目标-诱饵库搜索策略在蛋白质组质谱鉴定和质控中的应用及研究进展

发布时间：2018-03-28 00:33

本文选题：串联质谱　切入点：蛋白质鉴定　出处：《生物化学与生物物理进展》2016年07期

【摘要】：基于串联质谱的蛋白质组研究会产生海量的质谱数据,这些数据通常使用数据库搜索引擎进行鉴定分析,并根据肽段谱图匹配(PSM)反推真实的样品蛋白质.对于高通量蛋白质组数据的处理,其鉴定结果的可信是后续分析应用的前提,因此对鉴定结果的质量控制尤为重要,而基于目标-诱饵库(target-decoy)搜索策略的质量控制是目前应用最为广泛的方法.本文首先介绍了基于目标-诱饵库搜索策略搜库和质量控制的实施流程,然后综述了基于目标-诱饵库搜索策略的质量控制工具,并提出了目标-诱饵库搜索策略的不足及改善方法,最后对目标-诱饵库搜索策略进行了总结与展望.
[Abstract]:Proteomics studies based on tandem mass spectrometry produce vast amounts of mass spectrum data, which are usually identified and analyzed using database search engines. According to the peptide spectrum matching (PSM), the true sample proteins are inversely deduced. For the processing of high-throughput proteome data, the credibility of the identification results is the premise of subsequent analysis and application, so the quality control of the identification results is particularly important. However, quality control based on target-decoy) search strategy is the most widely used method at present. Firstly, this paper introduces the implementation flow of searching strategy and quality control based on target-decoy library. Then the quality control tools based on the target-decoy library search strategy are summarized, and the shortcomings and improvement methods of the target-decoy library search strategy are proposed. Finally, the target decoy library search strategy is summarized and prospected.
【作者单位】：重庆邮电大学生物信息学研究所;军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质药物国家工程研究中心北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京);
【基金】：国际合作计划(2014DFB30010) 国家重点基础研究发展计划(973)(2013CB910800) 国家自然科学基金(21475150,21105121,61501071)资助项目重庆市研究生科研创新项目(CYS14154)资助~~
【分类号】：Q503

【参考文献】