]. 吴声敢,王强,赵学平,吴长兴,陈丽萍. 农药科学与管理. 2003(09)
[9]Resistance Selection of Tetranychus cinnabarinus to Three Acaricides and Its Management Strategy[J]. HE Lin, ZHAO Zhi-mo, DENG Xin-ping, WANG Jin-jun, LIU Huai and LIU Ying-hongKey Laboratory of Entomology and Pest Control Engineering of Chongqing, Southwest Agricultural University , Chongqing 400716 , P. R. China. Agricultural Sciences in China. 2003(02)
[10]朱砂叶螨对两种杀螨剂的抗性遗传力及风险评估[J]. 何林,赵志模,邓新平,王进军,刘怀. 植物保护学报. 2002(04)
博士论文
[1]日本落叶松实生苗small RNA测序、microRNA鉴定及其目标基因差异表达分析[D]. 吴涛.中国林业科学研究院 2012
硕士论文
[1]朱砂叶螨钠通道基因克隆及其kdr突变研究[D]. 冯亚宁.西南大学 2011
本文编号：3336982
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/nykj/3336982.html
