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[Co(phen) 2 hpip] 3+ 与DNA的相互作用及C 2 Al 4 异构体间动力学转变过程的理论研究

发布时间:2021-01-26 11:01
  本论文主要分为两个部分。第一部分里是在研究生期间通过分子力学模拟的方法计算了[Co(phen)2hpip]3+与正常及剪式错配序列DNA的相互作用。第二部分则研究了C2A14异构体间动力学转变过程的一些理论研究。在第一部分工作里,我们在本课题组以前工作的基础上,研究错配DNA的识别和修复问题,通过研究具有[M(phen)2L]n+形式的配合物插入并堆积到DNA双螺旋碱基对中,识别和修复错配DNA。本文重点研究了含Co配合物,配体为hpip在水溶液中与正常及错配DNA的相互作用和修复机理。本课题组之前已经就[Co(phen)2hpip]3+结构Ⅰ和结构Ⅱ型配合物在真空中、以及结构Ⅱ型在水溶液环境中与正常及错配DNA相互作用进行过研究和报道。本文中则主要计算结构Ⅰ型[Co(phen)2hpip]3+配合物在水溶液环境中与正常及错配DNA的相互作用。第一部分创新点如下:1、本文的模拟结果显示,[Co(phen)2hpip]3+对征常及剪式错配DNA都具有识别作用,识别过程体现了识别位点的特异性、异构体选择性和大小沟的选择性,对正常序列DNA的识别过程还体现了手性选择性。配合物与正常DNA的相... 

【文章来源】:山西大学山西省

【文章页数】:57 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 综述
    1.1 DNA的分子结构
        1.1.1 正常DNA的结构
        1.1.2 错配DNA的结构
        1.1.3 错配识别模型
            1.1.3.1 能量识别
            1.1.3.2 碱基滑移
            1.1.3.3 “夹-推-拉”模型
    1.2 DNA探针研究背景
        1.2.1 大环芳香配合物DNA探针
        1.2.2 天然小分子DNA探针
        1.2.3 寡聚酰胺序列DNA探针
        1.2.4 核酸链DNA探针
        1.2.5 基于吲哚的化合物DNA探针
    1.3 金属配合物与DNA相互作用的方式
        1.3.1 非共价结合
        1.3.2 共价结合
        1.3.3 剪切作用
        1.3.4 其它作用方式
    1.4 分子力学理论简介
    1.5 本文开展的工作
第二章 [Co(phen)2hpip]3+与DNA相互作用的分子力学研究
    2.1 概述
    2.2 计算模型和方法
        2.2.1 金属配合物的模型
        2.2.2 正常及错配DNA的模型
        2.2.3 计算方法
2hpip]3+与正常及错配DNA相互作用模拟结果">    2.3 [Co(phen)2hpip]3+与正常及错配DNA相互作用模拟结果
    2.4 结果分析与讨论
        2.4.1 结果分析
        2.4.2 讨论
            2.4.2.1 相互作用后的精细结果
            2.4.2.2 相互作用的选抒性和特异性
            2.4.2.3 详细的能量分析
        2.4.3 对剪式错配DNA的修复
            2.4.3.1 基于能量的思考
            2.4.3.2 结构分析
        2.4.4 水溶液环境与真空环境模拟的对比
    2.5 小结
2Al4异构体的动力学异构化过程研究">第三章 C2Al4异构体的动力学异构化过程研究
    3.1 研究背景
        3.1.1 平面碳化学简介
        3.1.2 平面碳化学的不足及近期进展
        3.1.3 本章拟开展工作及意义
    3.2 研究方法
    3.3 结果与讨论
        3.3.1 均方根偏差分析
        3.3.2 体系势能变化分析
    3.4 小结
第四章 总结和展望
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢


【参考文献】:
期刊论文
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[6]错配核酸识别修复的研究进展[J]. 陈绘丽,杨频.  化学进展. 2002(04)
[7]错配核酸的研究进展[J]. 陈绘丽,杨频.  化学进展. 2002(02)
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本文编号:3000995

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