基于数据挖掘分析c-MET在胰腺癌中的表达及意义

发布时间：2021-02-05 18:46

　　目的:基于生物信息大数据挖掘分析c-MET（c-mesenchymal-epithelial transition）在胰腺癌中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine生物信息基因数据库,分析c-MET在胰腺癌中与其他基因共表达的情况;通过cBioportal,生物信息基因数据库分析c-MET的突变频率、突变位点;检索GEPIA数据库在不同数据库中胰腺癌与正常组织中c-MET的表达情况,分析其与胰腺癌病理分期的关系,并采用Kaplan-Meier分析c-MET表达与患者生存期的关系。免疫组织化学（IHC）检测分析50对临床胰腺癌患者癌组织与癌旁组织中c-MET蛋白表达情况。结果:实验结果显示前20个与c-MET共表达的基因,其最高关联值达到:0.900;通过对5个数据库中的1034个样本进行分析后,其突变频率分别为:2.75%（UTSW）,1.08%（TCGA）,0.54%（TCGA PanCan）,0.22%（QCMG）;在胰腺癌样本中,有9个非同义突变,其中有5个位于PKinase domain,分别位于L964M,D1002G,P1060S;GEPIA数据库的结果显示,c-ME... 

【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校

【文章页数】：40 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

-MET共表达基因的热点图

-MET在不同数据库的突变频率

图 4 c-MET 在不同肿瘤中的表达情况注：COAD: 结肠癌、DLBC: 淋巴样肿瘤弥漫性大 B 细胞淋巴瘤、LUAD：肺腺癌、OV：卵巢浆液性囊腺瘤、PAAD：胰腺癌、STAD：胃腺癌在前面的检索分析中发现，c-MET 在包括胰腺癌在内的多种类型恶性肿瘤组织中的表达显著高于对应的癌旁组织。为进一步分析 c-MET 与胰腺癌发生发

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3019401