碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌分子分型研究

发布时间：2020-04-07 22:25

【摘要】：目的:探讨三种不同分子分型方法脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点序列分析(MLST)及核心基因组多位点序列分析(cgMLST)在碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌(CRAB)溯源中的应用,揭示其流行播散规律。方法:收集2016～2018年间来源于我国浙江省台州地区三家医院、并经微量肉汤稀释法复核药敏结果的CRAB菌株,运用PCR及测序方法验证常见的碳青霉烯酶基因(blaOXA-23、blaOXA-24和blaOXA-58)携带情况,运用PFGE进行同源性分析并挑选出同一 PFGE型的主要克隆菌株,运用全基因组测序(WGS)技术对主要克隆菌株进行测序;应用测序结果分析研究菌株的耐药基因携带情况、MLST型以及cgMLST型;结合不同cgMLST分型菌株间的差异和患者临床资料,绘制临床播散路径图。结果:研究期间共收集到149株CRAB菌株,其中146株(98%)携带blaOXA23、2株携带blaOXA-58、1株未检测到这三种常见碳青霉烯酶耐药基因,所有菌株均未检测有携带blaOXA-24。PFGE将菌株分成15个脉冲型(A到O),A型共73株(49%),为主要克隆菌株。A型菌株全基因组测序分析结果显示:所有菌携带blaOXA-23、blaADC-25、aph(6)-ld及strA,70%菌株携带 blaTEM-1、arm、aph(3')-Ia、msr(E)、mph(E)、tet(B)。MLST分型显示这73株均为ST2型(Pasteur方案),根据Oxford方案,共有 6 个 ST 型:ST195、ST208、ST136、ST369、ST784、STnovel(新的ST型);cgMLST分型可将73株菌分成9个簇,其中最大簇占比46.6%(34/73)。结合临床资料发现这73株菌株大部分患者存在转床或者部分患者存在同一家医院转入的情况,有4个cgMLST簇分离自同一家医院同一个科室。结论:cgMLST较PFGE及MLST具有更高的分辨率,在CRAB溯源研究方面具有更高的应用价值。cgMLST结果揭示携带CRAB的患者在不同医院或不同科室间的转移为CRAB流行播散的重要危险因素。
【图文】：

浙江大学硕士学位论文逦实验结果逡逑４实验结果逡逑４．１菌株基本情况及药物敏感性逡逑４．１．１菌株来源及标本类型逡逑本研究共收集２０１６年６月２１日至２０１８年３月４日从浙江省台州地区三家医逡逑院收集的非重复性碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌（ＣＲＡＢ）邋１４９株，包括台州医院８５逡逑株，，台州市立医院４５株，温岭市第一人民医院１９株。标本类型可分为７种，痰逡逑液占绝大部分，具体见图４．１。患者年龄分布总体偏大，６０岁以上１１３例（７５．８％），逡逑４０岁以下仅７例（４．７％），见图４．２。所有菌株来源于三家医院１４个不同科室，各逡逑家医院均以ＩＣＵ分离率最高，神经外科其次，具体见图４．３。逡逑

4研究菌株年龄分布图
【学位授予单位】：浙江大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R446.5

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本文编号：2618463