疣蝗转录组分析

发布时间：2017-08-02 01:05

  本文关键词：疣蝗转录组分析

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【摘要】：疣蝗分布广泛,是一种常见的害虫,主要危害农作物,但分子信息缺乏。我们采用高通量Illumina测序技术和从头组装的方法获得了疣蝗转录组unigenes,并鉴定了天然免疫相关信号通路基因。本研究共获得疣蝗转录组unigenes 86 756个,平均长度为670 bp,N50为1 033 bp。使用六大数据库Nr、Nt、Swiss-Prot、GO、COG和KEGG注释疣蝗转录组unigenes,分别对应有29 627,13 866,23 398,13 474,11 968和21 027个unigenes获得注释。本研究共鉴定319个天然免疫信号通路相关的unigenes,其中,参与Toll通路的unigenes 49个,参与免疫缺失(IMD)通路的unigenes 13个,参与JAK-STAT信号通路的unigenes 117个,参与MAPK-fly通路相关的unigenes 58个,参与黑化(Melanization)通路的unigenes 82个。另外,我们还预测到了9 287个微卫星(SSRs)。本研究为疣蝗基因功能分析、免疫通路相关基因和分子标记的进一步研究提供了分子理论基础。
【作者单位】： 陕西师范大学生命科学学院;陕西学前师范学院生命科学与食品工程学院;
【关键词】： 疣蝗 转录组 天然免疫 SSRs
【基金】：国家自然科学基金(31372192)资助
【分类号】：S433
【正文快照】： De novo Assembly and Analysis of the Trilophidia annulata TranscriptomeQiu Zhongying1Liu Fei1,2Zhang Keyao1Huang Yuan1*1 College of Life Sciences,Shaanxi Normal University,Xi'an,710062;2 College of Life Sciences and Food Engineering,Shaanxi Xueqian Norma，

本文编号：606948