青枯菌小种4号菌株SD54的比较基因组学及其寄主特异性研究

发布时间：2021-09-01 07:03

　　由茄科雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）引起的植物细菌性青枯病是世界上危害最大、分布最广、造成损失最严重的植物病害之一，至今尚无有效防治办法。不同地区、不同寄主来源的青枯菌菌株在寄主范围、致病力强弱和细菌学特性上并不完全相同。随着分子生物学和测序技术的发展和完善，细菌基因组学研究得到不断的加强和深入，越来越多的病原被测序。目前为止，除小种4号菌株外，青枯菌的其它4个生理小种的测序已经完成或将要完成。为了更深入的研究小种4号菌株与寄主植物姜之间的特异相关性，以及为最终解析小种4号青枯菌的致病特异性及其防治奠定基础，本研究以小种4号菌株SD54为例，对该菌株进行了全基因组测序、比较基因组学以及致病特异性分析等研究，取得的主要结果如下：1．青枯菌小种4号菌株SD54基因组测序及比较基因组学分析（1）利用Illumina （Solexa）和454焦磷酸测序技术相结合的测序方法对SD54进行了全基因组序列测定，并经过Gap填补和序列组装最终获得了SD54的基因组框架图。序列分析表明：SD54基因组大小为5,784,798bp，平均GC含量67%，编码5,496个CDS，56... 

【文章来源】：山东师范大学山东省

【文章页数】：83 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

青枯病菌致病性菌株（左）和非致病性菌株（右）在TZC琼脂培养基上的形态

青枯菌菌株GMI1000的2个复制子(引自[26]

青枯菌毒性调控系统（引自[56]


本文编号：3376505