黄连中抗肿瘤生物碱的计算机虚拟筛选研究

发布时间：2021-07-11 04:31

　　运用计算机辅助药物设计寻找黄连抗肿瘤生物碱成分.以"黄连"为关键词,在TCMSP数据库中搜索生物碱类化学成分,从Pubchem数据库下载相应化合物结构;再从蛋白质数据库中下载与抗肿瘤作用明确的17个靶点蛋白,采用Sybyl软件中蛋白质预处理工具确定活性区域,应用Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score打分函数筛选出活性成分,采用Discovery Studio软件分析结合最好的蛋白复合体的相互作用力.筛选出具有较好结合活性的化合物9个,其中非洲防己碱、巴马亭、N-反式-阿魏酰酪胺具有多靶标活性;蛋白复合体的分析结果显示氢键、疏水作用力在对接中发挥着重要作用. 

【文章来源】：中南民族大学学报(自然科学版). 2020,39(02)

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

小檗碱与组蛋白去乙酰化酶分子对接效果图

非洲防己碱与17个靶蛋白进行分子对接后,与环氧合酶-2结合最好,Total score为7.5269(图2). 从图2c可以看出,疏水相互作用力在此对接中起重要作用;同时非洲防己碱与GLN192、PHE518、SER530形成了氢键,与SER353和GLN192形成C—H键.2.3.3 表小檗碱与3-磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1相互作用

N-反式-阿魏酰酪胺与17个靶蛋白进行分子对接后,与环氧合酶-2结合最好,Total score为8.7050;其对接效果见图7. 从图6c可以看出,疏水相互作用力在此对接中起重要作用;同时N-反式-阿魏酰酪胺与GLN192、PHE518、SER530形成氢键.图4 黄柏碱与Polo样激酶-2分子对接效果图

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于虚拟筛选的热毒宁抗HRV 3C蛋白酶抑制剂作用的研究[J]. 林子峰,黄新安,徐培平,符林春.  中药药理与临床. 2017(04)
[2]黄连活性成分的作用及机制研究进展[J]. 李彩虹,周克元.  时珍国医国药. 2010(02)
[3]黄连的药理研究进展[J]. 代国友,潘晓鸥,罗红霞.  中国药房. 2004(11)
[4]黄连的药理研究及现代应用[J]. 王秀杰.  中国药师. 2003(06)
[5]COX-2与肿瘤的关系[J]. 武爱文,顾晋,徐光炜.  中国肿瘤临床. 2002(08)

硕士论文
[1]黄连生物碱抗结肠癌作用实验及其分子机制研究[D]. 吴柯.重庆医科大学 2007



本文编号：3277342