茄科植物链格孢菌大孢子种分类研究及菌株YZU 161111全基因组测序

发布时间：2021-12-28 03:14

　　茄科植物广泛分布于全球的温带及热带地区,具有重要的经济、药用及观赏价值,我国有24属约105种。链格孢菌属是经济上重要的真菌属之一,引起多种植物病害,造成严重的经济损失,如茄科植物的早疫病。本研究通过广泛采集茄科植物病样组织,并进行菌株分离,对相关的链格孢菌大孢子种进行了分类研究,并选取了一株代表菌株进行了全基因组测序,结合菌丝和孢子两个转录的测序,进行了系统分析,具体研究体结果如下:2017-2019年,从内蒙古、吉林、青海、甘肃、湖北等地采集茄科植物病样,通过保湿培养,共分离出链格孢菌大孢子种菌株78株。根据菌落形态,寄主以及采集地的不同,筛选出14个菌株进行基于Alt al、GAPDH、RPB2、ITS和TEF1五个基因的系统发育分析以及形态学的分类研究。共鉴定出5个不同种类,其中包含分离自酸浆上的一个新种,命名为Alternaria physalidis sp.nov.;分离自马铃薯上的A.blumeae,为中国一新记录种;分离自马铃薯上的A.solani、曼陀罗上的A.crassa以及枸杞上的A.brassicae均为已知种类。此外,研究发现7个菌株的多个基因序列存在多个杂合... 

【文章来源】：长江大学湖北省

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

基于Altal、GAPDH、RPB2、ITS和TEF1五个基因序列构建的最大似然法系统发育树，outgroup为AlternarianitrimaliCBS109163

AlternariablumeaeYZU171889的形态学特征

19此外，同时鉴定为Alternariasolani还有分离自湖北宜昌的菌株YZU161111以及分离自青海西宁的YZU171875，它们均从马铃薯中分离得到。A.solani能引起马铃薯、番茄、茄子、辣椒等茄科植物的早疫病，在我国乃至世界各地均有分布。图2-5茄链格孢菌AlternariasolaniYZU171806的形态学特征。A：于PDA培养基上在25°C下生长7d后的菌落形态。B：PCA培养基上产生的分生孢子形态。比例尺为20μm。Fig.2-5MorphologicalcharacteristicsofAlternariasolaniYZU171806.A:ColonyonPDAfor7daysat25°C.B:ConidiaonPCA.Scalebar=20μm.2.3.5粗链格孢菌Alternariacrassa菌株YZU171882分离自吉林长春的曼陀罗病样上，其在PDA培养基上生长7d后菌落浅黄至浅灰色，边缘呈不规则圆形，菌丝较为稀疏，背面浅灰色，菌落直径为43–45mm。

【参考文献】：
期刊论文
[1]枸杞的生物学特性及开发利用[J]. 薛跃强,张建波,班振国,程丽清.  内蒙古林业调查设计. 2016(03)
[2]新一代测序技术的发展和应用[J]. 田李,张颖,赵云峰.  生物技术通报. 2015(11)
[3]从世界马铃薯产业发展谈中国马铃薯的主粮化[J]. 李文娟,秦军红,谷建苗,仇志军,周俊,谢开云,卢肖平.  中国食物与营养. 2015(07)
[4]菌物基因组测定研究进展[J]. 刘淑艳,李广,李玉.  吉林农业大学学报. 2014(01)
[5]植物病原菌毒素的种类、作用机理和应用前景[J]. 耿锐梅,张建萍,余柳青.  浙江农业学报. 2007(05)
[6]矮牵牛繁殖的研究进展[J]. 武术杰.  北方园艺. 2007(05)
[7]比较基因组学及其应用[J]. 宋雪梅,李宏滨,杜立新.  生命的化学. 2006(05)
[8]nr数据库分析及其本地化[J]. 邓泱泱,荔建琦,吴松锋,朱云平,陈耀文,贺福初.  计算机工程. 2006(05)
[9]十字花科蔬菜种传黑斑病研究进展[J]. 肖长坤,李勇,李健强.  中国农业大学学报. 2003(05)
[10]链格孢属真菌分类研究进展[J]. 王洪凯,张天宇,张猛.  山东农业大学学报(自然科学版). 2001(03)

博士论文
[1]链格孢菌比较基因组及bZIP转录因子功能研究[D]. 盖云鹏.浙江大学 2019
[2]黑腐皮壳侵染苹果的组织细胞学及转录组学研究[D]. 柯希望.西北农林科技大学 2013
[3]链格孢属真菌现代分类方法研究[D]. 孙霞.山东农业大学 2006

硕士论文
[1]茄链格孢全基因组测序及SSR分子标记的开发[D]. 何佳昱.河北农业大学 2015



本文编号：3553289