四种基因定量方法对实时荧光PCR与微滴式数字PCR检测霍乱弧菌基因表达量的分析

发布时间：2017-10-30 16:15

  本文关键词：四种基因定量方法对实时荧光PCR与微滴式数字PCR检测霍乱弧菌基因表达量的分析

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【摘要】：基因表达量测定对基因功能解析和探索生命机理具有重大意义,目前实时荧光PCR和微滴式数字PCR技术是进行基因表达量测定的有效方法。本文以低温处理的霍乱弧菌sfs、vcc、Rec A、hly及16S r RNA基因为研究对象,分别用实时荧光PCR和微滴式数字PCR技术对低温处理前后霍乱弧菌的上述基因表达量进行测定,实时荧光PCR实验数据分别采用??CT和ge Norm法进行分析,微滴式数字PCR实验数据分别采用相对定量和绝对定量法进行分析,获得处理组基因表达量相对于对照组的变化倍数;使用多维尺度法来分析四种基因定量方法的数据。结果表明,在本实验条件下,四种基因定量方法的分析结果存在差异;16S r RNA基因表达量发生了变化,不适合作为内参基因;微滴式数字PCR能更直观的给出基因表达量变化的结果,并且基因表达差异相对定量分析的准确度更高。
【作者单位】： 山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心食品农产品检测中心;威海出入境检验检疫局;
【关键词】： 基因表达 实时荧光定量PCR 微滴式数字PCR
【基金】：国家质检总局科研计划(2012IK305,2013IK175,2014IK114)
【分类号】：R440
【正文快照】： 霍乱弧菌(Vibrio cholerae)是弧菌科的主要致病菌,是引起霍乱的病原菌,每年影响数以万计人。霍乱弧菌细菌分类学和分子流行病学的研究,越来越重视霍乱弧菌特定基因表达量的检测。因为基因表达差异会影响细菌的某些重要遗传性状,如细菌的生理结构、致病性和耐药性等。DNA分子扩

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本文编号：1118368