广东南岭森林土壤中可培养细菌多样性

发布时间：2021-12-31 13:16

　　广东南岭森林土壤中蕴藏着丰富的生物资源,但对其中的可培养细菌种类仍缺乏系统了解。本研究采用贫营养型的R2A培养基和富营养型的TSA培养基对南岭森林土壤中细菌进行了分离,获得细菌408株,分别从属于厚壁菌门、变形菌门、放线菌门和拟杆菌门的35属。其中的优势类群为厚壁菌门,占分离总数量的71%。在属水平,芽胞杆菌及其近缘属为优势类群。除芽胞杆菌外,假单胞菌、伯克霍尔德氏菌、草酸杆菌科Collimonas属和罗丹诺杆菌科Dyella属是分离获得的主要类群。R2A培养基在分离革兰氏阴性的变形菌门菌株方面表现出一定的偏好性,而TSA培养基分离得到的更多为快速生长的芽胞杆菌及其近缘的革兰氏阳性细菌。发现了15属的菌株具有一定的水解酶活性,大多表现出对淀粉和牛奶的水解活性,对有机磷的水解性能优于对无机磷的水解。降解纤维素的菌株则主要集中于芽胞杆菌及其近缘属中。发现了潜在新物种26株,分布于芽胞杆菌、Dyella、类芽孢杆菌等9属中。本研究仅使用了两种营养类型的培养基,进一步借助培养组学技术有望能更加全面反映南岭森林土壤中的可培养微生物多样性。 

【文章来源】：生物资源. 2020,42(05)

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

南岭森林土壤可培养微生物门（A）和属（B）水平分布特征

南岭森林土壤中35属代表菌株基于16S r RNA基因构建的邻接法系统发育树（自举值>50%,1 000次重复）

本研究采用了贫营养型的R2A和富营养型的TSA两种培养基，分别获得菌株218和190株，涵盖了21和24属，两种培养基上均分离到的属共有10个，其占比高达分离菌株总数的80%，其余属分布则差异较大（图3A）。TSA培养基上的菌株以芽胞杆菌、赖氨酸芽胞杆菌、类芽胞杆菌和绿芽胞杆菌为主（图3B），而R2A则以芽胞杆菌、Collimonas、Dyella、假单胞菌、伯克霍尔德氏菌、贪铜菌（Cupriavidus）为主（图3C）。除了在两种培养基上均占据优势数量的芽胞杆菌外，R2A培养基上获得的Collimonas、Dyella、假单胞菌、伯克霍尔德氏菌、贪铜菌等属主要为革兰氏阴性的变形杆菌，而TSA培养基获得的菌株仍主要是革兰氏阳性的芽胞杆菌近缘属，这表明不同营养类型的培养基对分离的可培养细菌种类有着较大的影响。2.3 南岭可培养细菌的水解特性

【参考文献】：
期刊论文
[1]广东南岭森林土壤中可培养细菌多样性[J]. 李佳丽,陈稳迪,冯广达,周杨,刘阳,陈猛,朱红惠.  生物资源. 2020(05)
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本文编号：3560324