宫颈癌HPV突变数据库与分析平台的构建

发布时间：2021-01-14 10:02

　　人乳头瘤病毒（Human papillomavirus,HPV）是一种致癌DNA病毒,是导致尖锐湿疣和子宫颈癌的主要病因。研究表明病毒内的一些基因变异与宫颈癌的持续感染密切相关,基于临床突变分析HPV蛋白质的重点功能区域已成为HPV相关疾病的主要研究方向之一。目前,已发表的HPV数据库收集整理了 HPV相关的数据,但还未有HPV突变数据库的报道。本文以HPV的突变、功能结构域、表位为对象,结合临床疾病信息,构建了 HPV突变数据库以及其分析平台。具体工作如下:1.综述了人乳头瘤病毒和相关疾病的背景知识。简要介绍人乳头瘤病毒的分类、结构、功能、突变和表位,相关疾病的感染和预防等;综述了人乳头瘤病毒的分型预测模型、国内外HPV相关数据库的研究现状,为本文后续的研究工作提供了理论依据。2.设计了 HPV突变数据库与分析平台的解决方案。在平台设计和数据库设计原则的基础上,对HPV突变数据库与分析平台进行总体架构设计、数据库存储方式设计以及平台界面设计。针对数据库与分析平台的特殊问题,本文提出了合适的开发环境及相应的技术方法。3.构建了宫颈癌HPV突变数据库。收集并整理了 HPV的相关数据,包括... 

【文章来源】：浙江理工大学浙江省

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３．１．系统功能设计方案??Ｆｉｇｕｒｅ?３．１?Ｓｙｓｔｅｍ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｄｅｓｉｇｎ??设计宫颈癌ＨＰＶ突变数据库系统功能的前提是分析数据库内各类数据和内容之间的??

Ｆｉｇｕｒｅ?３．３?Ｓｔｏｒａｇｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｃｅｒｖｉｃａｌ?ｃａｎｃｅｒ?ＨＰＶ?ｍｕｔａｔｉｏｎ?ｄａｔａｂａｓｅ??２４??

例对宫颈癌ＨＰＶ突变分析平合的使用进行说明。??４．１平台框架设计??宫颈癌ＨＰＶ突变分析平台的框架设计如图４．１所示。图中列出的三类主要数据构成??ＨＰＶ突变分析平台的数据基础，五个功能模块为ＨＰＶ分析平台所提供，它们分别是：（ｉ）??突变含量可视化模块，利用颜色分明的交互式饼图向用户展示突变在数据库内所有蛋白质??中的含量、突变在数据库内所有功能域的含量、突变在数据库内Ｔ细胞表位和ＨＬＡ配体??内所占的比例；（Ｈ）突变与功能域关联分析视图模块，提供了用户所查询的蛋白质的基本??信息、蛋白质中己公布的突变信息、蛋白质内的功能域信息、蛋白质序列、二级结构域，??以及它们和突变关联的可视化展示；（Ｈｉ）突变与表位关联分析视图模块，与上个模块相似，??除了列举所选蛋白的基本信息、突变信息、序列信息以外，还增加了蛋白质内己鉴定的Ｔ??细胞表位或ＨＬＡ配体信息，以及和突变关联的可视化展示；（ｉｖ）序列相似性搜索模块，??向用户提供了数据库内的序列相似性搜索功能；（ｖ）ＨＰＶ分型预测模块

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：2976700