ApoE、ADH1B rsl229984和ALDH2 rs671基因多态性与内蒙古汉族人群阿尔茨海默病发病相关性研究

发布时间：2020-05-26 08:56

【摘要】：背景阿尔茨海默病(AD)是痴呆最常见的原因,病因和发病机制尚不确切,临床上缺少有效的治疗方法。AD发病可能是环境和遗传因素共同作用的结果,其中遗传因素在AD中很关键。因此,基因检测在AD病因研究中具有重要地位。了解AD发病相关的潜在基因,对于进一步促进临床分子诊断有很大帮助。载脂蛋白E(ApoE)基因是目前世界范围内公认与AD发病相关的基因。除此之外,也有认为机体对酒精的代谢可能与AD发病有关,而乙醇脱氢酶系(ADH)和乙醛脱氢酶系(ALDH)是酒精代谢过程中的关键酶。ADH及ALDH基因的多态性,已被证明与多种神经退行性疾病的易感性有关,但在不同地区、种族中得到的结论并不一致。内蒙古自治区位于中国北部,是蒙古族和汉族居住较多的地方,内蒙古地区的汉族与其他民族相比有不同的遗传背景,可能在AD病因以及分子病理学方面与存在差异。内蒙古地区气候寒冷,汉族有不同的生活及饮食习惯,对酒精的摄入较多。因此,研究不同种族及人群AD的ADH和ALDH基因多态性有其临床价值。目的1.通过检测内蒙古地区汉族人群中ApoE基因表达,验证该人群中ApoE基因多态性与散发性阿尔茨海默病(sAD)发病的相关性。2.通过检测内蒙古地区汉族人群中ADH1B rs1229984基因多态性,了解该人群中ADH1B rs1229984与sAD的相关性,探讨ADH1B rs1229984基因位点合并AD阳性家族史、酒精摄入与sAD发病的相关性。3.通过检测内蒙古地区汉族人群中ALDH2rs671基因多态性,了解该人群中ALDH2 rs671与sAD的相关性,探讨ALDH2 rs671基因位点合并AD阳性家族史、酒精摄入与sAD发病的相关性。方法1.2015年3月到2017年10月期间,就诊于内蒙古医科大学附属医院门诊和住院的汉族sAD患者,以及与医院协作的部分社区诊断汉族sAD患者作为病例组;募集社区健康人群作为对照组。登记人口学、既往病史、个人史和家族史以及酒精摄入量。2.收集全血标本;提取ApoE、ADH1B和ALDH2的基因组DNA;测定DNA浓度和纯度;对于ADH1B和ALDH2,进行候选单核苷酸多态性(SNP)搜索;检测基因型;基因扩增、电泳;对基因频率分布进行Hardy-weinberg平衡检测。3.为比较病例组和对照组之间的差异,t检验人口统计学和临床变量,χ2检验分析各基因多态性位点的基因型和等位基因频率,比值比(OR)及其95%置信区间(CI)分析关联强度;通过Logistic回归模型分析各不同基因多态位点的基因型内蒙古地区汉族sAD风险的相关性,Spearman相关系数分析ADH1B rs1229984、ALDH2 rs671与AD阳性家族史、酒精摄入对AD发病风险增加的相关性。结果1.共募集到汉族人群sAD患者503例,对照组384例。病例组文化程度更低(P= 0.045);AD阳性家族史和酒精摄入的比例更高(P0.05);两组在性别构成、平均年龄、吸烟、高血压、糖尿病和脑卒中比例上无差异(P0.05)。2.在病例组和对照组,ApoE rs429358 和 rs7421、ADH1B rs1229984 和 ALDH2 rs671基因多态位点的基因频率分布符合Hardy-weinberg平衡定律,说明其SNP群体代表性良好。3.在病例组和对照组,ApoE ε2、ε3和ε4这3种等位基因的分布频率有差异(χ2= 66.290,P = 0.000),ε3 的频率最高(χ2 = 73.355,P = 0.000);等位基因形成的6种基因型分布有差异(χ2=73.355,P = 0.000)。病例组ApoE ε4(+)频率高于对照组(χ2 = 67.283,P = 0.000),ApoE ε4增加sAD发病风险(OR 4.20,95%CI 2.93～6.00)。4.内蒙古汉族 sAD 中,ADH1Brs 1229984 基因型(χ2 =7.136,P = 0.028)和等位基因(χ2 = 4.308,= 0.038)的分布频率有差异;等位基因A增加sAD发病风险(OR1.24,95%CI1.01～1.53)。ApoEε4分层后,ε4(+)亚组中,该位点基因型在病例组和对照组之间的分布有差异(χ2= 8.484,P=0.014),等位基因分布无差异。5.内蒙古汉族sAD中,ALDH2rs671基因型(χ2= 14.662,P=0.001)和等位基因(χ2= 12.092,P = 0.001)的分布频率有差异;等位基因A增加sAD发病风险(OR1.43,95%CI1.17～1.75)。ApoEε4 分层后,ApoEε4(+)亚组中,该位点基因型(χ2 = 6.185,P = 0.045)和等位基因(χ2= 5.430,P = 0.02)在病例组和对照组之间的分布有差异;ApoEε4(-)亚组中,基因型(χ2 =10.789,P=0.005)和等位基因(χ2= 7.909,P=0.005)的频率也有差异。6.ADH1B rs1229984(OR 2.54,95%CI 1.19～5.41)和 ALDH rs671(OR 4.57,95%CI1.60～14.01)的GG、GA、AA三种基因型中,病例组AA分布显著高于对照组。在ADH1B和ALDH,其GG/GA+AA即显性的OR值分别为1.78 和 1.79,95%CI 分别为 1.09～2.93 和 1.08～2.97;GG+GA/AA 即隐性的OR值分别为2.33和4.17,95%CI分别为1.18-4.47和1.49～12.67——提示两种模型都与增加内蒙古汉族sAD患病风险相关。7.Spearman 相关系数分析显示,ADH1B rs1229984、ALDH rs671 合并 AD 阳性家族史、酒精摄入者,均增加sAD发病风险(P0.05)。结论1.在内蒙古地区的汉族人群,ApoE基因与sAD发病相关,ApoEε4可能增加sAD发病风险。2.在内蒙古地区的汉族人群,ADH1B rs1229984基因位点与sAD的发病风险显著相关;ApoE基因可能增加ADH1B基因对sAD的作用;ADH1B rs1229984基因位点AA基因型可能增加sAD发病风险,其显性和隐性两种模型都与增加sAD患病风险相关;ADH1B rs1229984合并AD阳性家族史和酒精摄入者的sAD发病风险增加。3.在内蒙古地区的汉族人群,ALDH2rs671基因位点与sAD的发病风险显著相关;ApoE基因可能增加ALDH2基因对内蒙古汉族sAD的作用。ALDH2 rs671基因位点AA基因型可能增加sAD的发病风险,其显性和隐性两种模型都与增加sAD患病风险相关;ALDH2 rs671合并AD阳性家族史、酒精摄入者的sAD发病风险增加。
【图文】：

琼脂糖凝胶电泳,基因,产物,基因组

结果逡逑１基因组ＤＮＡ提取逡逑血液基因组ＤＮＡ提取，经电泳检测结果如图２－１所示。从电泳图中可以看逡逑出所提取的基因组ＤＮＡ条带完整，没有降解，提取成功，可以用于后续实验。逡逑Ｍｓｔｅ逦ＰsE邋ｍｉ逦ＰａｔｍｓＳ逦ＰｓｉｉｅｒｉＳ逡逑＾邋，逡逑ｌ：逦漏逡逑４＜＿逦ｒ逦懰＾３邋ＡＤＨ１Ｂｒｓｌ２２９９８４逡逑２0＜％逦；ｇＨ逡逑图２－１邋ＡＤＨ１Ｂ基因ＰＣＲ扩增产物经酶切后琼脂糖凝胶电泳图逡逑２邋ＡＤＨ１Ｂ基因多态性频率分布逡逑内蒙古汉族ｓＡＤ样本中，ＡＤＨ１Ｂ邋ｒｓ邋１２２９９８４基因型和等位基因分布频率，，逡逑在病例组和对照组之间存在差异（表２－１）。逡逑２７逡逑

琼脂糖凝胶电泳,基因,产物,基因组

结果逡逑１基因组ＤＮＡ提取逡逑血液基因组ＤＮＡ提取，经电泳检测结果如图３－１所示。从电泳图中可以看逡逑出所提取的基因组ＤＮＡ条带完整，没有降解，提取成功，可以用于后续实验。逡逑Ｍａｒｋｅｒ邋１逦２逦３逦４逦５逦６逡逑Ｊ邋Ｉ逡逑２0，邋＾邋■逡逑图３－１邋ＡＬＤＨ２基因ＰＣＲ扩增产物经酵切后琼脂糖凝胶电泳图逡逑２邋ＡＤＨ１Ｂ基因多态性频率分布逡逑内蒙古汉族ｓＡＤ样本中，ＡＬＤＨ２ｒｓ６７１基因型和等位基因分布频率，在病逡逑例组和对照组之间有差异（表３－１）。逡逑４０逡逑
【学位授予单位】：武汉大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R749.16;R440

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