向日葵锈病抗性相关MicroRNA的挖掘及表达载体的构建

发布时间:2024-07-06 12:18
  由柄锈菌(Puccinia helianthi Schw.)引起的向日葵锈病是发生在向日葵上重要的真菌病害之一,严重时会影响品质及含油量。MicroRNA(miRNA)是植物体内普遍存在的一种非编码单链小RNA,参与调控植物生长发育及多种逆境胁迫响应。针对向日葵抗病相关miRNA这一研究的空白,本试验构建锈病胁迫下向日葵small RNA文库,通过Solexa高通量测序及生物信息学分析筛选与抗病显著相关的miRNA;利用实时荧光定量(qRT-PCR)技术对10个抗病相关的miRNA进行定量验证,并利用miRanda软件进行靶基因预测;挑选其中的4个抗病相关的miRNA构建miRNA的植物表达载体。这为深入研究向日葵miRNA抗病分子机制及进一步研究向日葵抗病相关miRNA的功能奠定基础。主要研究结果如下:1.用高通量测序技术预测分析了向日葵miRNA,在其全基因组中共发现了 378个miRNA,其中373个是新发现的miRNA,新预测的miRNA中有13个miRNA是对照组(A)、抗病组(B)、感病组(C)三组材料中差异表达的。样品A和样品B之间共有8个差异表达基因,样品B和样品C之间...

【文章页数】:64 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1文库构建原理图??Fig.?1?The?principle?diagram?of?library?construction??

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下向日葵small?RNA文库构建及Solexa高通量测序??2.4.1文库构建及测序??检测向日葵对照和病害处理叶片的总RNA,质量合格后用small?RNA?Sample??Pre?Kit来构建其文库,以总RNA为起始样品,small?RNA的3’端加上接头,添??加反转录引....


图2向日蔡对照和病害胁迫下clean?reads和miRNA的长度分布??

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wn?2021837?1655254?1815552?88.17?87.62?87.53??ncRNA?5888?5072?79899?26?0.27?3.86??clean?reads?2293135?1891446?2073359?100?100?100??3.2向日葵抗病相....


图3向日葵已知和新预测miRNA各位点的碱基分布图??

图3向日葵已知和新预测miRNA各位点的碱基分布图??

?向日葵锈病抗性相关MicroRNA的挖掘及表达载体的构建???3.2.2基于miRNA成熟序列的碱基偏好性筛选??因为植物miRNA的前体在细胞核中形成,然后运输到细胞质中,由DCL1??酶酶切处理后,形成成熟的miRNAs,这种酶切位点的特异性使得miRNA序列??首位对U具....


图5向日葵叶片的总RNA凝胶电泳??Fi.5?Total?RNAel?electrohoresis?of?sunflower?leaves??

图5向日葵叶片的总RNA凝胶电泳??Fi.5?Total?RNAel?electrohoresis?of?sunflower?leaves??

蒙古农业大学硕士学位论文???接上表9???31?Nucleotide?excision?repair?0.28426?ko03420??32?mRNA?surveillance?pathway?0.29605?ko03015??33?Endocytosis?0.40746?ko....



本文编号:4002542

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