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CXCL12和CXCR4基因多态性与冠心病以及冠状动脉狭窄程度相关性研究

发布时间:2020-07-12 16:12
【摘要】:目的 探究甘肃省兰州市汉族人群CXC型趋化因子配体12(chemokine CXC motif ligand 12,CXCL12)及其受体趋化因子受体4(CXC chemokine receptor4,CXCR4)基因多态性与冠心病发病风险以及冠状动脉狭窄程度的相关性。方法 入选2017年11月至2018年6月在兰州大学第二医院住院治疗的302例无血缘关系的CAD患者作为病例组,并以同期年龄、性别与病例组相匹配的302名的体检者作为健康对照组。应用竞争性等位基因特异性PCR法(Kompetitive Allele Specific PCR,KASP)完成所有选定的易感基因SNPs分型,并以Sanger测序对分型结果进行验证;根据临床冠状动脉造影结果采用Gensini评分对患者冠状动脉的狭窄程度进行评价。数据统计处理使用SPSS进行卡方检验分析CAD组以及对照组等位基因以及基因型频率之间的差异,二元Logistic回归分析和多因素线性回归分析分析不同遗传模型下基因多态性与冠心病发病风险以及冠状动脉狭窄程度之间的相关性。另外,采用SHEsis在线软件以及haploview软件计算Hardy-Weinberg遗传平衡,分析连锁不平衡和构建单倍型。结果 (1)对符合Hardy-Weinberg遗传平衡检测的4个SNP(rs2297630 GA、rs2322864 TC、rs266085CT和rs266087 GA)进行卡方统计分析,4个位点在CAD组与对照组间基因型频率以及等位基因频率比较差异均具有统计学意义(P均0.05)。(2)在三种遗传模型下,对两组间符合HW平衡的位点进行发病风险回归分析。在多因素logistics回归分析中发现,位点rs2297630除了在共显性模型中AG基因型与冠心病的发病风险无关(P=0.180),其余遗传模型均与冠心病的发病正相关,是CAD发病的危险因素(P均0.05)。(A vs G:O R=2.32,95%CI=1.62-3.31;P0.01),携带AA基因型与携带GG基因型相比会显著增加CAD的发病风险(AA vs GG:OR=10.21,95%CI=3.98-26.20;P0.01)。在调整性别、年龄、高血压、糖尿病、吸烟史、GLU、TG、TC、HDL、L DL多种传统风险因素对关联性分析的影响前后,CXCR4上多态性位点rs2322864均与CAD的发病风险显著相关(C vs T:OR=1.66,95%CI=1.20-2.30;P=0.002),携带CT基因型与携带TT基因型相比会显著增加CAD的发病风险(CT vs TT:OR=2.03,95%CI=1.35-3.06;P=0.001)位于CXCL12基因上的多态性位点r s266085和rs266087在单因素和多因素回归分析控制其他风险因素影响前后均与CAD的发病风险显著负相关(T vs C:OR=0.71,95%CI=0.55-0.94;P=0.015、A vs G:OR=0.72,95%CI=0.55-0.94;P=0.016),是CAD的保护因素。(3)通过秩和检验分析研究对象多态性位点不同基因型之间Gensini评分的差异;结果显示,位点rs2297630纯合突变型AA与野生型GG以及杂合突变型AG之间Gensini评分均值存在显著性差异(P均0.05),AG基因型与GG基因型之间Gensini评分无显著性差异(P=0.85)。位点rs2322864各基因型之间Gensini评分不存在显著性差异(P=0.93)位点rs266085野生纯合型CC与突变杂合型TC之间Gen sini评分差异具有统计学意义(P=0.03),总体组间差异不具有统计学意义(P=0.085);位点rs266087总体不同基因型组间Gensini评分差异具有统计学意义(P=0.036),野生纯合型GG与突变杂合型AG之间Gensini评分具有显著性差异(P=0.011),其余基因型之间Gensini评分不具有统计学差异(P均0.05)。(4)在探究SNP位点rs2297630与冠状动脉狭窄程度的相关性分析中,单因素线性回归分析发现A等位基因与冠状动脉狭窄程度正相关(β=0.10,95%CI=0.02-0.17;P=0.012);纯合突变AA基因型与野生型GG相比,冠状动脉狭窄程度增加(β=0.16,95%CI=0.04-0.23;P=0.006),同时在隐性模型中,也与冠脉狭窄程度正相关。在校正了包括性别、年龄、高血压、糖尿病、吸烟、GLU、TG、TC、HDL、LDL、病变支数等混杂因素后,A等位基因仍与冠状动脉狭窄程度正相关(β=0.07,95%CI=0.001-0.13;P=0.048);同时,携带AA基因型(β=0.12,95%CI=0.01-0.18;P=0.024)的CAD患者和隐性遗传模型(AA vs AG+GG:β=0.12,95%CI=0.02-0.18;P=0.020)与冠状动脉的狭窄程度显著正相关。其余多态性位点rs2322864、rs266085和rs266087均与冠脉狭窄程度无关(P均0.05)。(5)连锁不平衡分析显示CXCL12上多态性位点rs266087与rs266085能够构建单倍型(D’=0.745,r2=0.529,P0.05);rs2297630与rs266085、rs266087均不能构成有效单倍型(D’=0.482,r2=0.056;D’=0.321,r2=0.023,P均0.05);单倍型分析结果显示,rs266087和rs266085位点单倍型GT、GC和AC在病例组和对照组间存在统计学差异(P均0.05)。单倍型AC和GT均与冠心病发病风险负相关,是冠心病的保护因素(OR均1,P均0.05);而GC单倍型与冠心病发病风险正相关,是冠心病的危险因素(OR1,P0.05)。结论 (1)甘肃兰州汉族人群中CXCL12基因多态性位点rs2297630、rs266085和rs266087与冠心病的发病风险显著相关。其中位点rs2297630携带AA基因型的人群冠状动脉狭窄程度增高,其余多态性位点与冠状动脉粥样硬化狭窄程度无相关性。(2)甘肃兰州汉族人群中CXCR4基因多态性位点rs2322864与冠心病的发病风险显著相关,但与冠状动脉粥样硬化狭窄程度无相关性。(3)CXCL12多态性位点rs266087、rs266085构建的单倍型与冠心病的发病风险相关。
【学位授予单位】:兰州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:R541.4;R440
【图文】:

步骤,流水号,乙二胺四乙酸,兰州大学


兰州大学硕士研究生学位论文 CXCL12和CXCR4基因多态性与冠心病以及冠状动脉狭窄程度相关性研究2.3.1 标本收集和保存收集实验对象空腹8 h后的外周静脉血3ml(乙二胺四乙酸二钾抗凝),并进行分组,CAD组和对照组分别编号为 H-流水号 、 C-流水号 ,置于-40℃冰箱内保存待用。2.3.2 基因组 DNA 提取2.3 方法

完整性,基因组DNA,荧光,分型


high-density lipoprotein cholesterol; LDL-C: low-density lipoprotein cholesterol.3.2 SNP 位点分型的基本情况利用如图2所示经电泳显示成功提取的完整基因组DNA进行 KASP分型后,根据图 3 荧光散点读取结果按照如下确定基因的具体基因型:聚集在接近 X 轴的荧光散点所代表的样本的基因型为突变纯合基因型,聚集在接近 Y 轴荧光散点所代表的样本为野生纯合基因型,在中间聚集的荧光散点所代表的样本基因型为两种等位基因的杂合型;如有显示黑色的样本,可能由于 DNA 浓度过低,扩增产物未被明确分型产生。此外,如图 4 显示,经随机抽样测序验证,4 个 SNP的 KASP 基因分型结果与测序结果完全一致。

散点图,荧光,分型,散点图


图 3 分型荧光散点图聚集在接近 X 轴的荧光散点所代表的样本的基因型为突变纯合基因型;聚集在接近 Y轴荧光散点所代表的样本为野生纯合基因型;在中间聚集的荧光散点所代表的样本基因型为两种等位基因的杂合型。

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