江西省新型隐球菌遗传型、居群遗传变异和药物敏感性的研究

发布时间：2020-05-19 15:47

【摘要】：目的:1.探讨江西省新型隐球菌的基因型组成、分子流行病学特征和体外药物敏感性,丰富我国隐球菌的流行病学数据;2.了解本地区分离的新型隐球菌基因型在全球的分布情况,同时分析我国不同地区间新型隐球菌遗传变异关系,追溯可能的传播/突变起源。方法:收集2016年1月-2017年11月江西省多家医院住院患者首次分离的新型隐球菌86株;采用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)、特异性引物SOD1和刀豆氨酸-甘氨酸-溴麝香草酚蓝(CGB)培养基对所有菌株进行菌种鉴定;ATB~(TM)Fungus3试剂盒测定86株隐球菌对5种常用抗真菌药物氟康唑(FCA)、5-氟胞嘧啶(5FC)、伊曲康唑(ITR)、伏立康唑(VRC)和两性霉素B(AMB)的体外敏感性;聚合酶链反应(PCR)扩增特异产物SOD1和STE20(STE20Aa、STE20Aα、STE20Da和STE20Dα)确定86株菌的基因型、血清型和交配型;多位点序列分型(MLST)对所有菌株进行同源性分析,同时应用eBURST软件对分型结果进行亲缘关系分析;利用MEGA 7.0软件对7个管家基因(CAP59、GPD1、IGS1、LAC1、PLB1、SOD1和URA5)的串联序列进行系统发育分析;GenAlEx 6.5软件统计全国数据,分析不同地区间新型隐球菌的遗传变异关系。结果:共收集来自江西省14个地区的新型隐球菌86株,绝大多数(76.7%;66/86)来自免疫抑制/缺陷的患者,其中有35株(40.7%)来自HIV患者;所有菌株对5种抗真菌药物均敏感,但在不同ST型菌株间,甚至在相同ST型菌株间,其最小抑菌浓度(MIC)值仍存在明显差异;86株隐球菌均为血清型A,交配型α(MATα),基因型VNⅠ;MLST分型共检出8种ST型,包括2个新的ST型(ST226和ST319),6个在我国其他地区/国外均有报道的ST型(ST5、ST31、ST32、ST139、ST186和ST359);种群结构分析发现这8种ST型属于同一克隆群,其中ST5型是江西省主要的遗传型(84.9%;73/86);MLST揭示的18个等位基因在江西省以外地区都有发现,无特异性;系统发育分析显示ST5、ST186、ST359、ST31和ST32在遗传学上相似;居群遗传关系分析猜测江西省发现的ST型可能是由中国内外其他地区传播而来或者由江西省其他ST型突变而来。结论:江西省大多数隐球菌病患者潜在的危险因素与免疫力低下有关;ST5是江西省和我国其他地区主要的遗传型;在中国大多数地区,可通过地理长距离传播的方式来形成独特的ST型;持续的隐球菌监测对了解隐球菌动态变化很有必要。
【图文】：

江西省86株新型隐球菌临床资料

种ST型分布比例
【学位授予单位】：南昌大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R446.5

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 贾永;;X线与多层螺旋CT诊断新型隐球菌肺炎的价值比较[J];临床医学;2018年04期

2 熊克宫;陈丽芳;柯坤宇;孔金峰;;新型隐球菌性腹膜炎1例[J];实用临床医学;2014年10期

3 常敏;;儿童新型隐球菌肺炎并脑膜炎诊治体会[J];现代中西医结合杂志;2013年11期

4 伍国伟;;肺结核并发新型隐球菌肺炎的CT表现[J];中国防痨杂志;2006年05期

5 黄琪,胡申江;新型隐球菌肺炎1例[J];浙江医学;2004年04期

6 孙恭慧;新型隐球菌性脑膜炎15例误诊原因分析[J];中国综合临床;2003年12期

7 Wieland Meyer ,徐国英;从IberoAmerican分离的新型隐球菌的分子类型[J];中国人兽共患病杂志;2003年05期

8 陈红岩 ,陈梅根;脑脊液中新型隐球菌计数检查在临床的应用(附51例报告)[J];福建医药杂志;2003年05期

9 陈梅根,陈红岩,何爱华;新型隐球菌透射电镜的分型鉴定[J];中国人兽共患病杂志;2002年04期

10 虞建昂;新型隐球菌检验的一种简易试剂[J];江西医学检验;2002年03期

相关会议论文 前10条

1 杨辉红;郑霞;聂成刚;徐芳丽;;从血液中检出新型隐球菌一例误诊报告[A];湖北省暨武汉市微生物学会分析微生物专业委员会第十届第五次学术会议论文汇编[C];2008年

2 柳承福;;新型隐球菌引起脑脊液感染1例报告[A];2007年浙江省医学检验学学术年会论文汇编[C];2007年

3 孙继梅;王艳玲;周秀珍;郑伟;张智洁;刘勇;;新型隐球菌深部感染的临床特点及实验室检测[A];中华医学会第九次全国检验医学学术会议暨中国医院协会临床检验管理专业委员会第六届全国临床检验实验室管理学术会议论文汇编[C];2011年

4 齐晓涟;张倩;白杨;贾东岗;陆红柳;张运周;;3例新型隐球菌脑膜脑炎联合用药合理性分析[A];第二届全国药物性损害与安全用药学术会议——抗感染药物不良反应与临床安全应用专题研讨会论文汇编[C];2010年

5 沈思钰;;系统性红斑狼疮合并新型隐球菌脑膜脑炎1例报告[A];全国危重病急救医学学术会议论文汇编[C];2007年

6 杨辉红;郑霞;聂成刚;徐芳丽;;从血液中检出新型隐球菌一例误诊报告[A];中国微生物学会《第二届全国农业微生物研究及产业化研讨会》和《第十一届全国杀虫微生物学术研讨会》暨《湖北省暨武汉市微生物学会和内蒙古微生物学会2008年会》论文摘要[C];2008年

7 阮亚飞;;1例新型隐球菌脑膜脑炎病人的护理体会[A];全国外科、神经内外科护理学术交流暨专题讲座会议论文汇编[C];2006年

8 金鑫;魏世辉;;新型隐球菌性脑膜炎的眼部表现[A];中华医学会第十二届全国眼科学术大会论文汇编[C];2007年

9 张米;雷素云;高丽;;艾滋病患者培养检出新型隐球菌的分布特点及其耐药分析[A];中华医学会2014全国微生物学与免疫学学术年会论文汇编[C];2014年

10 秦琴;王慧;刘云;李腾达;王静;邓安梅;;隐球菌脑膜炎患者外周血单个核细胞中BLyS表达减低及其对新型隐球菌的增殖效率影响[A];第九届全国免疫学学术大会论文集[C];2014年

相关重要报纸文章 前3条

1 陈勇;新型隐球菌基因组图谱绘制成功[N];医药经济报;2005年

2 马吕红;何谓“饲鸟病”[N];中国老年报;2000年

3 深圳商报记者　王美华 李薇;即使到了晚期也有治疗希望[N];深圳商报;2006年

相关硕士学位论文 前10条

1 陈艳慧;江西省新型隐球菌遗传型、居群遗传变异和药物敏感性的研究[D];南昌大学;2018年

2 索晨浩;新型隐球菌中镁离子转运体的研究[D];东北大学;2016年

3 李焱剑;系统性分析新型隐球菌铜离子稳态对真菌毒性的影响[D];东北大学;2016年

4 高婷;氟康唑在新型隐球菌脑膜（脑）炎大鼠模型中血—脑屏障转运机制研究[D];中国人民解放军医学院;2015年

5 苏晓霁;siRNA表达载体介导的RNA干扰抑制新型隐球菌cap10基因的表达[D];福建医科大学;2009年

6 宋琳琳;36例新型隐球菌脑膜炎的临床资料分析[D];大连医科大学;2011年

7 汪春绢;新型隐球菌脑膜炎临床疗效观察与动物实验[D];华中科技大学;2006年

8 尤校雷;新型隐球菌FQ-PCR检测体系在血流感染动物模型的应用研究[D];河北医科大学;2016年

9 （辶居）红珍;新型隐球菌脑膜炎的治疗疗效观察[D];浙江大学;2010年

10 陶星辰;云南部分地区鸽粪中新型隐球菌的分离与鉴定及其血清型、配型初步研究[D];大理学院;2015年

，

本文编号：2671116