改进聚类分析算法及其在DNA序列中的应用
发布时间：2020-12-06 08:21
聚类分析是数据挖掘中的一种跨学科、跨领域的数据分析方法,由于现今社会的发展需求,聚类分析算法被应用的范围以及频率越来越多,因此,改进的聚类分析算法也相应增多。鉴于诸多问题在分类界线上模糊,使得人们无法确定,因此模糊聚类的应用逐渐被广泛。国内外的许多专家学者逐渐的将聚类分析问题转变为图划分问题,以图为基本思想,将问题进行聚类的谱聚类也逐渐受到追捧。模糊聚类和谱系聚类一跃成为研究热点,但是针对某些问题时,两种聚类算法并不能通用,并且都存在一些缺陷,为进一步优化聚类算法,便可以借助一些其他的方法将两者结合达到优化算法的目的,提高聚类分析的性能。我国作为农业大国,玉米一直以来都是主要农作物之一,然而随着玉米需求量的增加却没有带来玉米产量的增加,其主要因素便是玉米的病虫害,而玉米螟则是主要的玉米害虫。现阶段我国针对玉米螟的防治手段有化学防治、生物防治和农业防治三种手段,但是都没有针对性,效果不够明显。为了进一步研究不同种类玉米螟的生长发育过程的习性,以达到更好地防治效果。本文提出了玉米螟在寄主和地理位置上存在类别差异的猜想,然后利用已知地理位置和寄主的玉米螟基因数据,采用遗传多样性分析和改进的聚...
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：48 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
玉米螟样本图
温度 时间94℃ 4min94℃ 30s52 ℃ 30s54℃ 30min＋35 个循环72℃ 5min最后 4 ℃下保存 PCR 样品。PCR 产物进行电泳分析并在紫外分光光度仪下观察浓度。PCR 产物电泳条带，见图 2.2。
图 3.1 COI 基因碱基替换拟合图Fig.3.1 Base replacement fitting of COI gene 线性回归分析，见表 3-5。表 3-5 P-Ts 线性回归分析表Table 3-5 P-Ts linear regression analysis table回归分析 残差 总计SS 0.008647139 4.75648E-06 0.008651896MS 0.008647139 3.5763E-08F 241789.8826Significance F 1.1506E-218P-value 0.037309063Multiple R 0.99972508R Square 0.999450238djusted R Square 0.999446104标准误差 0.000189111
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SRAP标记的羊蹄甲不同地理群体遗传多样性分析[J]. 何妙坤,韦雪芬,李焜钊,黄少伟,冯志坚,黄久香. 分子植物育种. 2019(06)
[2]基于多分类支持向量机的优化算法智能推荐系统与实证分析[J]. 崔建双,车梦然. 计算机工程与科学. 2019(01)
[3]玉米螟综合防治技术[J]. 刘明华,黄巧云. 上海农业科技. 2018(06)
[4]国内玉米螟综合防治技术[J]. 周文靖,王建楠,张斯琦,李婷婷,许龙. 中国科技信息. 2018(18)
[5]长江中上游4个鲢群体遗传多样性分析[J]. 陈会娟,刘明典,汪登强,董微微,吕浩,陈大庆,李云. 淡水渔业. 2018(01)
[6]基于核函数支持向量机的植物叶部病害多分类检测方法[J]. 魏丽冉,岳峻,李振波,寇光杰,曲海平. 农业机械学报. 2017(S1)
[7]玉米病虫害防治技术探析[J]. 张桂红. 农民致富之友. 2016(23)
[8]玉米螟的发生特点与综合防治措施[J]. 张菁. 现代农业科技. 2015(19)
[9]改进遗传算法优化模糊均值聚类中心的图像分割[J]. 董倩. 吉林大学学报(理学版). 2015(04)
[10]浅析玉米病虫害综合防治技术[J]. 玛丽也木·赛都拉,哈力克子·吾甫尔,热比汗·艾力. 农业与技术. 2014(11)
博士论文
[1]氟苯虫酰胺和NK130102对亚洲玉米螟的分子作用机理研究[D]. 崔丽.中国农业科学院 2014
[2]基于支持向量机的聚类及文本分类研究[D]. 平源.北京邮电大学 2012
[3]中国地方鹅种遗传资源多样性与分类地位的研究[D]. 杜文兴.南京农业大学 2011
硕士论文
[1]基于GA优化的核模糊C均值聚类算法的研究[D]. 黄白梅.武汉科技大学 2013
[2]国家重点保护植物金毛狗（Cibotium barometz （Linn.）J.Sm.）遗传多样性的ISSR和SRAP研究[D]. 由永飞.西南大学 2012
[3]海南省剑叶龙血树种群生境调查及其ISSR遗传多样性分析[D]. 杨松.海南大学 2012
[4]分子连接性指数计算软件制作及应用[D]. 单俐经.华东理工大学 2011
[5]基因数据聚类分析研究[D]. 张白妮.湖南大学 2005
本文编号：2901052
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：48 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
玉米螟样本图
温度 时间94℃ 4min94℃ 30s52 ℃ 30s54℃ 30min＋35 个循环72℃ 5min最后 4 ℃下保存 PCR 样品。PCR 产物进行电泳分析并在紫外分光光度仪下观察浓度。PCR 产物电泳条带，见图 2.2。
图 3.1 COI 基因碱基替换拟合图Fig.3.1 Base replacement fitting of COI gene 线性回归分析，见表 3-5。表 3-5 P-Ts 线性回归分析表Table 3-5 P-Ts linear regression analysis table回归分析 残差 总计SS 0.008647139 4.75648E-06 0.008651896MS 0.008647139 3.5763E-08F 241789.8826Significance F 1.1506E-218P-value 0.037309063Multiple R 0.99972508R Square 0.999450238djusted R Square 0.999446104标准误差 0.000189111
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SRAP标记的羊蹄甲不同地理群体遗传多样性分析[J]. 何妙坤,韦雪芬,李焜钊,黄少伟,冯志坚,黄久香. 分子植物育种. 2019(06)
[2]基于多分类支持向量机的优化算法智能推荐系统与实证分析[J]. 崔建双,车梦然. 计算机工程与科学. 2019(01)
[3]玉米螟综合防治技术[J]. 刘明华,黄巧云. 上海农业科技. 2018(06)
[4]国内玉米螟综合防治技术[J]. 周文靖,王建楠,张斯琦,李婷婷,许龙. 中国科技信息. 2018(18)
[5]长江中上游4个鲢群体遗传多样性分析[J]. 陈会娟,刘明典,汪登强,董微微,吕浩,陈大庆,李云. 淡水渔业. 2018(01)
[6]基于核函数支持向量机的植物叶部病害多分类检测方法[J]. 魏丽冉,岳峻,李振波,寇光杰,曲海平. 农业机械学报. 2017(S1)
[7]玉米病虫害防治技术探析[J]. 张桂红. 农民致富之友. 2016(23)
[8]玉米螟的发生特点与综合防治措施[J]. 张菁. 现代农业科技. 2015(19)
[9]改进遗传算法优化模糊均值聚类中心的图像分割[J]. 董倩. 吉林大学学报(理学版). 2015(04)
[10]浅析玉米病虫害综合防治技术[J]. 玛丽也木·赛都拉,哈力克子·吾甫尔,热比汗·艾力. 农业与技术. 2014(11)
博士论文
[1]氟苯虫酰胺和NK130102对亚洲玉米螟的分子作用机理研究[D]. 崔丽.中国农业科学院 2014
[2]基于支持向量机的聚类及文本分类研究[D]. 平源.北京邮电大学 2012
[3]中国地方鹅种遗传资源多样性与分类地位的研究[D]. 杜文兴.南京农业大学 2011
硕士论文
[1]基于GA优化的核模糊C均值聚类算法的研究[D]. 黄白梅.武汉科技大学 2013
[2]国家重点保护植物金毛狗（Cibotium barometz （Linn.）J.Sm.）遗传多样性的ISSR和SRAP研究[D]. 由永飞.西南大学 2012
[3]海南省剑叶龙血树种群生境调查及其ISSR遗传多样性分析[D]. 杨松.海南大学 2012
[4]分子连接性指数计算软件制作及应用[D]. 单俐经.华东理工大学 2011
[5]基因数据聚类分析研究[D]. 张白妮.湖南大学 2005
本文编号：2901052
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