高毒力肺炎克雷伯菌基因组序列分析及其与中性粒细胞的作用机制研究

发布时间：2020-12-24 02:49

　　背景:高毒力肺炎克雷伯菌（HypervirulentKlebsiella pneumoniae,HvKP）常导致健康人群的严重社区获得性感染,而且感染易于发生多部位的播散。HvKP菌株具有较厚的荚膜,携带rmpA和aerobactin等毒力基因,毒力明显高于普通肺炎克雷伯菌（classic Klebsiellapneumoniae,cKP）。中性粒细胞可以通过胞内吞噬和胞外释放中性粒细胞胞外诱捕网（Neutrophil extracellular traps,NETs）2种途径抵抗病原微生物的感染。为了揭示HvKP高毒力和高致病性的机制,选取了 6株HvKP进行第三代测序和分析,并进一步研究人体中性粒细胞在抗HvKP感染中的作用。方法:选取不同荚膜血清分型的6株HvKP菌株（K1、K2、K57型HvKP各2株）,利用PacBio第三代单分子实时测序技术（SMRT）进行测序,主要从毒力基因、耐药基因两方面展开分析,探索HvKP高致病性及高毒力的遗传基础。根据黏液丝试验、荚膜血清分型、rmpA和aerobactin基因检测结果,本研究共筛选了 45株肺炎克雷伯菌,包括16株HvKP-K1、... 

【文章来源】：中国人民解放军医学院北京市

【文章页数】：94 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１?６株ＨｖＫＰ基因组圈图??大圈为染色体基因组，小圈为质粒基因组??

大圈为染色体基因组，小圈为质粒基因组??３．５测序菌株染色体与质粒基因功能聚类??本研究中６株ＨｖＫＰ的染色体基因功能聚类无明显差别（图２Ａ），但是对质粒基??因的功能聚类发现，除编号为１１３０５菌株外，其他５株测序菌株质粒上多数基因与菌??株毒力、致病性、抗性以及铁载体相关（图２Ｂ），可见质粒在肺炎克雷伯菌中发挥重??要的作用。值得注意的是，编号为１１３０５菌株的质粒基因组序列与其他５个菌株差别??较大，此菌株缺失了与毒力紧密相关的ｒｍ／Ｍ基因，携带一个耐药性质粒，该质粒上??含有编码耐碳青霉烯类、氨基糖苷类和喹诺酮类药物的耐药基因??和ｇｗ？沿

基因（编号为１１４２０和１１４９２）以及编码聚酮肽基因毒素（ｃｏｌｉｂａｃｔｉｎ）的??ｃ历基因（编号为１１４２０、１１４９２和ＫＰ５２．１４５），但ｃＫＰ均不含有编码微菌素的ｍｃｅ??基因和编码ｃｏｌｉｂａｃｔｉｎ的基因（见图４）。??进一步对ＫＪ、Ｋ２、Ｋ５７型ＨｖＫＰ菌株和ｃＫＰ菌株的毒力基因数量进行统计，结??果显示，编号为１１４２０菌株含有７５个毒力基因，编号为１１４９２菌株含有６９个毒力基??因，编号为１１４５４菌株含有２２个毒力基因，编号为１１３０５菌株含有９个毒力基因，??编号为１１３１１和２３菌株均含有１８个毒力。分析结果显示Ｋ１型ＨｖＫＰ菌株（编号为??１１４２０和１１４９２）含有的毒力基因数量最多，其次为Ｋ２型、Ｋ５７型（图５）。??／？?＼?ｆ?＾?广?ｘ??ｐ——?＾?＾?１｜?爾２??；１?１５??ｒ?ｉ＾ｓ＾ＢａＭ＾ｇｉａＢａａａＢｇＭＢｏｓｇ＾＾＾ＢＳ＾ＭｉＢ?ｓｆｅｇ??Ｖｉ?＇ｉ＂＂ｉ?＂ｉｉＪ［ｆ＂


本文编号：2934832