黄单胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析

发布时间：2017-09-10 18:18

  本文关键词：黄单胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析

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【摘要】：为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序(motif)的生物信息学分析,同时,对Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析。明确Xcr中存在3个Tss,分别命名为TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋结构,均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif,而就信号肽而言,仅TssC含有明显的信号肽序列。Xcr中的Tss与Xcc、Xca等黄单胞菌属病菌中的Tss具有较近的亲缘关系。
【作者单位】： 西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室;云南省林业科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室;
【关键词】： Xanthomonas campestris pv.raphani C Ⅵ型分泌系统 Ⅵ型分泌蛋白 黄单胞菌属
【基金】：云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特植物保护与繁育重点实验室开放基金项目(2016-05) 国家自然科学基金项目(31200488,31560211) 云南省科技计划项目(2015IA005) 云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK150004) 云南省教育厅科学研究基金项目(2014Y330)
【分类号】：S432.4
【正文快照】： 病原细菌与植物相互作用过程中,病原细菌为了有效地侵染植物,可通过分泌系统将分泌蛋白输入到寄主组织中,这些分泌蛋白作为效应分子具有操控植物防卫反应的功能[1]。目前,在细菌中已经发现有7种分泌系统,包括Ⅰ型分泌系统(typeⅠsecretion system,T1SS)到Ⅶ型分泌系统(typeⅦs

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本文编号：825881