基于MALDI-TOF MS临床侵袭性丝状真菌的快速鉴定技术研究
发布时间:2021-03-28 06:36
目的:评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术在临床常见丝状真菌鉴定中的应用价值。方法:收集2017年4月到2019年2月湖南师范大学附属一医院(湖南省人民医院)各种类型临床标本中分离培养的29株丝状真菌,以及北京协和医院检验科微生物实验室惠赠的26株丝状真菌。对这55株丝状真菌通过传统形态学鉴定、DNA测序及MALDI-TOF MS鉴定方法后,以DNA测序结果为标准,与另外2种方法的鉴定结果进行统计学比较,评价MALDI-TOF MS在临床丝状真菌鉴定上的应用。结果:在28℃和35℃条件下培养的丝状真菌,使用质谱仪鉴定后,经过χ2检验,得出P>0.05,提示培养温度差异无统计学意义;以DNA测序结果为金标准,传统形态学方法的正确鉴定率为69.1%(38/55),而基于MALDI-TOF MS技术的正确鉴定率可达96.4%(53/55);本研究中,使用“甲酸乙腈提取法”提取蛋白后,丝状真菌质谱鉴定的正确率为83.6%(46/55),而“磁珠研磨法”提取蛋白后的质谱鉴定率则为96.4%(53/55)。结论:临床常规工作中使用质谱仪鉴...
【文章来源】:湖南师范大学湖南省 211工程院校
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
丝状真菌菌落形态及镜下形态图
a 草酸青霉菌落形态 b 草酸青霉镜下形态(10×100)图 1 丝状真菌菌落形态及镜下形态图 DNA 测序.1 扩增产物电泳55 株丝状真菌 DNA 在 2 对引物下进行 PCR 扩增,将其产物进行电泳TS1-F/ITS2-R 扩增产物条带在 500-700bp,具体见图 2;而β-微管蛋白产物条带为 200-600 bp,具体见图 3。
镜下形态(10×100)图 1 丝状真菌菌落形态及镜下形态图3.3 DNA 测序3.3.1 扩增产物电泳55 株丝状真菌 DNA 在 2 对引物下进行 PCR 扩增,将其产物进行电泳,其中 ITS1-F/ITS2-R 扩增产物条带在 500-700bp,具体见图 2;而β-微管蛋白(F/R)扩增产物条带为 200-600 bp,具体见图 3。图 2 丝状真菌基因组 DNA 引物为 ITS1-F/ITS2-R 时 PCR 扩增产物电泳图注:M:DNAmarker;引物为:ITS1-F/ITS2-R;1 烟曲霉;2 黑曲霉;3 黄/米曲霉;4 构巢曲霉;5 土曲霉;6 杂色曲霉;7 溜曲霉;8 镰刀菌;9 普通青霉;10 草酸青霉;11 阴性对照。
【参考文献】:
期刊论文
[1]飞行时间质谱技术鉴定丝状真菌的研究进展[J]. 张敬霞,曲芬. 传染病信息. 2018(02)
[2]MALDI-TOF MS在病原性丝状真菌鉴定中的应用进展[J]. 李颖,徐英春. 中国真菌学杂志. 2017(06)
[3]基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在临床微生物检验中的应用与发展[J]. 张嵘. 中国感染与化疗杂志. 2017(06)
[4]MALDI-TOF-MS技术快速鉴定丝状真菌的临床评价[J]. 吴友伟,石红,刘万静,答嵘. 检验医学与临床. 2017(21)
[5]丝状真菌质谱鉴定前处理方法及应用[J]. 黄艳飞,常峥,白婕,朱敏,张明新,王玫,张桂,李修远,童贻刚,王景林,鲁辛辛. 中华医学杂志. 2017 (30)
[6]基质辅助激光解吸电离飞行时问质谱(MALDI-TOFMS)分析在丝状真菌实验诊断中的应用[J]. 周龙荣,徐元宏. 现代检验医学杂志. 2017(01)
[7]MALDI-TOF MS在临床微生物鉴定中的常见问题及对策[J]. 李修远,黄艳飞,尚军,鲁辛辛. 临床检验杂志. 2016(12)
[8]基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在真菌快速鉴定中的应用[J]. 王欢,曲芬. 传染病信息. 2016(03)
[9]质谱仪在真菌鉴定中的应用与评价[J]. 王欢,贾天野,鲍春梅,张成龙,张鞠玲,崔恩博,陈素明,徐东平,曲芬. 传染病信息. 2015(04)
[10]侵袭性真菌感染的实验室诊断[J]. 杜洋. 中国医药指南. 2015(11)
本文编号:3105066
【文章来源】:湖南师范大学湖南省 211工程院校
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
丝状真菌菌落形态及镜下形态图
a 草酸青霉菌落形态 b 草酸青霉镜下形态(10×100)图 1 丝状真菌菌落形态及镜下形态图 DNA 测序.1 扩增产物电泳55 株丝状真菌 DNA 在 2 对引物下进行 PCR 扩增,将其产物进行电泳TS1-F/ITS2-R 扩增产物条带在 500-700bp,具体见图 2;而β-微管蛋白产物条带为 200-600 bp,具体见图 3。
镜下形态(10×100)图 1 丝状真菌菌落形态及镜下形态图3.3 DNA 测序3.3.1 扩增产物电泳55 株丝状真菌 DNA 在 2 对引物下进行 PCR 扩增,将其产物进行电泳,其中 ITS1-F/ITS2-R 扩增产物条带在 500-700bp,具体见图 2;而β-微管蛋白(F/R)扩增产物条带为 200-600 bp,具体见图 3。图 2 丝状真菌基因组 DNA 引物为 ITS1-F/ITS2-R 时 PCR 扩增产物电泳图注:M:DNAmarker;引物为:ITS1-F/ITS2-R;1 烟曲霉;2 黑曲霉;3 黄/米曲霉;4 构巢曲霉;5 土曲霉;6 杂色曲霉;7 溜曲霉;8 镰刀菌;9 普通青霉;10 草酸青霉;11 阴性对照。
【参考文献】:
期刊论文
[1]飞行时间质谱技术鉴定丝状真菌的研究进展[J]. 张敬霞,曲芬. 传染病信息. 2018(02)
[2]MALDI-TOF MS在病原性丝状真菌鉴定中的应用进展[J]. 李颖,徐英春. 中国真菌学杂志. 2017(06)
[3]基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在临床微生物检验中的应用与发展[J]. 张嵘. 中国感染与化疗杂志. 2017(06)
[4]MALDI-TOF-MS技术快速鉴定丝状真菌的临床评价[J]. 吴友伟,石红,刘万静,答嵘. 检验医学与临床. 2017(21)
[5]丝状真菌质谱鉴定前处理方法及应用[J]. 黄艳飞,常峥,白婕,朱敏,张明新,王玫,张桂,李修远,童贻刚,王景林,鲁辛辛. 中华医学杂志. 2017 (30)
[6]基质辅助激光解吸电离飞行时问质谱(MALDI-TOFMS)分析在丝状真菌实验诊断中的应用[J]. 周龙荣,徐元宏. 现代检验医学杂志. 2017(01)
[7]MALDI-TOF MS在临床微生物鉴定中的常见问题及对策[J]. 李修远,黄艳飞,尚军,鲁辛辛. 临床检验杂志. 2016(12)
[8]基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在真菌快速鉴定中的应用[J]. 王欢,曲芬. 传染病信息. 2016(03)
[9]质谱仪在真菌鉴定中的应用与评价[J]. 王欢,贾天野,鲍春梅,张成龙,张鞠玲,崔恩博,陈素明,徐东平,曲芬. 传染病信息. 2015(04)
[10]侵袭性真菌感染的实验室诊断[J]. 杜洋. 中国医药指南. 2015(11)
本文编号:3105066
本文链接:https://www.wllwen.com/linchuangyixuelunwen/3105066.html
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