长薄鳅(Leptobotia elongata)野生资源分布及其种群遗传多样性研究
发布时间:2021-08-04 12:01
长薄鳅(Leptobotia elongate Bleeker)是中国特有鱼种,著名的观赏淡水鱼,主要分布在长江上游的干流及其支流。采用渔民调访、拖网调查和产卵江段的规模估算等方法,调查了长薄鳅在长江干流上游及其支流的分布和数量,结果表明我国长薄鳅资源在长江干流及其支流正在快速衰竭,走向濒危。为了分析长薄鳅野生种群结构并评估其遗传多样性,本研究测定了5个长薄鳅种群共110个样本的线粒体控制区(D-loop)序列(835bp),并进行比较分析,这些序列中,总共有49个变异位点,45个单倍型,单倍型多样性(h)和核苷酸多样性(π)分别是0.952和0.00454;样本间的平均遗传距离是0.0046±0.0010,群内的遗传距离和群间的遗传距离的变化分别是0.0033±0.0011至0.0050±0.0012和0.0037±0.0.0011至0.0050±0.001。Tajima’s D中性检验(-1.86383,P<0.01)和Fu’sFs检验(-25.92536,P<0.01)以及错配分布分析都表明,长薄鳅在最近历史上经历过种群扩张或瓶颈效应。分子变异分析(AMOVA)发现,...
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:124 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1 保护遗传学
1.1 物种保护遗传学研究概述
1.2 保护遗传学研究常用的分子标记
1.3 线粒体控制区
2 鱼类遗传多样性的研究方法
2.1 同工酶(isozyme)标记
2.2 限制性酶切片段长度多态性标记(RFLP)
2.3 随机扩增多态性DNA(RAPD)
2.4 扩增片段长度多态性(AFLP)
2.5 线粒体D-loop区域
2.6 主要组织相融性复合体(MHC)
2.7 微卫星DNA(microsatellite DNA)标记
3 长薄鳅研究概况
3.1 长薄鳅资源现状
3.2 长薄鳅生物学研究
3.3 长薄鳅的驯化与人工繁殖
4 本研究的目的与意义
第二章 长薄鳅野生资源分布调查
1 引言
2 方法
2.1 渔民调访
2.2 拖网调查
2.3 估算产卵江段及规模
3 结果
3.1 渔民调访结果
3.2 拖网调查
3.3 估算产卵江段及规模
4 讨论
第三章 长薄鳅线粒体DNA控制区序列变异及群体遗传多样性分析
1 引言
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 主要仪器
2.3 试剂及溶液
2.4 实验方法
2.5 数据分析
3 结果
3.1 长薄鳅基因组DNA抽提及PCR扩增
3.2 测序结果
3.3 序列多态性
3.4 种群遗传多样性
3.5 种群结构
3.6 种群历史动态
4 讨论
第四章 长薄鳅线粒体DNA全序列测定与分析
1 引言
2 材料和方法
2.1 实验材料
2.2 主要仪器及试剂
2.3 实验方法
2.4 序列拼接及分析
2.5 系统进化分析
3 结果与讨论
3.1 长薄鳅线粒体基因组的结构
3.2 长薄鳅线粒体蛋白质编码基因
3.3 核糖体RNA(rRNA)和转运RNA(tRNA)基因
3.4 非编码区
3.5 进化分析
第五章 长薄鳅人工繁育技术研究
1 引言
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.2 试验方法
3 结果
3.1 长薄鳅的繁殖力
3.2 长薄鳅的催产
3.3 长薄鳅受精卵的人工孵化
4 讨论
4.1 繁殖能力
4.2 催产效果
4.3 繁殖力与资源的保护增殖
第六章 结论与展望
1 结论
2 本研究旳创新点
3 有待进一步研究的问题
参考文献
致谢
附录
个人简介
攻读博士学位期间发表论文与专著
【参考文献】:
期刊论文
[1]野生长薄鳅驯化注意事项[J]. 黄颖颖,陈春娜,龙治海,陈先均. 科学养鱼. 2011(11)
[2]长薄鳅的卵巢发育和卵子发生[J]. 王志坚,殷江霞,张耀光. 淡水渔业. 2011(04)
[3]扬子鳄的保护遗传学研究进展[J]. 朱海涛,郑涛,吴孝兵. 四川动物. 2011(02)
[4]长薄鳅研究现状及保护对策[J]. 孙大东,杜军,周剑,何兴恒. 四川环境. 2010(06)
[5]海南长臂猿线粒体D-loop区序列分析及种群复壮[J]. 李志刚,魏辅文,周江. 生物多样性. 2010(05)
[6]长薄鳅(Leptobotia elongata)线粒体DNA控制区遗传多样性研究[J]. 赵刚,周剑,杜军,刘光迅,陈先均,朱健,李建林. 西南农业学报. 2010(03)
[7]长薄鳅疾病防治技术措施[J]. 伦峰,李峥. 河南水产. 2009(04)
[8]AFLP分子标记技术及其在水产动物中的应用[J]. 姚红伟,袁霞,付鑫,景娜娜. 现代渔业信息. 2009(07)
[9]分子标记的种类及其在作物遗传育种中的应用[J]. 陈兆波. 现代生物医学进展. 2009(11)
[10]DNA分子标记技术在水产养殖中的研究应用[J]. 杜皓月,杨凯,王凤敏. 河北渔业. 2009(05)
博士论文
[1]扬子鳄保护遗传学及线粒体基因组全序列研究[D]. 吴孝兵.南京师范大学 2001
硕士论文
[1]长薄鳅的性腺发育和生殖细胞的发生[D]. 殷江霞.西南大学 2006
本文编号:3321660
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:124 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1 保护遗传学
1.1 物种保护遗传学研究概述
1.2 保护遗传学研究常用的分子标记
1.3 线粒体控制区
2 鱼类遗传多样性的研究方法
2.1 同工酶(isozyme)标记
2.2 限制性酶切片段长度多态性标记(RFLP)
2.3 随机扩增多态性DNA(RAPD)
2.4 扩增片段长度多态性(AFLP)
2.5 线粒体D-loop区域
2.6 主要组织相融性复合体(MHC)
2.7 微卫星DNA(microsatellite DNA)标记
3 长薄鳅研究概况
3.1 长薄鳅资源现状
3.2 长薄鳅生物学研究
3.3 长薄鳅的驯化与人工繁殖
4 本研究的目的与意义
第二章 长薄鳅野生资源分布调查
1 引言
2 方法
2.1 渔民调访
2.2 拖网调查
2.3 估算产卵江段及规模
3 结果
3.1 渔民调访结果
3.2 拖网调查
3.3 估算产卵江段及规模
4 讨论
第三章 长薄鳅线粒体DNA控制区序列变异及群体遗传多样性分析
1 引言
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 主要仪器
2.3 试剂及溶液
2.4 实验方法
2.5 数据分析
3 结果
3.1 长薄鳅基因组DNA抽提及PCR扩增
3.2 测序结果
3.3 序列多态性
3.4 种群遗传多样性
3.5 种群结构
3.6 种群历史动态
4 讨论
第四章 长薄鳅线粒体DNA全序列测定与分析
1 引言
2 材料和方法
2.1 实验材料
2.2 主要仪器及试剂
2.3 实验方法
2.4 序列拼接及分析
2.5 系统进化分析
3 结果与讨论
3.1 长薄鳅线粒体基因组的结构
3.2 长薄鳅线粒体蛋白质编码基因
3.3 核糖体RNA(rRNA)和转运RNA(tRNA)基因
3.4 非编码区
3.5 进化分析
第五章 长薄鳅人工繁育技术研究
1 引言
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.2 试验方法
3 结果
3.1 长薄鳅的繁殖力
3.2 长薄鳅的催产
3.3 长薄鳅受精卵的人工孵化
4 讨论
4.1 繁殖能力
4.2 催产效果
4.3 繁殖力与资源的保护增殖
第六章 结论与展望
1 结论
2 本研究旳创新点
3 有待进一步研究的问题
参考文献
致谢
附录
个人简介
攻读博士学位期间发表论文与专著
【参考文献】:
期刊论文
[1]野生长薄鳅驯化注意事项[J]. 黄颖颖,陈春娜,龙治海,陈先均. 科学养鱼. 2011(11)
[2]长薄鳅的卵巢发育和卵子发生[J]. 王志坚,殷江霞,张耀光. 淡水渔业. 2011(04)
[3]扬子鳄的保护遗传学研究进展[J]. 朱海涛,郑涛,吴孝兵. 四川动物. 2011(02)
[4]长薄鳅研究现状及保护对策[J]. 孙大东,杜军,周剑,何兴恒. 四川环境. 2010(06)
[5]海南长臂猿线粒体D-loop区序列分析及种群复壮[J]. 李志刚,魏辅文,周江. 生物多样性. 2010(05)
[6]长薄鳅(Leptobotia elongata)线粒体DNA控制区遗传多样性研究[J]. 赵刚,周剑,杜军,刘光迅,陈先均,朱健,李建林. 西南农业学报. 2010(03)
[7]长薄鳅疾病防治技术措施[J]. 伦峰,李峥. 河南水产. 2009(04)
[8]AFLP分子标记技术及其在水产动物中的应用[J]. 姚红伟,袁霞,付鑫,景娜娜. 现代渔业信息. 2009(07)
[9]分子标记的种类及其在作物遗传育种中的应用[J]. 陈兆波. 现代生物医学进展. 2009(11)
[10]DNA分子标记技术在水产养殖中的研究应用[J]. 杜皓月,杨凯,王凤敏. 河北渔业. 2009(05)
博士论文
[1]扬子鳄保护遗传学及线粒体基因组全序列研究[D]. 吴孝兵.南京师范大学 2001
硕士论文
[1]长薄鳅的性腺发育和生殖细胞的发生[D]. 殷江霞.西南大学 2006
本文编号:3321660
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/zylw/3321660.html