基于全基因组测序的禾谷炭疽菌中碳水化合物酶类蛋白预测

发布时间：2017-10-07 15:19

  本文关键词：基于全基因组测序的禾谷炭疽菌中碳水化合物酶类蛋白预测

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【摘要】：禾谷炭疽菌侵染玉米、小麦等农作物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大经济损失.基于前期研究结果,以630个分泌蛋白为基础序列,利用CAT预测程序,对上述蛋白进行碳水化合物酶类蛋白(CAZymes)的找寻,明确该菌中CAZymes含有267个,分为主要类别和复合类别两大类,前者包括89个GHs、53个CBMs以及41个AAs、28个CEs、11个PLs、2个GTs;后者则包括30个GHs/CBMs、10个AAs/CBMs、1个CEs/CBMs等.该研究为深入开展该病菌侵染植物的作用机制提供重要的理论基础.
【作者单位】： 西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室;
【关键词】： 全基因组测序 禾谷炭疽菌 碳水化合物酶类蛋白
【基金】：国家自然科学基金(31560211) 云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK150004) 云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(50097505) 云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队(2014015)
【分类号】：S432.4
【正文快照】：

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本文编号：988589