cgMLST在甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌克隆变迁中的应用研究

发布时间：2020-06-18 07:09

【摘要】：目的:甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)是引起医院感染的重要多重耐药菌之一,能够引起手术部位感染及其他严重侵袭性感染。在过去几十年,社区获得性MRSA(community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus,CA-MRSA)迅速传播,有报道 CA-MRSA克隆可进入院内造成传播。本研究采用核心基因组多位点序列分型(core-genome multilocus sequence typing,cgMLST)技术分析教学医院内MRSA的流行病学变化。方法:分离2013年1月至2015年12月期间浙江大学医学院附属邵逸夫医院不同标本类型的MRSA,采用琼脂稀释法和双盘扩散试验法测定所分离的菌株对常见抗MRSA药物的体外敏感性,用PCR扩增pvl毒力基因,并用Illumina高通量测序平台对所分离菌株进行全基因组测序,利用CLC Genomics Workbench和Ridom生物信息学软件对基因组序列进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、spa分型和cgMLST分析。结果:本研究共收集292株MRSA,MLST结果显示最主要的ST型是ST5(150株)和ST59(68株),分别占比51.4%和23.3%。其中ST5的比例从2013年的68.3%下降到2015年的32.1%,ST59的比例从2013年的8.9%上升到2015年的41.0%。cgMLST分析结果显示,无论是社区发作还是医院发作菌株,ST59都比ST5表现出更广泛的基因多样性。最小生成树显示ST5菌株的亲缘关系表现的相对密切,而ST59菌株之间大多为无关。在93例皮肤软组织感染病例中ST59型MRSA菌株占45.2%,其左氧氟沙星的耐药率仅(11.8%),而几乎所有的ST5和ST239型菌株都对喹诺酮类耐药。小鼠皮肤感染模型和溶血试验结果显示医院发作的ST59型MRSA菌株具有较强的毒性,提示这些菌株与典型的CA-MRSA菌株具有相似的毒力水平。结论:具有高毒性潜力的ST59型MRSA菌株正逐渐取代ST5型MRSA菌株在医院的优势地位,cgMLST在医院里可作为监测MRSA菌株流行病学变化的有力工具。
【学位授予单位】：浙江大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R446.5
【图文】：

毒力比较,菌株,葡萄球菌,脓肿

ＣＡ－ＭＲＳＡ进行了比较。在小鼠皮肤感染模型中，由ＳＴ５９型ＨＯ－ＭＲＳＡ菌株引起的逡逑小鼠皮肤脓肿大小明显比ＳＴ５和ＳＴ２３９型ＨＯ－ＭＲＳＡ大，但是与经典ＣＡ－ＭＲＳＡ克隆逡逑菌株ＬＡＣ及ＳＡ２６８形成的脓肿大小相似（图４Ａ）。逡逑人红细胞溶血试验是另一种评价金黄色葡萄球菌毒力的重要参数。在溶血实验逡逑中，ＳＴ５９型ＨＯ－ＭＲＳＡ菌株培养液滤液裂解红细胞的能力高于ＳＴ５邋（夕＝０．０３）和逡逑ＳＴ２３９型（／Ｋ０．００１）邋ＨＯ－ＭＲＳＡ，与ＣＡ－ＭＲＳＡ菌株ＳＡ２６８邋（产０．０８）和ＵＳＡ３００菌逡逑株ＬＡＣ邋（ｐ０．４７）裂解红细胞能力相似。这结果与小鼠皮肤感染模型一致。但是，逡逑我们也发现ＳＴ５９型ＨＯ－ＭＲＳＡ菌株之间的溶血能力相差较大（图４Ｂ）。逡逑３２逡逑

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