昭苏县野生羊肚菌根际土壤细菌多样性研究
发布时间:2021-10-22 14:30
采集昭苏县野生羊肚菌(Morchella esculenta)根际水平直径10 cm、深度0~30 cm范围内的3层各10 cm土壤样品,利用Illumina miseq 2×300 bp高通量测序技术和生物信息学分析方法检测细菌类群的多样性。结果显示,细菌群落Chao和Shannon指数在0~30 cm土层中的平均值分别为152和3.68,且两种指数在10~20 cm土层均最高;细菌群落在各分类水平上的类群(最大类群丰度)分别为变形菌门(Proteobacteria,36.3%)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)等13门;黄杆菌科(Flavobacteriaceae,8.4%)、芽胞杆菌科(Bacillaceae)和葡萄球菌科(Staphylococcaceae)等43科;葡萄球菌属(Staphylococcus,7.1%)、杆状菌属(Bacillus)和Cloacibacterium等52属;不能培养的α-变形杆菌(uncultured α-proteobacterium,2.0%)、不能培养的嗜甲基菌科1种(uncultured Methy...
【文章来源】:微生物学杂志. 2020,40(04)CSCD
【文章页数】:10 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 样品采集
1.1.2 试剂与仪器
1.2 方法
1.2.1 土壤细菌miseq文库制备
1.2.2 DNA的AxyPrepDNA凝胶回收和定量
1.2.3 细菌16S rDNA序列基因测序及数据分析
2 结果与分析
2.1 测序结果质量分析
2.2 各样品中细菌多样性及相关性分析
2.3 土壤样品菌群组成分析
2.4 羊肚菌根际不同土层中细菌门的丰度及其均匀度比较
2.5 固氮细菌的分析
3 讨 论
【参考文献】:
期刊论文
[1]伊犁野生羊肚菌根际土壤微生物功能多样性分析[J]. 张相锋,杨晓绒,焦子伟. 微生物学杂志. 2019(02)
[2]羊肚菌菌基土壤微生物群落结构和多样性研究[J]. 张婷,黄香媛,徐岩岩,李洁. 河北农业大学学报. 2018(06)
[3]微生物群落多样性数学表征方法及其在污水处理系统研究中的应用[J]. 夏瑜,何绪文,文湘华. 微生物学通报. 2018(08)
[4]联合固氮菌叶面接种剂的优化及其在玉米叶际的定殖[J]. 葛安辉,方萍,熊超,张丽梅,贺纪正. 微生物学通报. 2018(06)
[5]羊肚菌化学成分及药理活性研究进展[J]. 李文佳,田野,高昊,甄达明,董彩虹,钱正明. 菌物研究. 2017(02)
[6]不同海拔红松林土壤微生物功能多样性[J]. 韩冬雪,王宁,王楠楠,孙雪,冯富娟. 应用生态学报. 2015(12)
[7]羊肚菌菌塘土壤细菌群落的结构及多样性[J]. 熊川,李小林,李强,郑林用. 湖南农业大学学报(自然科学版). 2015(04)
[8]土壤微生物多样性及其影响因素研究进展[J]. 曹宏杰,倪红伟. 国土与自然资源研究. 2015(03)
[9]新疆伊犁昭苏野生羊肚菌分离株的分子鉴定研究[J]. 武冬梅,许文涛,谢宗铭,李全胜,罗云波. 北方园艺. 2014(21)
[10]羊肚菌的多样性、演化历史及栽培研究进展[J]. 杜习慧,赵琪,杨祝良. 菌物学报. 2014(02)
硕士论文
[1]云南羊肚菌分类及其生长土壤微生物群落结构分析[D]. 沈洪.南京农业大学 2007
本文编号:3451293
【文章来源】:微生物学杂志. 2020,40(04)CSCD
【文章页数】:10 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 样品采集
1.1.2 试剂与仪器
1.2 方法
1.2.1 土壤细菌miseq文库制备
1.2.2 DNA的AxyPrepDNA凝胶回收和定量
1.2.3 细菌16S rDNA序列基因测序及数据分析
2 结果与分析
2.1 测序结果质量分析
2.2 各样品中细菌多样性及相关性分析
2.3 土壤样品菌群组成分析
2.4 羊肚菌根际不同土层中细菌门的丰度及其均匀度比较
2.5 固氮细菌的分析
3 讨 论
【参考文献】:
期刊论文
[1]伊犁野生羊肚菌根际土壤微生物功能多样性分析[J]. 张相锋,杨晓绒,焦子伟. 微生物学杂志. 2019(02)
[2]羊肚菌菌基土壤微生物群落结构和多样性研究[J]. 张婷,黄香媛,徐岩岩,李洁. 河北农业大学学报. 2018(06)
[3]微生物群落多样性数学表征方法及其在污水处理系统研究中的应用[J]. 夏瑜,何绪文,文湘华. 微生物学通报. 2018(08)
[4]联合固氮菌叶面接种剂的优化及其在玉米叶际的定殖[J]. 葛安辉,方萍,熊超,张丽梅,贺纪正. 微生物学通报. 2018(06)
[5]羊肚菌化学成分及药理活性研究进展[J]. 李文佳,田野,高昊,甄达明,董彩虹,钱正明. 菌物研究. 2017(02)
[6]不同海拔红松林土壤微生物功能多样性[J]. 韩冬雪,王宁,王楠楠,孙雪,冯富娟. 应用生态学报. 2015(12)
[7]羊肚菌菌塘土壤细菌群落的结构及多样性[J]. 熊川,李小林,李强,郑林用. 湖南农业大学学报(自然科学版). 2015(04)
[8]土壤微生物多样性及其影响因素研究进展[J]. 曹宏杰,倪红伟. 国土与自然资源研究. 2015(03)
[9]新疆伊犁昭苏野生羊肚菌分离株的分子鉴定研究[J]. 武冬梅,许文涛,谢宗铭,李全胜,罗云波. 北方园艺. 2014(21)
[10]羊肚菌的多样性、演化历史及栽培研究进展[J]. 杜习慧,赵琪,杨祝良. 菌物学报. 2014(02)
硕士论文
[1]云南羊肚菌分类及其生长土壤微生物群落结构分析[D]. 沈洪.南京农业大学 2007
本文编号:3451293
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/nykj/3451293.html