铜绿假单胞菌对氨基糖苷类抗生素的耐药性及相关耐药基因研究
发布时间:2021-08-10 20:39
目的通过检测临床分离的铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)氨基糖苷类修饰酶基因及16SrRNA甲基化酶基因的表达情况,研究氨基糖苷类修饰酶及16SrRNA甲基化酶与PA耐药的相关性,为指导临床合理化用药及抗菌药物研发提供依据和帮助。方法(1)选择安徽医科大学第一附属医院2013年11月-2015年12月期间的临床标本,经分离纯培养后,采用法国梅里埃公司VETEC 2 COMPACT全自动微生物分析仪鉴定和药敏检测,药敏判断标准按CLSI 2015年版标准规定的临界值判定耐药、中介和敏感,并对9种临床常用代表性抗菌药物的耐药情况进行分析,筛选氨基糖苷类耐药的铜绿假单胞菌菌株。(2)采用聚合酶链式反应对氨基糖苷类修饰酶基因和16SrRNA甲基化酶基因扩增,并进行序列测定及分析。氨基糖苷类修饰酶基型包括aac(3)-I,aac(3)-II,aac(6’)-I,aac(6’)-II,ant(2’’)-I和ant(3’’)-I共6种,16SrRNA甲基化酶基因型包括armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD,应用2%琼脂糖凝胶电泳技术分析扩增产物,与阳性对照分...
【文章来源】:安徽医科大学安徽省
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
rmtB基因电泳图谱
3.2.2 阳性基因测序将 PCR 扩增电泳结果中含有 rmtB 基因的阳性产物进行基因测序,PCR 阳性产物为 PCR 直接全自动荧光法测序,委托上海华津公司纯化并进行 DNA 测序,测序在美国 ABI 公司 3730 型毛细管全自动测序仪上进行。3.2.3 序列比对结果 测序后通过 BLAST 程序进行分析,序列与美国核酸库(GenBank)已登录的 rmtB 序列 100%同源,其在 GenBank 中的序列号为FJ483516.1,PCR 产物部分测序图见图 2 和图 3。
图 3 rmtB 基因反向测序图Fig 3 reverse sequencing of gene rmtB(part)3.3 氨基糖苷类修饰酶基因检测结果3.3.1 氨基糖苷类修饰酶电泳结果PCR 扩增产物经 2%琼脂糖凝胶电泳,出现与阳性对照分子相当的目的条带为阳性。 实验结果显示:在 33 株氨基糖苷类耐药的铜绿假单胞菌中,有 28 株产氨基糖苷类修饰酶,基因 aac(3)-II 共 15 株,aac(6')-I 共 9 株,aac(6')-II 共 15 株、ant(2'')-I 共 24 株 、ant(3'')-I 共 11 株,未扩增出 aac(3)-I 基因,阳性基因检出率依次为 ant(2'')-I(32.43%)、aac(3)-II(20.27%)、aac(6')-II(20.27%)、ant(3'')-I(14.86%),aac(6')-I(12.16%),本研究中检出率最高的基因型是 ant(2'')-I,有 5 株细菌未检出氨基糖苷类修饰酶基因;27 株对氨基糖苷类抗生素中介及敏感的铜绿假单胞菌
本文编号:3334744
【文章来源】:安徽医科大学安徽省
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
rmtB基因电泳图谱
3.2.2 阳性基因测序将 PCR 扩增电泳结果中含有 rmtB 基因的阳性产物进行基因测序,PCR 阳性产物为 PCR 直接全自动荧光法测序,委托上海华津公司纯化并进行 DNA 测序,测序在美国 ABI 公司 3730 型毛细管全自动测序仪上进行。3.2.3 序列比对结果 测序后通过 BLAST 程序进行分析,序列与美国核酸库(GenBank)已登录的 rmtB 序列 100%同源,其在 GenBank 中的序列号为FJ483516.1,PCR 产物部分测序图见图 2 和图 3。
图 3 rmtB 基因反向测序图Fig 3 reverse sequencing of gene rmtB(part)3.3 氨基糖苷类修饰酶基因检测结果3.3.1 氨基糖苷类修饰酶电泳结果PCR 扩增产物经 2%琼脂糖凝胶电泳,出现与阳性对照分子相当的目的条带为阳性。 实验结果显示:在 33 株氨基糖苷类耐药的铜绿假单胞菌中,有 28 株产氨基糖苷类修饰酶,基因 aac(3)-II 共 15 株,aac(6')-I 共 9 株,aac(6')-II 共 15 株、ant(2'')-I 共 24 株 、ant(3'')-I 共 11 株,未扩增出 aac(3)-I 基因,阳性基因检出率依次为 ant(2'')-I(32.43%)、aac(3)-II(20.27%)、aac(6')-II(20.27%)、ant(3'')-I(14.86%),aac(6')-I(12.16%),本研究中检出率最高的基因型是 ant(2'')-I,有 5 株细菌未检出氨基糖苷类修饰酶基因;27 株对氨基糖苷类抗生素中介及敏感的铜绿假单胞菌
本文编号:3334744
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