材料微观结构演化大规模分子动力学软件比较
发布时间:2018-05-09 06:22
本文选题:分子动力学模拟 + 数据结构 ; 参考:《计算机科学与探索》2017年03期
【摘要】:分子动力学模拟是研究材料辐照效应下微观结构演化的重要工具。对4款主流材料计算大规模分子动力学开源软件LAMMPS、Ls1-MarDyn、IMD和CoMD进行了详细的介绍,从数据结构、计算方法、并行分解方式、原子存储等多个方面进行了横向分析比较。通过设计算例测试了各软件的计算效率、并行性能和内存使用情况。针对压力容器关键材料辐照缺陷演化计算特点,提出了设计节省存储空间的面向单晶的新型数据结构的设想,为后续实现大时空尺度分子动力学模拟研究提供了研究基础。
[Abstract]:The molecular dynamics simulation is an important tool to study the evolution of microstructure evolution under the irradiation effect of material . The calculation efficiency , parallel performance and memory usage of each software are compared from data structure , calculation method , parallel decomposition method and atom storage .
【作者单位】: 中国科学院计算机网络信息中心;北京科技大学计算机与通信工程学院;中国科学院计算技术研究所;中国原子能科学研究院;
【基金】:国家自然科学基金No.61303050 国家高技术研究发展计划(863计划)No.2015AA01A303 中国科学院青年创新促进会项目No.2015375;中国科学院信息化专项No.XXH2503-02~~
【分类号】:TB303;TP319
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