柳州市重症手足口病病原谱及肠道病毒71型VP1基因分析
本文关键词:柳州市重症手足口病病原谱及肠道病毒71型VP1基因分析 出处:《现代预防医学》2017年11期 论文类型:期刊论文
【摘要】:目的分析柳州市重症手足口病病原谱构成,了解引起重症手足口病的肠道病毒71型(EV71)VP1的基因特征。方法收集柳州市2015年临床诊断重症手足口病病例标本,使用逆转录聚合酶链反应技术(RT-PCR)和DNA测序技术对病例标本进行肠道病毒核酸检测,并用MEGA 5.0对EV71 VP1基因进行分析。结果 67例临床诊断重症手足口病病例标本中,肠道病毒核酸阳性49例,其中EV71阳性11例、Cox A16阳性3例、Cox A2阳性17例、Cox A4阳性2例、Cox A6阳性9例、Cox A10阳性3例及其它肠道病毒4例;11株EV71毒株VP1核苷酸同源性为94.3%~100.0%,氨基酸同源性为98.3%~100.0%;通过与各亚型代表株进行同源性比较及构建系统进化树发现,11株EV71毒株均属于C4a亚型,在VP1区存在共变异现象的6个氨基酸位点上模式为KADSTV,在3个中和抗原决定簇上,除毒株15LZ-58在163位存在差异外,其余10株毒株均高度保守。结论柳州市重症手足口病病原谱复杂,主要病原体为Cox A2及EV71,其次为Cox A6;病原体EV71均属于C4a亚型,VP1基因片段较保守,没有发生较大的有意突变。
[Abstract]:Objective To investigate the genetic characteristics of 71 ( EV71 ) VP1 gene of severe hand and foot diseases in Liuzhou City . The results showed that 71 strains of EV71 were detected by RT - PCR and DNA sequencing . The results showed that the strains of EV71 were positive in 11 , Cox ' A16 positive in 3 , Cox ' A2 positive in 17 , Cox A4 positive in 2 , Cox A6 positive in 9 , Cox A10 positive in 3 cases and other enteroviruses in 4 cases .
【作者单位】: 柳州市疾病预防控制中心微生物检验科;
【基金】:广西自然科学基金项目(2014GXNAFBA118179) 广西卫生厅立项课题(Z2014568);广西卫生厅立项课题(Z2013634)
【分类号】:R440;R725.1
【正文快照】: 手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)是由多种肠道病毒引起的婴幼儿常见急性传染病,个别重症患者因并发呼吸系统、神经系统等疾病而导致死亡[1]。随着各地手足口病爆发流行,我国于2008年5月2日将手足口病纳入《中华人民共和国传染病防治法》规定报告的丙类传染病管理,
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,本文编号:1368295
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