基于自适应P值方法的有序性状与罕见变异的关联探测

发布时间：2020-05-16 14:55

【摘要】：新一代基因测序技术不仅为人类基因组结构变异的检测提供了新方法,也为我们提供了大量的罕见变异遗传数据,如何通过已有数据检验出罕见变异与人类复杂疾病的关联性引起了人们越来越多的关注.在医学领域,许多人的健康状况和疾病状况都用有序响应变量来衡量,即用每个性状的取值来描述疾病的发展阶段或严重程度.然而,当前大多数检验罕见变异与复杂疾病关联性的方法都是处理两值性状和连续型性状的,有序性状的关联分析方法相对较少,而把有序性状当作两值性状或连续型性状来考虑必然会损失原始数据中一些有价值的信息.因此,在本文中,我们扩展了ADA方法,提出了一种专门用来检验罕见变异和有序性状关联性的方法,简称OR-ADA方法.在我们的方法中,对于有序响应变量建立了累积Logistic回归模型,利用Newton-Raphson迭代对关联系数进行估计,并通过对参数的似然比检验进行关联分析的研究.通过大量的模拟研究和与其他方法的比较,结果显示我们提出的方法对于因果变异方向的影响是稳健的,并且在很多情况下有更高的功效.
【学位授予单位】：黑龙江大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R440

【参考文献】

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本文编号：2666906