基于高通量测序分析白云岩喀斯特土壤微生物多样性

发布时间：2024-05-13 23:23

　　利用白云岩喀斯特土壤微生物16S rRNA V4及ITS1区的高通量测序数据,分析土壤微生物群落结构特征。基于PICRUSt算法预测土壤微生物群落功能基因组,应用皮尔逊相关系数解析土壤性质与土壤微生物群落多样性及代谢通路的相关性。结果显示:白云岩喀斯特土壤微生物主要分布于15个菌门,其中以变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和接合菌门(Zygomycota)为最主要的优势菌门。基于PICRUSt功能基因预测,共获得6 208个同源功能基因(KEGG Orthology),富集于311条代谢通路(metabolism pathway)。其中与氨基酸代谢、碳水化合物代谢等有关的基因在种类和数量上都占预测功能基因中的绝对优势。相关性分析表明:土壤微生物多样性与土壤性质间存在相关性,尤其以土壤微生物多样性与Emg²⁺间相关性最为显著。61条代谢通路与土壤交换钙(ECa²⁺)、土壤有机碳(SOC...

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【部分图文】：

图1稀释曲线

本研究针对施秉白云岩喀斯特地区采集的11个土壤样品提取宏基因组DNA;基于Illumina平台,对16SrRNAV4区及ITS1区进行高通量测序;并对测序下机数据进行严格的质控处理,以97%的序列相似度作为分类阈值,对OTUs聚类。共获取901320条16SrRNAV4....

图2细菌分类树

由图3可知:基于门的分类水平分析,白云岩喀斯特土壤真菌群落主要包含4个菌门:子囊菌门、壶菌门(Chytridiomycota)、担子菌门和接合菌门。其丰度依次为53.2%±4.8、2.4%±0.7、18.2%±3.1、25.1%±3.5,其中以子囊菌门丰度最高,其物种组成也最为丰....

图3真菌分类树

利用Manteltest分析白云岩喀斯特土壤微生物群落与土壤性质之间的相关性。结果表明(见图4):在白云岩喀斯特土壤中,土壤微生物群落与土壤性质之间显著相关(P=0.034,P=0.041)。进一步利用皮尔逊相关系数分析不同门类微生物群落与土壤性质之间的相互关系,结果显示(见图....

图4土壤性质与微生物群落之间的相关性

图3真菌分类树2.4土壤性质与细菌代谢功能之间的相互作用

本文编号：3972864