学术信息聚合系统的特点和发展趋势

发布时间：2021-10-14 21:54

　　调研国内外医学文献学术信息聚合系统,剖析了现有系统的资源组织原理和特点,梳理了资源聚合的主要方法和模式。从用户需求理论的基本观点出发,探讨了学术信息聚合系统未来的发展趋势,旨在为学术信息聚合平台的聚合方法提供可靠的引导和参考。 

【文章来源】：中华医学图书情报杂志. 2020,29(08)

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

Coremine Medical平台的主题概念

Chilibot平台的检索界面

图2 Chilibot平台的检索界面生命医学领域中，对细胞功能的研究需要在系统层面了解和理解各种蛋白、基因之间的相互作用关系和信号传导通路[8]，并以前人的研究结果所揭示和注释的蛋白质功能和蛋白质之间的相互作用为基础。然而信息资料和呈现蛋白质之间相互作用信息的收集一直是一项需要大量查找、分析、注释和重组信息的过程和工作，需要研究人员耗费大量的时间和精力在相关的文献中通过人工阅读析出基因与蛋白、蛋白与蛋白之间的相互作用关系，从而预测或科学假设未知生物学进程中可能存在的靶点，以及调控、相互作用机制。String平台整合了多个功能基因组学生物信息库的资源(如Ref Seq参考序列数据库[9]、Ensembl基因组数据库项目[10])，对蛋白相似性数据(Similarity Matrix of Proteins,SIMAP[11])进行了相同基因信息的去重和完整性筛选。为了保证功能基因组的系统化，String平台还储备了交叉同源基因组学的信息库，可以提供微生物或有机生物内的基因相互作用信息。用户在String平台输入基因或蛋白名称即可得到蛋白质或基因相互作用的网络结构图，节点之间的连线分别链接了相互作用的证据，如图4中节点间不同颜色连线代表不同的证据，图5中节点间连线的粗细显示证据强度评分的高低。String平台旨在提供一站式的蛋白功能和相互作用关系的信息，将用户从信息梳理和整合工作中解放出来。String平台中呈现的蛋白或基因之间的网络图有多种形式，既有关联强度图，也有关联证据图。许多蛋白或基因的网络数据库(如SWISS Model Respository[12]、Uni Pot蛋白质数据库[13]、SMART蛋白结构域数据库[14]、Gene Cards数据库[15]等)都通过API接口连接到String平台，这些数据库中都有链接String平台的功能按钮。具有类似功能和内容的还有Gene Mania平台数据库[16]。

【参考文献】：
期刊论文
[1]图情领域聚合概念溯源及信息聚合研究进展[J]. 王志红.  图书馆论坛. 2019(01)
[2]信息聚合概念的构成与聚合模式研究[J]. 曹树金,马翠嫦.  中国图书馆学报. 2016(03)
[3]网络资源聚合研究综述[J]. 刘清堂,吴林静,黄焕.  情报科学. 2015(10)
[4]基于语义的数字资源超网络聚合研究[J]. 毕强,王传清,李洁.  情报科学. 2015(03)



本文编号：3436880