基于影像组学的肝细胞癌术前分型和预后评估研究
发布时间：2021-06-30 08:16
肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,其具有显著的异质性和术后高复发率的特点。因此,有效的术前危险分层和精准的预后评估对于治疗手段及随访方案的制定有重要意义。影像组学,作为从医学图像中提取高通量影像信息的方法,具有无创地捕获肿瘤的内在信息和反映肿瘤异质性的特点,受到广泛的关注。并且,影像组学联合基因组学、转录组学、蛋白组学等多组学的信息,能够从多个维度全面有效评估肿瘤患者的生物学特征和异质性。本研究基于影像组学技术在HCC中展开应用,在课题的第一部分工作中探讨基于超声医学图像的影像组学技术在HCC进行术前有效分型中的作用,并分析HCC不同亚型之间的特异性,进一步提出影像组学对HCC癌栓形成、微血管侵犯及早期复发等临床病理特征术前有效评估的效能。在第二部分的工作中,我们通过基于增强电子计算机断层扫描（contrast enhanced computed tomography,CECT）影像组学的技术联合转录组学及临床病理参数,构建HCC患者的预后有效评估的模型。本研究有望为HCC的精准诊疗提供有效的临床辅助决策。第一部分基于...
【文章来源】：广西医科大学广西壮族自治区
【文章页数】：88 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
本研究流程图
ITK-SNAP（version 3.8.0，University of Pennsylvania, Philadelphia,USA）软件沿着病灶边缘勾画 ROI[20, 21]。ROI 的勾画由一位具有 10 年临床经验的超声医师进行勾画，并由另一位具有 20 年临床经验的超声医师进行确认。ITK-SNAP 是一款开源软件，支持 Windows、Linux 以及 MacOS 等操作平台。操作步骤：①将 HCC 病灶最大切面的 DICOM 图片导入 ITK-SNAP 软件；②选择“polygon mode”，点击鼠标左键，绘制工具根据手工沿着病灶边缘进行勾画，当勾画边界线首尾相连后颜色发生变化，鼠标右键可以进行图像的放大缩小，便于观察；③选择“paintbrush mode”对勾画的 ROI 边界线进行精确调整，保证感兴趣区覆盖肿瘤病灶图像，左键为对鼠标点击区域进行标记，右键为对鼠标点击区域进行擦除；④点击右下角“accept” 完成 ROI 勾画并保存 ROI 文件为“NiFTI”格式进行后续分析（图 2-1）。
基于影像组学的肝细胞癌术前分型和预后评估研究 硕士学位论文2.2.2 影像组学特征通过 ITK-SNAP 软件，完成了 HCC 病灶感兴趣区的勾画（图 2-2）。本研究所提取的 1076 个特征，其中包括 19 个直方图特征，16 形状特征，60个纹理特征以及 432 小波特征。除去方差为 0 的影像组学特征，即在所有样本中均没有变化的特征后，我们纳入了 968 个影像组学进行下一步的分析，并对这些特征进行了 Z-score 的标准化处理。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Systematic review of the outcomes of surgical resection for intermediate and advanced Barcelona Clinic Liver Cancer stage hepatocellular carcinoma: A critical appraisal of the evidence[J]. Ye Xin Koh,Hwee Leong Tan,Weng Kit Lye,Juinn Huar Kam,Adrian Kah Heng Chiow,Siong San Tan,Su Pin Choo,Alexander Yaw Fui Chung,Brian Kim Poh Goh. World Journal of Hepatology. 2018(06)
[2]Hepatitis C virus:A global view[J]. Amal Ahmed Mohamed,Tamer A Elbedewy,Magdy El-Serafy,Naglaa El-Toukhy,Wesam Ahmed,Zaniab Ali El Din. World Journal of Hepatology. 2015(26)
[3]Efficacy of different treatment strategies for hepatocellular carcinoma with portal vein tumor thrombosis[J]. Jia Fan, Jian Zhou, Zhi-Quan Wu, Shuang-Jian Qiu, Xiao-Ying Wang, Ying-Hong Shi, Zhao-You Tang, Liver Cancer Institute, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai 200032, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(08)
本文编号：3257391
【文章来源】：广西医科大学广西壮族自治区
【文章页数】：88 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
本研究流程图
ITK-SNAP（version 3.8.0，University of Pennsylvania, Philadelphia,USA）软件沿着病灶边缘勾画 ROI[20, 21]。ROI 的勾画由一位具有 10 年临床经验的超声医师进行勾画，并由另一位具有 20 年临床经验的超声医师进行确认。ITK-SNAP 是一款开源软件，支持 Windows、Linux 以及 MacOS 等操作平台。操作步骤：①将 HCC 病灶最大切面的 DICOM 图片导入 ITK-SNAP 软件；②选择“polygon mode”，点击鼠标左键，绘制工具根据手工沿着病灶边缘进行勾画，当勾画边界线首尾相连后颜色发生变化，鼠标右键可以进行图像的放大缩小，便于观察；③选择“paintbrush mode”对勾画的 ROI 边界线进行精确调整，保证感兴趣区覆盖肿瘤病灶图像，左键为对鼠标点击区域进行标记，右键为对鼠标点击区域进行擦除；④点击右下角“accept” 完成 ROI 勾画并保存 ROI 文件为“NiFTI”格式进行后续分析（图 2-1）。
基于影像组学的肝细胞癌术前分型和预后评估研究 硕士学位论文2.2.2 影像组学特征通过 ITK-SNAP 软件，完成了 HCC 病灶感兴趣区的勾画（图 2-2）。本研究所提取的 1076 个特征，其中包括 19 个直方图特征，16 形状特征，60个纹理特征以及 432 小波特征。除去方差为 0 的影像组学特征，即在所有样本中均没有变化的特征后，我们纳入了 968 个影像组学进行下一步的分析，并对这些特征进行了 Z-score 的标准化处理。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Systematic review of the outcomes of surgical resection for intermediate and advanced Barcelona Clinic Liver Cancer stage hepatocellular carcinoma: A critical appraisal of the evidence[J]. Ye Xin Koh,Hwee Leong Tan,Weng Kit Lye,Juinn Huar Kam,Adrian Kah Heng Chiow,Siong San Tan,Su Pin Choo,Alexander Yaw Fui Chung,Brian Kim Poh Goh. World Journal of Hepatology. 2018(06)
[2]Hepatitis C virus:A global view[J]. Amal Ahmed Mohamed,Tamer A Elbedewy,Magdy El-Serafy,Naglaa El-Toukhy,Wesam Ahmed,Zaniab Ali El Din. World Journal of Hepatology. 2015(26)
[3]Efficacy of different treatment strategies for hepatocellular carcinoma with portal vein tumor thrombosis[J]. Jia Fan, Jian Zhou, Zhi-Quan Wu, Shuang-Jian Qiu, Xiao-Ying Wang, Ying-Hong Shi, Zhao-You Tang, Liver Cancer Institute, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai 200032, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(08)
本文编号：3257391
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