梨火疫病菌活菌快速定量检测方法的建立
发布时间:2021-02-23 00:46
【目的】将叠氮溴化丙啶(PMA)与实时荧光定量PCR技术(qPCR)相结合,建立一种快速检测梨火疫病菌活菌的方法,为病害的检疫和早期诊断,开展病原学、流行规律研究及制定科学防控措施严防病害入侵提供技术支持。【方法】以梨火疫病菌(Erwinia amylovora)质粒pEA29设计特异性引物EaP29F1/EaP29R1,通过优化PMA的质量浓度和曝光时间,确定区分梨火疫病菌死活菌的PMA预处理最优反应条件,再以活菌DNA为模板进行qPCR的特异性扩增。设置不同比例死活菌混合体系,验证PMA-qPCR反应的可靠性。【结果】当梨火疫病菌浓度为1×108CFU·mL-1、PMA浓度为25μmol·L-1、曝光时间为10 min时,能完全抑制死菌的扩增,仅以活菌体DNA为靶标进行选择性扩增。当活菌比例为10%~100%时(浓度为6.0×107~6.0×108CFU·mL-1),PMA-qPCR测得的活菌数与理论活菌数值均在同一个数量级,二者存在良好的线性关系(R...
【文章来源】:果树学报. 2020,37(09)北大核心
【文章页数】:9 页
【文章目录】:
1 材料和方法
1.1 供试材料
1.1.1 供试菌株和培养基
1.1.2 供试植物
1.1.3 主要试剂和设备
1.2 梨火疫病菌死菌和活菌菌悬液的制备
1.3 梨火疫病菌q PCR检测引物及特异性验证
1.4 PMA处理反应条件的优化
1.4.1 PMA浓度的优化
1.4.2 PMA曝光时间的优化
1.5 PMA-q PCR对E.amylovora死活菌混合液的检测
1.6 PMA-q PCR标准曲线的建立和灵敏度检测
1.7 果树枝条病样的PMA-q PCR检测
1.8 数据分析
2 结果与分析
2.1 利用梨火疫病菌q PCR检测引物对Ea P29F1/Ea P29R1的特异性验证
2.2 PMA处理反应条件的优化
2.2.1 抑制E.amylovora死菌扩增的最佳PMA浓度
2.2.2 PMA曝光时间的的优化
2.3 PMA-q PCR检测E.amylovora的标准曲线及灵敏度
2.4 PMA-q PCR对E.a死活菌混合液的检测
2.5 果树枝条样品中E.a的PMA-q PCR检测
3 讨论
本文编号:3046779
【文章来源】:果树学报. 2020,37(09)北大核心
【文章页数】:9 页
【文章目录】:
1 材料和方法
1.1 供试材料
1.1.1 供试菌株和培养基
1.1.2 供试植物
1.1.3 主要试剂和设备
1.2 梨火疫病菌死菌和活菌菌悬液的制备
1.3 梨火疫病菌q PCR检测引物及特异性验证
1.4 PMA处理反应条件的优化
1.4.1 PMA浓度的优化
1.4.2 PMA曝光时间的优化
1.5 PMA-q PCR对E.amylovora死活菌混合液的检测
1.6 PMA-q PCR标准曲线的建立和灵敏度检测
1.7 果树枝条病样的PMA-q PCR检测
1.8 数据分析
2 结果与分析
2.1 利用梨火疫病菌q PCR检测引物对Ea P29F1/Ea P29R1的特异性验证
2.2 PMA处理反应条件的优化
2.2.1 抑制E.amylovora死菌扩增的最佳PMA浓度
2.2.2 PMA曝光时间的的优化
2.3 PMA-q PCR检测E.amylovora的标准曲线及灵敏度
2.4 PMA-q PCR对E.a死活菌混合液的检测
2.5 果树枝条样品中E.a的PMA-q PCR检测
3 讨论
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