动物源和人源金黄色葡萄球菌的种属特异性标志物研究

发布时间：2021-04-22 20:37

　　目的:掌握不同动物源和人源金黄色葡萄球菌（简称金葡菌）的耐药和毒素基因流行情况;并比较不同来源菌株之间的分子型别和分子特征的差异,以揭示不同来源金葡菌的特异性表型和分子标志物。为预测动物相关金葡菌跨种属传播风险提供重要理论依据,以有效控制和遏制动物相关金葡菌向人群传播。方法:采用横断面研究设计,对广东省珠三角地区4个城市（深圳市、佛山市、东莞市、江门市）的动物和人群进行鼻拭子采样。所有金葡菌进行抗生素敏感性试验,运用PCR扩增技术检测耐药基因（erm（A）/erm（C）、linA等）、超抗原毒素基因（中毒性休克综合征毒素基因tsst1和肠毒素基因sea、seb、sec等）、免疫逃逸集群（IEC）基因（scn、chp、sak、sea、sep）、溶血毒素基因（hla、hlb、hld）杀白细胞毒素pvl基因、粘附因子相关基因（bbp、clfA、cna等）;应用多位点序列分型MLST实验得到金葡菌的分子型别。采用χ²检验或者确切概率法、logistic回归进行各组率的比较,通过对应分析揭示不同来源金葡菌中CC分型和表型-分子特征之间的对应关系。研究金葡菌来源（动物源、人源... 

【文章来源】：广东药科大学广东省

【文章页数】：100 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 前言
第二章 材料与方法
    2.1 伦理学
    2.2 研究对象
        2.2.1 人群样本来源
        2.2.2 动物样本来源
        2.2.3 估计样本量
    2.3 标本收集
        2.3.1 人群标本的采集
        2.3.2 动物标本的采集
    2.4 主要培养基、试剂
        2.4.1 培养基
        2.4.2 试剂
        2.4.3 药敏实验材料
        2.4.4 PCR实验材料
    2.5 金葡菌的分离鉴定
    2.6 金葡菌分子生物学实验
        2.6.1 菌株DNA的提取
        2.6.2 菌株的分子分型和分子特征
        2.6.3 引物的设计
        2.6.4 反应体系
        2.6.5 扩增条件
        2.6.6 MLST分型和确定克隆复合体（CCs）
    2.7 金葡菌的抗菌药物敏感性试验
        2.7.1 药敏纸片选取
        2.7.2 纸片扩散法实验
        2.7.3 多药耐药性金葡菌
    2.8 相关定义
    2.9 数据分析
    2.10 质量控制
        2.10.1 现场采样的质量控制
        2.10.2 实验室的质量控制
第三章 结果
    3.1 人群和动物金葡菌（MRSA）菌株的克隆群分布情况
    3.2 动物源和人源金葡菌表型和分子特征的比较
        3.2.1 动物源和人源金葡菌的耐药情况比较
        3.2.2 动物源和人源金葡菌的毒素基因携带情况比较
    3.3 动物源和人源MRSA表型和分子特征的比较
        3.3.1 动物源与人源MRSA的耐药情况比较
        3.3.2 动物源和人源MRSA的毒素基因携带情况比较
    3.4 动物源和人源金葡菌克隆群与表型和分子特征的关联性分析
        3.4.1 金葡菌克隆群与肠毒素基因数量的关联性分析
        3.4.2 金葡菌克隆群与粘附基因数量的关联性分析
        3.4.3 金葡菌克隆群与IEC基因数量的关联性分析
        3.4.4 金葡克隆群与溶血毒素基因数量的关联性分析
        3.4.5 克隆群与耐药模式的关联性分析
    3.5 随机森林和分类与回归树探究不同来源菌株的表型和分子特征
        3.5.1 耐药表型
        3.5.2 耐药基因
        3.5.3 IEC基因
        3.5.4 肠毒素基因
        3.5.5 溶血毒素基因
        3.5.6 粘附因子基因
第四章 讨论
    4.1 动物相关和社区相关菌株的流行克隆群
    4.2 菌株的分子分型与表型-分子特征间对应关系
    4.3 不同来源菌株的表型和分子特征标志
    4.4 本研究优点与不足
第五章 结论
参考文献
综述
    参考文献
致谢
攻读硕士论文学位期间发表的论文


【参考文献】：
期刊论文
[1]耐甲氧西林金黄色葡萄球菌不同来源株耐药性及流行特征分析[J]. 赵红庆,徐萍,周声安,胡守奎.  疾病监测. 2017(07)
[2]金黄色葡萄球菌基因组DNA提取方法的比较[J]. 苏丽婷,梁景龙,郭小建,冯飞.  仲恺农业工程学院学报. 2011(01)



本文编号：3154430