山东省辣椒病毒病病原的检测鉴定及BWYV和CABYV的序列分析

发布时间：2020-11-21 08:03

　　 辣椒是一种重要的蔬菜,山东省是我国重要的辣椒产区之一。近年来,辣椒种植面积逐年增加,病毒病发生日益严重,辣椒产量和品质均受到影响,造成重大的经济损失,制约辣椒产业的发展。为了进一步明确侵染山东省辣(甜)椒的病毒种类以及病毒的发生分布情况,本研究运用分子生物学方法,利用14种病毒的特异性引物对采自山东省济宁、潍坊、聊城、泰安、烟台、德州和淄博等7个地区的542份辣(甜)椒样品进行病毒的检测与鉴定,并对甜菜西方黄化病毒(Beet western yellows virus,BWYV)和南瓜蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)的全基因组序列进行克隆测序及分析。分别将这两种病毒的全基因组序列与相应的病毒序列进行比对,并分别对其全基因组核苷酸序列进行了相似性分析和系统进化分析,利用RDP 4软件对BWYV和CABYV分离物进行RNA重组分析。主要研究结果如下:1.2016-2017年,对542份辣(甜)椒样品进行14种病毒检测,共检测出5种病毒,分别是BWYV、CABYV、辣椒脉黄化病毒(Pepper vein yellows virus,PeVYV)、辣椒潜隐病毒1(Pepper cryptic virus 1,PCV-1)和辣椒潜隐病毒2(Pepper cryptic virus 2,PCV-2)。其中甜瓜蚜传黄化病毒(Melon aphid-borne yellows virus,MABYV)、番茄斑萎病毒(Tomato spot wilt virus,TSWV)、南方番茄病毒(Southern tomato virus,STV)、辣椒环斑病毒(Chilli ring spot virus,ChiRSV)、番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)、葫芦蚜传黄化病毒(Pepo aphid-borne yellows virus,PABYV)、丝瓜蚜传黄化病毒(Suakwa aphid-borne yellows virus,SABYV)、花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)和番茄坏死矮化病毒(Tomato necrotic stunt virus,ToNStV)未检测到。2016-2017年,病毒检出率为63.65%,其中2016年病毒检出率为64.18%,2017年病毒检出率为60.92%。在检出的病毒中,PCV-1病毒检出率最高,达32.84%,其次是PCV-2、BWYV和PeVYV,检出率分别是31.73%、31.32%、7.75%,CABYV检出率最低为0.37%。2.在检测的542份样品中,存在病毒的复合侵染现象,病毒的复合侵染率为31.30%。主要存在2种和3种病毒的复合侵染类型,其中以2种病毒的复合侵染类型为主,复合侵染率为92.59%,3种病毒复合侵染率为7.41%。3.分别从济宁和潍坊两地在2016年和2017年采集的感染BWYV的辣椒样品中各选取一个进行BWYV全基因组序列扩增,得到4条BWYV的全基因组序列,长为5693-5699 bp。对CABYV进行全基因组序列扩增,结果显示CABYV的全基因组序列长为5684 bp。4.分别对BWYV和CABYV的全基因组核苷酸序列进行相似性分析和系统进化树分析,结果表明:4个BWYV山东分离物聚类在一个分支上,与中国和韩国分离物聚类在一个分支上,亲缘关系较近。BWYV在进化上可能与地理位置有关,与寄主无明显关系。CABYV-LJ3与中国、韩国和日本分离物聚类在一个分支上,亲缘关系较近,该病毒在进化上可能与地理位置有关,与寄主无关。分别对BWYV和CABYV进行重组分析,结果表明:BWYV-JN16311与BWYV-WF1793分离物之间存在重组现象。CABYV-LJ3分离物与中国分离物(GQ221223)存在重组现象,与中国分离物(HQ439023)存在潜在重组。
【学位单位】：山东农业大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：S432.41
【部分图文】：

图 1-3 CABYV 侵染瓜类作物的症状（Suveditha et al., 2017）Fig. 1-3 The symptoms of CABYV in melon crops (Suveditha et al., 2017).1.1.3 辣椒脉黄化病毒

图 1-4 PeVYV 基因组结构（Regenmortel et al., 2000）Fig. 1-4 Genomic structure of PeVYV (Regenmortel et al., 2000)

图 1-5 PeVYV 侵染辣椒的症状（Tomassoli et al., 2016）Fig. 1-5 The symptoms of PeVYV in pepper (Tomassoli et al., 2016)属
【参考文献】

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1 汤亚飞;何自福;;广东辣椒上首次检测到西瓜银斑驳病毒[J];园艺学报;2015年11期

2 赵汝娜;王蓉;师迎春;张桂娟;原锴;范在丰;周涛;;侵染甜椒的番茄褪绿病毒的分子鉴定[J];植物保护;2014年01期

3 陈青;廖富荣;陈红运;谢毅璇;陈加福;蔡金镭;林石明;;辣椒上烟草轻型绿花叶病毒的鉴定[J];植物病理学报;2013年06期

4 丁英娜;李世访;张升;崔元玗;杨华;何伟;孙晓军;;新疆番茄黄化曲叶病毒检测及其DNA-A基因组序列分析[J];植物保护;2013年03期

5 姚玉荣;陈国华;冯兰香;谢丙炎;;北运蔬菜基地辣椒病毒病病原种类的分子检测[J];中国蔬菜;2013年10期

6 李飞;吴青君;徐宝云;谢文;王少丽;张友军;;北京地区发现番茄斑萎病毒[J];植物保护;2012年06期

7 闵信荣;黄彩彬;陈宝玉;;辣椒病毒病的发生与无公害防治技术[J];植物医生;2011年02期

8 刘勇;李媛媛;吴竹妍;饶雪琴;;广州辣椒上番茄斑萎病毒属病毒的鉴定[J];植物保护学报;2010年04期

9 朱春晖;;辣椒病毒病的识别、检测与防治技术[J];长江蔬菜;2010年01期

10 林燕春;罗明云;林江;黄运萍;章富忠;;辣椒病毒病发生规律与防治技术研究[J];湖北农业科学;2009年09期

本文编号：2892774