沙门菌常见O抗原和H抗原荧光PCR检测方法评估
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【摘要】:目的:评估沙门菌常见A~F血清群O抗原和H抗原荧光PCR检测方法对不同血清型沙门菌的检测效果。方法:选用不同血清型沙门菌制备模板,运用沙门菌O抗原A~F群及不同H抗原荧光PCR检测试剂盒对这些菌株进行扩增检测,分别计算不同血清型检测结果的灵敏度、特异度、检测下限、假阳性率、假阴性率、Kappa值等指标并进行分析。结果:对7种不同沙门菌O抗原的检测灵敏度为85.71%~100.00%,特异度为66.67%~100.00%;对7种不同沙门菌H抗原的检测,H1,5及Hi-l的灵敏度不高,分别为35.71%及57.14%,但特异度均较高(87.50%~100.00%);经Fisher精确检验,除H1,5阳性检测的P0.05(P=0.162),其余为P0.05;C1、C2、D1、E、F血清群及H抗原1,6、1,7、g,s,t、g,m的检测结果与血清凝集结果的一致性较高(Kappa值均大于0.75),而H1,5及Hi-l的检测结果与血清凝集结果的一致性很差(Kappa值分别为0.302及0.492);试剂盒对不同O/H抗原核酸检测扩增效率较好,最低检出限为7~137608拷贝/反应。结论:除H1,5抗原外,该荧光PCR检测试剂盒对沙门菌O/H抗原不同血清型的检测效果较好,优于传统血清凝集方法,可显著提高血清型鉴定时效,有利于疾病或暴发的早期发现。
【作者单位】: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【关键词】: 沙门菌 血清型 O抗原 H抗原 荧光PCR
【基金】:国家科技重大专项(2013ZX10004216) 国家重点基础研究发展计划(2013CB127204)
【分类号】:R440
【正文快照】: 沙门菌是常见的引起食源性疾病的致病菌。2007年世界卫生组织的统计数据显示,全世界范围内已发现2610种血清型的沙门菌[1]。至2006年,我国也已检出近300种沙门菌血清型[2]。传统的血清型鉴定耗时较长,不利于及时进行疾病暴发时追踪传染源以及分析比较菌株间的差异。目前已有很
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