转录组测序联合TCGA-BLCA数据库筛选膀胱癌预后相关分子标记物

发布时间：2021-04-15 08:41

　　[目的]运用第二代测序技术联合TCGA-BLCA数据库,从转录组层面筛选出膀胱癌预后相关的分子标记物,并探讨其调控膀胱癌进展的可能分子机制。[方法]收集2018年6月到2018年12月期间昆明医科大学第二附属医院泌尿外科行膀胱癌根治性切除术患者癌组织及癌旁组织进行转录组测序,测序结果联合TCGA-BLCA数据库,筛选关键预后基因,探讨这些基因在膀胱癌发生发展过程中的分子机制及临床意义。[结果]1.筛选出17个关键预后基因:ACOX2,ACTA2,ADRA2A,ATP1A2,BUB1B,CCL19,CXCL2,FOXM1,ITGA8,MAD2L1,MAP3K20,MCM4,NPR1,ORC1,PLK4,RASGRP2,TGFB3,这些基因主要参与内分泌系统,信号转导和细胞生长/死亡所涉及的通路。2.关键预后基因FOXM1显著影响膀胱癌患者总生存和无进展生存,差异有统计学意义（P<0.05）。3.FOXM1的临床病理特征:FOXM1与临床变量线性回归和Logistic回归均显示:年龄和分期与FOXM1之间有显著的关系（P<0.05）,性别、BMI、吸烟史、每年吸烟包数、淋巴结数... 

【文章来源】：昆明医科大学云南省

【文章页数】：61 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２为膀胱癌组织和癌旁组织总体的差舁表达分析基因聚类图，聚类分析??（Ｃｌｕｓｔｅｒ?Ａｎａｌｙｓｉｓ?）是一种研究样品间分类问题的统计分析方法，可以实现??，

组织表达量下调基因，红色表示为癌组织较癌旁组织表??达量上调基因。我们筛选出２０８３个显著差异表达基因信号分子，其中１１４４个基??因为癌组织较癌旁组织显著高表达，９３９个基因为癌组织较癌旁组织显著低表??达。??＾Ｔｍ?ｈ?叫?°°ｗｎ９３？?？?ｉ＾￣Ｕｐ：１１４４??■ａ?ｍ?ｍ?，?ｆｌｉｓｕ０？?ｉ?ｉ?？．：????ａ〇？?？?？?？?ｉ?ｉ?，??醒ＭＭ」＝ｒ?Ｉ??＾?？…負?ｆ：???ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ）??图２．总体的左异农达分析某Ｗ聚类图?图３．总体的益异农达分析苺Ｗ火山图??图４为不Ｎ病理分期（Ｔ１和Ｔ２?＋?Ｔ３）患者癌组织较癌旁组织基因差异表达??火山图，筛选标准如上述，图４ａ为Ｔ１期患者中共筛选出１７６１个显著差异表达??基因，其中１０００个基因为癌组织较癌旁组织显著高表达，７６１个基因为癌组织??较癌旁组织显著低表达；图４ｂ为Ｔ２＋Ｔ３期患者中共筛选出１６９８个显著差异表达??基因，其中１０７４个基因为癌组织较癌旁组织显著高表达，６２４个基因为癌组织??较癌旁组织显著低表达。??ｃｏ?■?Ｄｏｗｎ?７６１?Ｊ?Ｊ?Ｕｐ?１０００?４０?■?Ｄｏｗｎ?６２４?｜?Ｊ?Ｕｐ?１０７４??＊ｎ?－?Ｊ?＇?Ｉｒｔ?－??Ｓ：：Ｍ…Ｉ．…．．…＊：：：复麗—??ｒ－?－?Ｉ?Ｉ?ｆ?－?＊?＊??Ｏ?－?ＩＩ?Ｏ?－?Ｉ?Ｉ??＾?３?－２?１?０?＇?２?Ａ?６?＾?＾?－２?＇?６?＇?ｉ?４?Ｖ??ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ－ｃｈａｎｇｅ）?ｌｏｇ２（Ｔｏｌｄ－ｃｈａｎｇｏ）??图４ａ：?Ｔ】期？ｆ；？蜗异Ｗ

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【参考文献】：
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博士论文
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本文编号：3139007