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长薄鳅(Leptobotia elongata)野生资源分布及其种群遗传多样性研究

发布时间:2021-08-04 12:01
  长薄鳅(Leptobotia elongate Bleeker)是中国特有鱼种,著名的观赏淡水鱼,主要分布在长江上游的干流及其支流。采用渔民调访、拖网调查和产卵江段的规模估算等方法,调查了长薄鳅在长江干流上游及其支流的分布和数量,结果表明我国长薄鳅资源在长江干流及其支流正在快速衰竭,走向濒危。为了分析长薄鳅野生种群结构并评估其遗传多样性,本研究测定了5个长薄鳅种群共110个样本的线粒体控制区(D-loop)序列(835bp),并进行比较分析,这些序列中,总共有49个变异位点,45个单倍型,单倍型多样性(h)和核苷酸多样性(π)分别是0.952和0.00454;样本间的平均遗传距离是0.0046±0.0010,群内的遗传距离和群间的遗传距离的变化分别是0.0033±0.0011至0.0050±0.0012和0.0037±0.0.0011至0.0050±0.001。Tajima’s D中性检验(-1.86383,P<0.01)和Fu’sFs检验(-25.92536,P<0.01)以及错配分布分析都表明,长薄鳅在最近历史上经历过种群扩张或瓶颈效应。分子变异分析(AMOVA)发现,... 

【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】:124 页

【学位级别】:博士

【文章目录】:
摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1 保护遗传学
        1.1 物种保护遗传学研究概述
        1.2 保护遗传学研究常用的分子标记
        1.3 线粒体控制区
    2 鱼类遗传多样性的研究方法
        2.1 同工酶(isozyme)标记
        2.2 限制性酶切片段长度多态性标记(RFLP)
        2.3 随机扩增多态性DNA(RAPD)
        2.4 扩增片段长度多态性(AFLP)
        2.5 线粒体D-loop区域
        2.6 主要组织相融性复合体(MHC)
        2.7 微卫星DNA(microsatellite DNA)标记
    3 长薄鳅研究概况
        3.1 长薄鳅资源现状
        3.2 长薄鳅生物学研究
        3.3 长薄鳅的驯化与人工繁殖
    4 本研究的目的与意义
第二章 长薄鳅野生资源分布调查
    1 引言
    2 方法
        2.1 渔民调访
        2.2 拖网调查
        2.3 估算产卵江段及规模
    3 结果
        3.1 渔民调访结果
        3.2 拖网调查
        3.3 估算产卵江段及规模
    4 讨论
第三章 长薄鳅线粒体DNA控制区序列变异及群体遗传多样性分析
    1 引言
    2 材料与方法
        2.1 实验材料
        2.2 主要仪器
        2.3 试剂及溶液
        2.4 实验方法
        2.5 数据分析
    3 结果
        3.1 长薄鳅基因组DNA抽提及PCR扩增
        3.2 测序结果
        3.3 序列多态性
        3.4 种群遗传多样性
        3.5 种群结构
        3.6 种群历史动态
    4 讨论
第四章 长薄鳅线粒体DNA全序列测定与分析
    1 引言
    2 材料和方法
        2.1 实验材料
        2.2 主要仪器及试剂
        2.3 实验方法
        2.4 序列拼接及分析
        2.5 系统进化分析
    3 结果与讨论
        3.1 长薄鳅线粒体基因组的结构
        3.2 长薄鳅线粒体蛋白质编码基因
        3.3 核糖体RNA(rRNA)和转运RNA(tRNA)基因
        3.4 非编码区
        3.5 进化分析
第五章 长薄鳅人工繁育技术研究
    1 引言
    2 材料与方法
        2.1 试验材料
        2.2 试验方法
    3 结果
        3.1 长薄鳅的繁殖力
        3.2 长薄鳅的催产
        3.3 长薄鳅受精卵的人工孵化
    4 讨论
        4.1 繁殖能力
        4.2 催产效果
        4.3 繁殖力与资源的保护增殖
第六章 结论与展望
    1 结论
    2 本研究旳创新点
    3 有待进一步研究的问题
参考文献
致谢
附录
个人简介
攻读博士学位期间发表论文与专著


【参考文献】:
期刊论文
[1]野生长薄鳅驯化注意事项[J]. 黄颖颖,陈春娜,龙治海,陈先均.  科学养鱼. 2011(11)
[2]长薄鳅的卵巢发育和卵子发生[J]. 王志坚,殷江霞,张耀光.  淡水渔业. 2011(04)
[3]扬子鳄的保护遗传学研究进展[J]. 朱海涛,郑涛,吴孝兵.  四川动物. 2011(02)
[4]长薄鳅研究现状及保护对策[J]. 孙大东,杜军,周剑,何兴恒.  四川环境. 2010(06)
[5]海南长臂猿线粒体D-loop区序列分析及种群复壮[J]. 李志刚,魏辅文,周江.  生物多样性. 2010(05)
[6]长薄鳅(Leptobotia elongata)线粒体DNA控制区遗传多样性研究[J]. 赵刚,周剑,杜军,刘光迅,陈先均,朱健,李建林.  西南农业学报. 2010(03)
[7]长薄鳅疾病防治技术措施[J]. 伦峰,李峥.  河南水产. 2009(04)
[8]AFLP分子标记技术及其在水产动物中的应用[J]. 姚红伟,袁霞,付鑫,景娜娜.  现代渔业信息. 2009(07)
[9]分子标记的种类及其在作物遗传育种中的应用[J]. 陈兆波.  现代生物医学进展. 2009(11)
[10]DNA分子标记技术在水产养殖中的研究应用[J]. 杜皓月,杨凯,王凤敏.  河北渔业. 2009(05)

博士论文
[1]扬子鳄保护遗传学及线粒体基因组全序列研究[D]. 吴孝兵.南京师范大学 2001

硕士论文
[1]长薄鳅的性腺发育和生殖细胞的发生[D]. 殷江霞.西南大学 2006



本文编号:3321660

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