禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析

发布时间：2017-09-28 04:19

  本文关键词：禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析

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【摘要】：基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,通过SMART保守结构域及遗传关系分析。结果表明:发现该菌存在4个典型的GPCR;4个GPCR在蛋白质二级结构上均含有典型的7跨膜结构域以及较高比例的α螺旋结构,均不含有明显的信号肽序列;在定位方面,4个GPCR均定位在质膜上;该菌中的GPCR与C.higginsianum、C.fioriniae等炭疽菌属中的病菌具有较高的同源序列以及较近的亲缘关系。
【作者单位】： 西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室;廊坊市文安县农业局;
【关键词】： 禾谷炭疽菌 G蛋白偶联受体 信号肽 二级结构 生物信息学
【基金】：国家自然科学基金项目(31560211)资助 云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK150004)资助 云南省教育厅科学研究基金项目(2014Y330)资助 云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(50097505)资助 云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队(2014015)资助
【分类号】：S432.4
【正文快照】： 禾谷炭疽菌(Colletotrichum graminicola)侵染小麦(Triticum aestivum)、高粱(Sorghum bicolor)等禾本科作物引起炭疽病,自20世纪70年代以来,由该菌引起的玉米(Zea mays)炭疽病在美国、印度等国就非常普遍,给各国农业造成巨大损失[1-7]。随着该菌全基因组序列的释放[8],目前,

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本文编号：933738