引起甘肃省一起病毒性脑炎疫情的ECHO30全基因组序列分析
本文关键词：引起甘肃省一起病毒性脑炎疫情的ECHO30全基因组序列分析 出处：《病毒学报》2017年04期 论文类型：期刊论文
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【摘要】：为了解引起2015年甘肃省酒泉市瓜州县病毒性脑炎疫情的ECHO30的基因特点,分析其重组变异和进化规律,对从患者脑脊液标本中分离到的3株ECHO30进行全基因序列测定和分析,采用Simplot3.5.1软件进行重组分析,并利用MEGA6.0软件构建系统进化树。结果表明,本次疫情中分离到的ECHO30与E30/SD/2010/CHN株的相似度最高(92%~99%)。重组分析表明甘肃ECHO30株在非结构蛋白区P2区和P3区出现了多处重组现象。由于对当地流行的肠道病毒谱不清楚,虽然发现此次流行的病毒存在重组,但是对重组片段的来源尚不明确,因此需要加强对甘肃省流行肠道病毒的本底调查工作和遗传背景的研究工作。
[Abstract]:In order to understand the gene characteristics of viral encephalitis caused by viral encephalitis in Guazhou County of Jiuquan City Gansu Province in 2015 the recombination variation and evolution were analyzed. Three strains of ECHO30 isolated from cerebrospinal fluid (CSF) were sequenced and analyzed by Simplot3.5.1 software. The phylogenetic tree is constructed by using MEGA6.0 software. The results show that. The ECHO30 isolated from the epidemic had the highest similarity with E30 / SDR / 2010 / CHN strain. Recombination analysis showed that there were many recombination phenomena in P2 and P3 regions of non-structural protein region of Gansu ECHO30 strain. Although the recombination was found in this epidemic virus, the source of the recombinant fragment is still unclear. Therefore, it is necessary to strengthen the background investigation and genetic background study of the epidemic enterovirus in Gansu province.
【作者单位】： 甘肃省疾病预防控制中心;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒和病毒病重点实验室;瓜州县疾病预防控制中心;
【基金】：国家“十二五”艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项(项目号:2012ZX10004-208),题目:甘肃及周边省区传染病病原谱流行规律研究 2014年甘肃省卫生行业科研计划管理项目(项目号:GWGL2014-75),题目:甘肃省手足口病病原变异变迁研究~~
【分类号】：R440;R512.3
【正文快照】： 病毒性脑炎(Virus encephalitis,VE)是一种常见的中枢神经系统感染性疾病,该病重症病死率高,易造成不同程度的神经系统后遗症[1],是严重影响世界公共卫生的主要疾病之一。引起病毒性脑炎的病毒种类较多,根据之前的国内外报道有130多种病毒可引起脑炎病变[1,2]。其中人类肠道病
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，本文编号：1404614
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