香榧根际土壤微生物多样性研究
发布时间:2021-11-22 22:22
香榧(Torreya grandis cv.Merrillii)是我国的特产珍稀干果。随着香榧种植规模地不断扩大以及种植年限的增加,在现阶段香榧产业中缺乏科学合理的管理经验,引起香榧林地土壤化学性质恶化。因此,本文采用高通量测序技术,通过对不同种植年限、不同香榧主产区根际土壤微生物群落组成及多样性变化等进行研究,探讨香榧生长发育与根际微生物间的关系,找出影响香榧根际土壤微生物群落结构变化的主要土壤环境因子,对改善香榧林地土壤质量,促进香榧产业可持续性发展具有重要的理论和实践意义。主要研究结果如下:(1)香榧根际土壤微生物群落随种植年限不同而发生明显变化,在种植15a的香榧土壤中细菌Chao1指数、ACE指数和Shannon指数显著降低(P<0.05),Simpson指数无显著变化。NMDS分析显示种植年限对细菌群落结构变化有显著影响,而种植5 a和10 a香榧林地土壤具有相似的细菌群落。细菌相对丰度、多样性以及群落结构(基本上由变形菌、放线菌、酸杆菌和绿弯菌组成)的变化与有机质、C/N、全氮呈极显著相关关系(P<0.01)。香榧根际土壤真菌Chao1和ACE值,随种植年限的...
【文章来源】:浙江农林大学浙江省
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
各样地细菌群落基于OTU水平的NMDS分析
香榧根际土壤微生物多样性研究根据物种注释结果,选取每个样品在门水平上最大丰度排名前 10 的物种,产生物种相对丰度柱形累加图(图 3.2)。从香榧根际土壤中鉴定得到的细菌主要来自 8 个门,大约占了 97%,分属变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、奇古菌门(Thaumarchaeota)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)。说明变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、厚壁菌门为香榧根际土壤的优势菌群,上述门类累计在 5 a、10 a 和 15 a 香榧土壤中分别占细菌总数的 88.20 %、88.38%和 90.80%(图 3.2)。
14图 3.3 不同种植年限相对丰度最高的 35 个细菌群落在目水平上的热图Fig 3.3 Heat map showing the relative abundance of the top 35 most abundant bacterial orderfound at the soil samples from different plots3.3 不同种植年限真菌多样性和群落结构的变化ITS1 区的高通量测序结果显示,12 个样本共获得有效序列 915 386 条,平均长度为 227bp,测序覆盖率在 75.56%~94.50%。这样的测序深度基本可以反映该区域细菌群落种类和结构,可以定量比较整个群落组成和多样性的相对差异。对 Alpha 多样性分析指数进行统计,可以反映微生物群落的丰富度和多样性。如表 3.3 所示,香榧根际土壤真菌菌群丰度指数 Chao1 和 ACE 值,随种植
【参考文献】:
期刊论文
[1]土壤微生物多样性海拔格局研究进展[J]. 厉桂香,马克明. 生态学报. 2018(05)
[2]不同采收成熟度和堆沤方式对香榧种子堆沤后熟品质的影响[J]. 叶珊,王为宇,周敏樱,何煜明,庄志城,喻卫武,吴家胜,宋丽丽. 林业科学. 2017(11)
[3]非共生生物固氮微生物分子生态学研究进展[J]. 徐鹏霞,韩丽丽,贺纪正,罗锋,张丽梅. 应用生态学报. 2017(10)
[4]关帝山森林土壤真菌群落结构与遗传多样性特征[J]. 乔沙沙,周永娜,柴宝峰,贾彤,李毳. 环境科学. 2017(06)
[5]基于高通量测序的两种植被恢复类型根际土壤细菌多样性研究[J]. 戴雅婷,闫志坚,解继红,吴洪新,徐林波,侯向阳,高丽,崔艳伟. 土壤学报. 2017(03)
[6]土壤微生物在促进植物生长方面的作用[J]. 张世缘. 生物化工. 2017(01)
[7]氮磷钾营养元素对香榧幼苗生长效果的影响[J]. 何学燕,聂朝俊. 贵州林业科技. 2017(01)
[8]基于高通量测序的杨树人工林根际土壤真菌群落结构[J]. 汪其同,高明宇,刘梦玲,王华田,董玉峰,王延平. 应用生态学报. 2017(04)
[9]我国人工林土壤有机质的量和质下降是制约林木生长的关键因子[J]. 杨承栋. 林业科学. 2016(12)
[10]根瘤菌在污染土壤修复中的地位和作用[J]. 黄兴如,张彩文,张晓霞. 中国土壤与肥料. 2016(05)
硕士论文
[1]不同层次土壤中微生物群落对扰动和豆科植物生长的响应[D]. 杨帆.西北农林科技大学 2017
[2]连栽障碍地杉木优良无性系土壤特性分析及酚酸鉴定[D]. 魏晓骁.福建农林大学 2017
[3]不同立地与经营措施对香榧林地土壤肥力的影响[D]. 李麟杰.浙江农林大学 2016
[4]香榧营养元素的动态分析与营养诊断初步研究[D]. 刘萌萌.浙江农林大学 2014
[5]香榧林地土壤肥力及树木营养诊断与施肥的研究[D]. 张春苗.浙江农林大学 2011
本文编号:3512547
【文章来源】:浙江农林大学浙江省
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
各样地细菌群落基于OTU水平的NMDS分析
香榧根际土壤微生物多样性研究根据物种注释结果,选取每个样品在门水平上最大丰度排名前 10 的物种,产生物种相对丰度柱形累加图(图 3.2)。从香榧根际土壤中鉴定得到的细菌主要来自 8 个门,大约占了 97%,分属变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、奇古菌门(Thaumarchaeota)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)。说明变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、厚壁菌门为香榧根际土壤的优势菌群,上述门类累计在 5 a、10 a 和 15 a 香榧土壤中分别占细菌总数的 88.20 %、88.38%和 90.80%(图 3.2)。
14图 3.3 不同种植年限相对丰度最高的 35 个细菌群落在目水平上的热图Fig 3.3 Heat map showing the relative abundance of the top 35 most abundant bacterial orderfound at the soil samples from different plots3.3 不同种植年限真菌多样性和群落结构的变化ITS1 区的高通量测序结果显示,12 个样本共获得有效序列 915 386 条,平均长度为 227bp,测序覆盖率在 75.56%~94.50%。这样的测序深度基本可以反映该区域细菌群落种类和结构,可以定量比较整个群落组成和多样性的相对差异。对 Alpha 多样性分析指数进行统计,可以反映微生物群落的丰富度和多样性。如表 3.3 所示,香榧根际土壤真菌菌群丰度指数 Chao1 和 ACE 值,随种植
【参考文献】:
期刊论文
[1]土壤微生物多样性海拔格局研究进展[J]. 厉桂香,马克明. 生态学报. 2018(05)
[2]不同采收成熟度和堆沤方式对香榧种子堆沤后熟品质的影响[J]. 叶珊,王为宇,周敏樱,何煜明,庄志城,喻卫武,吴家胜,宋丽丽. 林业科学. 2017(11)
[3]非共生生物固氮微生物分子生态学研究进展[J]. 徐鹏霞,韩丽丽,贺纪正,罗锋,张丽梅. 应用生态学报. 2017(10)
[4]关帝山森林土壤真菌群落结构与遗传多样性特征[J]. 乔沙沙,周永娜,柴宝峰,贾彤,李毳. 环境科学. 2017(06)
[5]基于高通量测序的两种植被恢复类型根际土壤细菌多样性研究[J]. 戴雅婷,闫志坚,解继红,吴洪新,徐林波,侯向阳,高丽,崔艳伟. 土壤学报. 2017(03)
[6]土壤微生物在促进植物生长方面的作用[J]. 张世缘. 生物化工. 2017(01)
[7]氮磷钾营养元素对香榧幼苗生长效果的影响[J]. 何学燕,聂朝俊. 贵州林业科技. 2017(01)
[8]基于高通量测序的杨树人工林根际土壤真菌群落结构[J]. 汪其同,高明宇,刘梦玲,王华田,董玉峰,王延平. 应用生态学报. 2017(04)
[9]我国人工林土壤有机质的量和质下降是制约林木生长的关键因子[J]. 杨承栋. 林业科学. 2016(12)
[10]根瘤菌在污染土壤修复中的地位和作用[J]. 黄兴如,张彩文,张晓霞. 中国土壤与肥料. 2016(05)
硕士论文
[1]不同层次土壤中微生物群落对扰动和豆科植物生长的响应[D]. 杨帆.西北农林科技大学 2017
[2]连栽障碍地杉木优良无性系土壤特性分析及酚酸鉴定[D]. 魏晓骁.福建农林大学 2017
[3]不同立地与经营措施对香榧林地土壤肥力的影响[D]. 李麟杰.浙江农林大学 2016
[4]香榧营养元素的动态分析与营养诊断初步研究[D]. 刘萌萌.浙江农林大学 2014
[5]香榧林地土壤肥力及树木营养诊断与施肥的研究[D]. 张春苗.浙江农林大学 2011
本文编号:3512547
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