不同处理方式对土壤细菌多样性的影响
发布时间：2022-01-09 03:16
本文采用高通量测序法,探究短密木霉（Trichoderma brevicompactum）、大豆和咪唑乙烟酸三者分别处理以及共同作用对土壤细菌多样性和群落结构的影响。试验以不含上述3种物质的土壤为阴性对照。结果表明:5个不同处理样品共含有36 336个细菌OTU（operational taxonomic unit）,其中共有的细菌种类有1 031个,仅占样品细菌总数的2.84%;不同处理土壤样品的细菌多样性均发生变化,短密木霉、大豆对土壤细菌多样性的影响小于咪唑乙烟酸;不同处理样品的细菌群落结构组成基本相同,差异较大的是相对丰度。变形菌门（Proteobacteria）是5个样品中的优势细菌,平均丰度为50.82%;在属的水平下,鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）是5个样品中的优势细菌,其次是芽单胞菌属（Gemmatimonas）和微小杆菌属（Exiguobacterium）。结论:土壤中加入短密木霉后,土壤细菌多样性及物种总数略微下降;种植大豆后,土壤细菌多样性及物种总数升高;加入咪唑乙烟酸后,土壤细菌多样性及物种总数显著降低;短密木霉及大豆对土壤细菌多样性及物种总数的影响...
【文章来源】：森林工程. 2020,36(03)
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
不同样本OTU分布韦恩图
由图2可知,从微生物分类的门水平上来看,5个样品主要含有10个门的细菌,包括:变形菌门(Proteobacteria )、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、螺旋体菌门(Saccharibacteria)、检菌总门(Parcubacteria)。在门水平下,不同处理样品的细菌群落结构组成基本相同,差异较大的是相对丰度。这也说明土壤样品经过不同处理后,群落结构不会发生根本改变。变形菌门(Proteobacteria)是5个样品中的优势细菌,其中,A4样品的丰度最大,为58.45%,A2样品的丰度最小,为42.89%。其次是酸杆菌门(Acidobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),平均丰度分别为10.74%、10.46%。其他门以及未鉴定的细菌平均丰度均在5%以下。根据物种分类结果,由于样品中所检测出的微生物种类繁多,许多物种含量相对较少,因此选择细菌丰度前20的物种进行分类统计,如图3所示。由图3可知,从微生物分类的属水平角度来看,5个样品丰度前20个属的细菌有:鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、芽单胞菌属(Gemmatimonas)、微小杆菌属(Exiguobacterium)、Gaiella、Rhizomicrobium、红游动菌属(Rhodoplanes)、Saccharibacteria_genera_incertae_sedis、Phenylobacterium、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、Rhodoferax、Rudaea、溶杆菌属(Lysobacter)、假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)、产卟啉杆菌属(Porphyrobacter)、Methylophilus、不动杆菌属(Acinetobacter)、类诺卡氏属(Nocardioides)、孢鱼菌属(Sporichthya)、假单胞菌(Pseudomonas)及德沃斯氏菌属(Devosia)。在属水平下,不同处理样品的细菌群落结构组成基本相同,差异较大的是相对丰度。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)是5个样品中的优势细菌,其中,A3样品的丰度最大,为11.09%,其次是A4样品,丰度为9.31%,CK样品的丰度最小,为6.1%。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)细菌可用于芳香化合物的生物降解,加入咪唑乙烟酸后,可能促进了鞘氨醇单胞菌属细菌的增殖。其次是芽单胞菌属(Gemmatimonas),平均丰度为6.86%,而后是微小杆菌属(Exiguobacterium),平均丰度为5.96%,而其他前20属细菌平均丰度均在5%以下,其余已鉴定属合计平均丰度38.7%,占很大比例。
根据物种分类结果,由于样品中所检测出的微生物种类繁多,许多物种含量相对较少,因此选择细菌丰度前20的物种进行分类统计,如图3所示。由图3可知,从微生物分类的属水平角度来看,5个样品丰度前20个属的细菌有:鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、芽单胞菌属(Gemmatimonas)、微小杆菌属(Exiguobacterium)、Gaiella、Rhizomicrobium、红游动菌属(Rhodoplanes)、Saccharibacteria_genera_incertae_sedis、Phenylobacterium、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、Rhodoferax、Rudaea、溶杆菌属(Lysobacter)、假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)、产卟啉杆菌属(Porphyrobacter)、Methylophilus、不动杆菌属(Acinetobacter)、类诺卡氏属(Nocardioides)、孢鱼菌属(Sporichthya)、假单胞菌(Pseudomonas)及德沃斯氏菌属(Devosia)。在属水平下,不同处理样品的细菌群落结构组成基本相同,差异较大的是相对丰度。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)是5个样品中的优势细菌,其中,A3样品的丰度最大,为11.09%,其次是A4样品,丰度为9.31%,CK样品的丰度最小,为6.1%。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)细菌可用于芳香化合物的生物降解,加入咪唑乙烟酸后,可能促进了鞘氨醇单胞菌属细菌的增殖。其次是芽单胞菌属(Gemmatimonas),平均丰度为6.86%,而后是微小杆菌属(Exiguobacterium),平均丰度为5.96%,而其他前20属细菌平均丰度均在5%以下,其余已鉴定属合计平均丰度38.7%,占很大比例。3 讨论与结论
【参考文献】：
期刊论文
[1]猫爪草内生真菌的分离、鉴定及抑菌活性的初步研究[J]. 乔新荣,叶润,刘红云,张继英,陈琼. 黑龙江畜牧兽医. 2019(22)
[2]竹叶兰根系共生真菌群落结构及生物学功能初探[J]. 艾叶,谢泰祥,刘江枫,兰思仁,彭东辉,张清华. 菌物学报. 2019(10)
[3]麻山药不同生长时期根际土壤微生物多样性及群落结构特征[J]. 康捷,章淑艳,韩韬,孙志梅. 生物技术通报. 2019(09)
[4]降解菌短密木霉对土壤酶活性的影响[J]. 刘晴,董爱荣,邓世林,鲍彤,刘薇. 森林工程. 2019(03)
[5]高通量测序技术的研究进展[J]. 李妍,徐兴祥. 中国医学工程. 2019(03)
[6]除草剂微生物降解的研究进展[J]. 卢美名,尹雯悦,刘传龙,张茗茜,柳文睿,王新. 湖北农业科学. 2019(03)
[7]咪唑乙烟酸对花生后茬作物安全性评价[J]. 周超,路兴涛,张勇,马冲,吴翠霞,孔繁华. 花生学报. 2018(04)
[8]省域尺度油松人工林生产力与土壤养分关系研究[J]. 樊兰英,闫丽娟. 林业科技. 2018(06)
[9]土壤微生物分离与测定[J]. 董宏鑫,时铭泽. 吉林农业. 2018(20)
[10]三嗪类除草剂的全球市场及发展前景[J]. 柏亚罗,石凌波. 现代农药. 2018(03)
博士论文
[1]青藏高原青稞根腐类病害及其对根际土壤微生态的影响[D]. 李雪萍.甘肃农业大学 2017
硕士论文
[1]异恶草酮残留检测方法的建立及对土壤微生物的影响[D]. 戎丽丽.东北农业大学 2018
[2]大兴安岭天然林演替和人工林生长对于土壤微生物多样性动态的影响[D]. 牛晓燕.内蒙古农业大学 2017
[3]东北农田木霉菌的鉴定、酶活评价及其纤维素酶发酵工艺[D]. 林润泽.沈阳农业大学 2016
[4]接种费氏中华根瘤菌WGF03及其硫代谢突变体对大豆生长和根际细菌群落的影响[D]. 张健.广西大学 2014
本文编号：3577839
【文章来源】：森林工程. 2020,36(03)
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
不同样本OTU分布韦恩图
由图2可知,从微生物分类的门水平上来看,5个样品主要含有10个门的细菌,包括:变形菌门(Proteobacteria )、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、螺旋体菌门(Saccharibacteria)、检菌总门(Parcubacteria)。在门水平下,不同处理样品的细菌群落结构组成基本相同,差异较大的是相对丰度。这也说明土壤样品经过不同处理后,群落结构不会发生根本改变。变形菌门(Proteobacteria)是5个样品中的优势细菌,其中,A4样品的丰度最大,为58.45%,A2样品的丰度最小,为42.89%。其次是酸杆菌门(Acidobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),平均丰度分别为10.74%、10.46%。其他门以及未鉴定的细菌平均丰度均在5%以下。根据物种分类结果,由于样品中所检测出的微生物种类繁多,许多物种含量相对较少,因此选择细菌丰度前20的物种进行分类统计,如图3所示。由图3可知,从微生物分类的属水平角度来看,5个样品丰度前20个属的细菌有:鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、芽单胞菌属(Gemmatimonas)、微小杆菌属(Exiguobacterium)、Gaiella、Rhizomicrobium、红游动菌属(Rhodoplanes)、Saccharibacteria_genera_incertae_sedis、Phenylobacterium、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、Rhodoferax、Rudaea、溶杆菌属(Lysobacter)、假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)、产卟啉杆菌属(Porphyrobacter)、Methylophilus、不动杆菌属(Acinetobacter)、类诺卡氏属(Nocardioides)、孢鱼菌属(Sporichthya)、假单胞菌(Pseudomonas)及德沃斯氏菌属(Devosia)。在属水平下,不同处理样品的细菌群落结构组成基本相同,差异较大的是相对丰度。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)是5个样品中的优势细菌,其中,A3样品的丰度最大,为11.09%,其次是A4样品,丰度为9.31%,CK样品的丰度最小,为6.1%。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)细菌可用于芳香化合物的生物降解,加入咪唑乙烟酸后,可能促进了鞘氨醇单胞菌属细菌的增殖。其次是芽单胞菌属(Gemmatimonas),平均丰度为6.86%,而后是微小杆菌属(Exiguobacterium),平均丰度为5.96%,而其他前20属细菌平均丰度均在5%以下,其余已鉴定属合计平均丰度38.7%,占很大比例。
根据物种分类结果,由于样品中所检测出的微生物种类繁多,许多物种含量相对较少,因此选择细菌丰度前20的物种进行分类统计,如图3所示。由图3可知,从微生物分类的属水平角度来看,5个样品丰度前20个属的细菌有:鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、芽单胞菌属(Gemmatimonas)、微小杆菌属(Exiguobacterium)、Gaiella、Rhizomicrobium、红游动菌属(Rhodoplanes)、Saccharibacteria_genera_incertae_sedis、Phenylobacterium、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、Rhodoferax、Rudaea、溶杆菌属(Lysobacter)、假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)、产卟啉杆菌属(Porphyrobacter)、Methylophilus、不动杆菌属(Acinetobacter)、类诺卡氏属(Nocardioides)、孢鱼菌属(Sporichthya)、假单胞菌(Pseudomonas)及德沃斯氏菌属(Devosia)。在属水平下,不同处理样品的细菌群落结构组成基本相同,差异较大的是相对丰度。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)是5个样品中的优势细菌,其中,A3样品的丰度最大,为11.09%,其次是A4样品,丰度为9.31%,CK样品的丰度最小,为6.1%。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)细菌可用于芳香化合物的生物降解,加入咪唑乙烟酸后,可能促进了鞘氨醇单胞菌属细菌的增殖。其次是芽单胞菌属(Gemmatimonas),平均丰度为6.86%,而后是微小杆菌属(Exiguobacterium),平均丰度为5.96%,而其他前20属细菌平均丰度均在5%以下,其余已鉴定属合计平均丰度38.7%,占很大比例。3 讨论与结论
【参考文献】：
期刊论文
[1]猫爪草内生真菌的分离、鉴定及抑菌活性的初步研究[J]. 乔新荣,叶润,刘红云,张继英,陈琼. 黑龙江畜牧兽医. 2019(22)
[2]竹叶兰根系共生真菌群落结构及生物学功能初探[J]. 艾叶,谢泰祥,刘江枫,兰思仁,彭东辉,张清华. 菌物学报. 2019(10)
[3]麻山药不同生长时期根际土壤微生物多样性及群落结构特征[J]. 康捷,章淑艳,韩韬,孙志梅. 生物技术通报. 2019(09)
[4]降解菌短密木霉对土壤酶活性的影响[J]. 刘晴,董爱荣,邓世林,鲍彤,刘薇. 森林工程. 2019(03)
[5]高通量测序技术的研究进展[J]. 李妍,徐兴祥. 中国医学工程. 2019(03)
[6]除草剂微生物降解的研究进展[J]. 卢美名,尹雯悦,刘传龙,张茗茜,柳文睿,王新. 湖北农业科学. 2019(03)
[7]咪唑乙烟酸对花生后茬作物安全性评价[J]. 周超,路兴涛,张勇,马冲,吴翠霞,孔繁华. 花生学报. 2018(04)
[8]省域尺度油松人工林生产力与土壤养分关系研究[J]. 樊兰英,闫丽娟. 林业科技. 2018(06)
[9]土壤微生物分离与测定[J]. 董宏鑫,时铭泽. 吉林农业. 2018(20)
[10]三嗪类除草剂的全球市场及发展前景[J]. 柏亚罗,石凌波. 现代农药. 2018(03)
博士论文
[1]青藏高原青稞根腐类病害及其对根际土壤微生态的影响[D]. 李雪萍.甘肃农业大学 2017
硕士论文
[1]异恶草酮残留检测方法的建立及对土壤微生物的影响[D]. 戎丽丽.东北农业大学 2018
[2]大兴安岭天然林演替和人工林生长对于土壤微生物多样性动态的影响[D]. 牛晓燕.内蒙古农业大学 2017
[3]东北农田木霉菌的鉴定、酶活评价及其纤维素酶发酵工艺[D]. 林润泽.沈阳农业大学 2016
[4]接种费氏中华根瘤菌WGF03及其硫代谢突变体对大豆生长和根际细菌群落的影响[D]. 张健.广西大学 2014
本文编号：3577839
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/nykj/3577839.html
