盐胁迫下巴西蕉叶片的转录组和蛋白质组关联分析

发布时间：2021-08-21 15:32

　　为了从转录组和蛋白质组水平上揭示巴西蕉响应盐胁迫环境的分子机制,本研究以中国主栽品种‘巴西蕉’（Musa paradisiaca）为试验材料,人工模拟盐胁迫60 mmol/L NaCl分别处理0 h、12 h和24 h,利用RNA-Seq和iTRAQ技术对叶片进行转录组和蛋白质组关联分析。本研究共鉴定出68个与差异基因表达趋势相同的差异蛋白,其中13个上调,55个下调。这些差异蛋白功能涉及细胞骨架、结构、抗氧化物、胁迫防御、代谢和其它未知功能蛋白等。上调表达的蛋白主要参与了细胞骨架、结构和胁迫防御等,包括微管蛋白、凝集素和β-半乳糖苷酶等;下调表达的蛋白主要参与抗氧化物和代谢等,主要包括放氧增强蛋白、半胱氨酸合酶、蔗糖合酶等。通过高通量多组学数据的关联分析为深入认识巴西蕉响应盐胁迫的分子调控机制提供了理论依据。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(23)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

巴西蕉叶片蛋白质组鉴定基本信息统计

通过基因本体(gene ontology,GO)分析来判断差异表达基因所承担的生物学功能。在关联分析下，将与m RNA表达趋势一致的差异蛋白进行GO功能分类，在细胞组分中，主要表现在细胞、细胞部分、细胞器等方面；在分子功能中，主要表现在催化活性和结合；在生物过程中，主要参与刺激响应、代谢过程和细胞过程等(图3)。

通过m RNA水平和蛋白质水平这两个层面进行关联分析，盐胁迫下，香蕉叶片鉴定出68个与差异基因表达趋势相同的差异蛋白，其中13个上调，55个下调，差异基因筛选条件为FDR<0.05且|log2FC|>1；筛选差异蛋白条件为，表达倍数大于1.2为上调蛋白和小于0.83为下调蛋白且FDR<0.05。图4 与差异基因变化趋势相反的差异蛋白

【参考文献】：
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本文编号：3355871